FastQCFastQC Report
Tue 11 Sep 2018
H55FTAFXY_n01_p7G12.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameH55FTAFXY_n01_p7G12.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences60
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC47

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
ATACTGACGTGCAAATCGTTCGTCTGACTTGGGTATAGGGGCGAAAGACT23.3333333333333335No Hit
ATCTCGTTGTAAGTAATCCTTCGACCCCGACTGGACCACGAGCATGGATC11.6666666666666667No Hit
AATATCCGGAATCTACAAATAACTTAAACAAACTTACAAGAAAAAAAAAA11.6666666666666667No Hit
GGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGG11.6666666666666667No Hit
CTCCTTAGCGGATTTCGACTTCCATGACCACCGTCCTGCTGTCTTAATCG11.6666666666666667No Hit
AAGTTAACATTACTCATTTGAAAAAGGATATACCTGGAATAAACTTTGAA11.6666666666666667No Hit
GGATTATAGAAGCTCGTCCATCCTGTGGTCCTTTATCGACTTGGAATTGG11.6666666666666667No Hit
TCCATTTTCGGGGCTAGTTGATTCGGCAGGTGAGTTGTTACACACTCCTT11.6666666666666667No Hit
TCAATAAGCGGAGGAAAAGAAACTAACAAGGATTCCCTTAGTACTGTCTC11.6666666666666667No Hit
TATTTTCCTATTGGACTAGTCATTTTATCATTATATAATGTCCCTCTTTG11.6666666666666667No Hit
GGTTAGTCGATCCTAAGAGTCGGGGGAAACCCGTCTGATAGCGCTTAAGC11.6666666666666667No Hit
TCTGTCAACATTTGAAAGTTGCTGCTATTGTTACTAAAATTAAATACAAC11.6666666666666667No Hit
TTCCACCACTGTCAAGAGCCATTATAGGTGGAACAGCAGCTATAAAATAC11.6666666666666667No Hit
CTTCCGATCTCCGCTGGGCCCTACCTCCGGCTGAGCCGTTTCCAGGGTGG11.6666666666666667No Hit
GGGAAAACCCGTCTGATAGCGCTTAAGCGCGAACTTCGAAAGGGGATCCG11.6666666666666667No Hit
GTCTAGTTTTTATTTGAAGATATTTCCTTTCTCACCATAGACCTGAAAGC11.6666666666666667No Hit
CTCAAACTCCTGGGCTCAAGTGATTCTCCCATGCCAGCTTCTGCAAGTGC11.6666666666666667No Hit
CTCGTAGACAGCGCCTCGTGGTGCGACAGGGTCCGGGCACGACGGGGCTC11.6666666666666667No Hit
GAGTAAGTAAAATAACGTTAAAAGTAGTGGTATTTCACTTGCGCCGAAGC11.6666666666666667No Hit
CTTTTTTTCTTACATGTCTATTTATTAAACAGGAGTTCCTTCATGACAAT11.6666666666666667No Hit
GTAAATTCCGTCCAAGGCTAAATACGGGCGAGAGACCGATAGCGAACAAG11.6666666666666667No Hit
GCCAGAGGAAACTCTGGTGGAAGCCCGCAGCGATACTGACGTGCAAATCG11.6666666666666667No Hit
CTATCAGACGGGTTTCCCCCGACTCTTAGGATCGACTAACCCATGTGCAA11.6666666666666667No Hit
CTCTTATCCAAACTTATTACCTCCAGCTGTGAATAAATCCAGCTTCTTTG11.6666666666666667No Hit
AACCGGAAGCCGGGTTACGGTGCCCAACTGCGCGCTAACCTAGAACCCAC11.6666666666666667No Hit
GCCCGGAGCACGCTGATGCCGAGGCACGCCGTTAGGCGCGTGCTGCAGAC11.6666666666666667No Hit
CCTTCAGTTCCCTTCTTTTGCTGACAGGCTTGAAACCGCTGTGAAGCGTG11.6666666666666667No Hit
CCCTAACGTTGCCGTCAACCGCCACGTCCCGGTTCCGGAATTTTAACCGG11.6666666666666667No Hit
CATTTGGATGGGTTCCAAGTCTTTGCTATTGTGAATAGTGCCACAATAAC11.6666666666666667No Hit
CTTTCACAACGAGGGTAGTGTCAGAAGCTTCGGTCTTGTAATAGACCCTT11.6666666666666667No Hit
