FastQCFastQC Report
Tue 11 Sep 2018
H55FTAFXY_n01_p7G4.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameH55FTAFXY_n01_p7G4.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences15
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC53

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGTTCGAGTGTGAGCATGCCTGTCGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGT16.666666666666667No Hit
GTATTGCTAGTTTGATTTTTCCTGCGCCTAGATGCTCTCAAATTCCTGAG16.666666666666667No Hit
AACGGCACCCCATGGGGTACGGCGTTACGAGGGGCTCGAGCGTGATCGTC16.666666666666667No Hit
AACATCCGCTGATCCCTGGTCGGCATCGTTTATGGTTGAGACTAGGACGG16.666666666666667No Hit
TTTTTGCCAGAGCCCGGTAATCGCATAAAACTTAAAACTTACAGTCAGAG16.666666666666667No Hit
GCCATTGGTGTTAAGAAGAGGAATTGAACCTCTGACTGTAAGTTTTAAGT16.666666666666667No Hit
GACGTGTGCTCTTCCGATCTGCAGTGGAGACGTGTGCTCTTCCGATCTGC16.666666666666667Illumina Multiplexing PCR Primer 2.01 (95% over 22bp)
CGATTGGGGCTGCATTCCCAAACAACCCGACTCGTAGACAGCGCCTCGTG16.666666666666667No Hit
TCAATGGGGAGACGTGTGCTCTTCCGATCTCAATGGGGAGCCGTGTGCTG16.666666666666667Illumina Multiplexing PCR Primer 2.01 (100% over 21bp)
GTATTAGCTTGGGCGCAGCTATCATGAATAAACTAGTGCAAACTGCACTC16.666666666666667No Hit
TCTCATAAGGTGCCAGCGGAGTCATATAAGCAACATCCGCTGATCCCTGG16.666666666666667No Hit
GCACACGTCTCCCCCGGTTAAGATCGGAGAGCACACGTCTACCAGCGAAG16.666666666666667No Hit
GATCTGACGTGTGCTCTTCCGATCTTTCAAGGGAGACGTGTGCTCTTGCG16.666666666666667No Hit
CCGTAACCCGGCTTCCGGTTCATCCCGCATCGCCAGTTCTGCTTACCAAA16.666666666666667No Hit
CATCATAGGATTTCGATCCTATTGTGTTGGCCTTCGGGATCGGAGTAATG16.666666666666667No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.5)