CTATAGGACCACGGAGGAGATTATCAGAGTAAGAATGCTGTCTTTTGCTC11.6666666666666667No Hit
GTAGCTACCTGGGGAGATATTTCACCTTTTTATCTGTAGCGCTCTGCTTA11.6666666666666667No Hit
TAGTAACACATAGGAGGTTGAGGTTTGCAAATTTTTTTTCTCCCTTCTTT11.6666666666666667No Hit
CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATTCCCAGCCCACAGTT11.6666666666666667No Hit
GGCGGACCCATTTGCAAGTTCCTTTCACATGGAACATTTCCCATCTTCGG11.6666666666666667No Hit
GGGCTGGGGTTACAGGCATGAGACACCATGCCTGGCCAAAGGTTTGTAAT11.6666666666666667No Hit
GTATTAAAGTTACACAAGTAGTACAGAGATGAAACACAAATGATTCAGGT11.6666666666666667No Hit
AGCCTGGGAGGTGGAAGTTGCGGTGAGCTGAGATGGCACCACTGCACACC11.6666666666666667No Hit
CAGTTCCGTTGCTTGAAAGAGGCGATCGCTGGTCAGATAAAAGCGGCCAA11.6666666666666667No Hit
ACTTAGAGTATAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAATTGT11.6666666666666667No Hit
CGCTTTGGCCCTACCTACGGCTGAGCCGGGTCCAGGGTGGGCCGGCTGTT11.6666666666666667No Hit
TACATGGTTTGTGCCAGATTCAGCTTGCTCACAGGTGGGAGAACACCAAA11.6666666666666667No Hit
TCTGAGAAGGGTTCGAGTGTGAGCATGCCTGTCGGGACTCGAAAGATGGT11.6666666666666667No Hit
TTGAGAGATGTGCATCGTAGCCATCAAGAACACCCGCAAGCTTCTCTTCA11.6666666666666667No Hit
CCTTTGGACCCCGCGTGCTTGCCCTGGGCCTGATGAAAGCCTGATAGTTT11.6666666666666667No Hit
GAATAAGGATTTTTTAAGTACCACGAGTAAGTAGAATTATAACAGAAATT11.6666666666666667No Hit
CTCCTACTCATCGAGGCCTGGCTCTTGCCCCGACGGCCGGGTATAGGTCG11.6666666666666667No Hit
AAAGTAGAGGCTAACTCCAGGCTTTCCAAACAGAGCCCTGAGCAAGGGAA11.6666666666666667No Hit
ATTACAGTATTATAATATTCTTTGTTTTTCGGTGTGCTTACTATTCCCAG11.6666666666666667No Hit
GTCTACGGCGCACTCATCATTCACCCAACCCCTGGTTCCTCTTTTCCTTT11.6666666666666667No Hit
GTAGTCCGCCACCTGGCGAATGGCCTCGAGGCTAACCCCCTCCTTGGGAT11.6666666666666667No Hit
GCTTTTTTTTCCAGGATCCCCAGGTGATTCCTGTGCACATACAATTTTGA11.6666666666666667No Hit
CCTCTCACCTCAGCCTCCAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATTCCAGCG11.6666666666666667No Hit
TTGTTACACACTCCTTAGCGGATTTCGACTTCCATGACCACCGTCCTGCT11.6666666666666667No Hit
CTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATATGGGCCTGTGTTACTTC11.6666666666666667No Hit
GTTCAATGATGAATAAGAGTAGTTTCGGTATCAATGACATCAGTTGGAAT11.6666666666666667No Hit
GTGGAGGGAGAGCCAGCAAAGAAGATGGAGAAAGAATAGCTAAAGAGGTA11.6666666666666667No Hit
ATCTATTGCTATATAGCTAACTATCTCAAAGTGTAGTGGTTTAAGACAAA11.6666666666666667No Hit
GTGCTCTTCCGATCTGGGCTGGGGAAATTCTATTACCAAATAGCTTAATG11.6666666666666667No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

[FAIL]Kmer Content

Kmer graph

SequenceCountPValueObs/Exp MaxMax Obs/Exp Position
ATCTCCG50.0145.07
TTCCGAT50.0145.02
CGGAATT50.0145.0145
GATCTCC50.0145.06
TCTCCGC50.0145.08
TCCGATC50.0145.03
CCGATCT50.0145.04
CTTCCGA50.0145.01
CTCCGCT50.0145.09
CGATCTC50.0145.05