FastQCFastQC Report
Tue 11 Sep 2018
H55FTAFXY_n01_p7C10.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameH55FTAFXY_n01_p7C10.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences75
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC46

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
ACATTACCAAGCGACAAAAGAGTAACACCAGCAACAGTTGGTGACAAATT11.3333333333333335No Hit
TGTATCCAGAGCGTAGGCTTGCTTTGAGCACTCTAATTTCTTCAAAGTAA11.3333333333333335No Hit
GTACAATACATATAATATCACCTATTAACATGCATCTCCCTGTCTCTTAT11.3333333333333335No Hit
TCATATGACTGTTAGTCAAAGACTATTGACCATCACTAGATTGGAGATTA11.3333333333333335No Hit
GTCAGAGTTGAAATTCTTGGATTTATGAAAGACGACCAACTGCGAACGCA11.3333333333333335No Hit
GCCATAGGTGTTAAGAAGAGGAATTAAACCTCAGACTCTAAAGTATTAAT11.3333333333333335No Hit
TTTCCAGGGTGGGCAGGCTGTTAAACAGAAAAGATAACTCTTCCCGAGCC11.3333333333333335No Hit
TCAAACGCTCTACTGAAATAGATTTCGCGGAAAACCAGCTATATCCGATC11.3333333333333335No Hit
ATACATACATGAACCAGAAGATCACTCTACTTACGGCGATTCCTCAGACG11.3333333333333335No Hit
TGGTAGGCCACTATCCTACCATCGAAAGTTGATAGGGCAGAAATTTGAAT11.3333333333333335No Hit
CTTCTACGGGTTCGCTACCTATGGAAACGCTGGCTTCATGCGAGATCGGA11.3333333333333335No Hit
CAGGGAGACGTGTGCTCTTCCGATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT11.3333333333333335Illumina Multiplexing PCR Primer 2.01 (95% over 22bp)
CAACATAGATAATTAAAACATAATACTCCACGACAAACCTCTCTCCCCCA11.3333333333333335No Hit
ATACAGAATCAAACTGGGATCCAAAAACAATTTAAAACAAAGATGGAAAC11.3333333333333335No Hit
CATAGCGACGTTGCTTTTTGATCCTTCGATGTCGGCTCTTCCTATCATTG11.3333333333333335No Hit
CTCCAACACTAAAATAATTGTACCGAAACTCTCACTCTCTCTCTCCGTAA11.3333333333333335No Hit
CAAAAAGGCAGTGATCATCAAATCCTTCGATGAATGAACCAGTGACCGAC11.3333333333333335No Hit
AACGAGTACGTTTGCTCCAAGTGGTGATGATGAATATCTTGATGGTCAAC11.3333333333333335No Hit
ATCCCAGTCAGACCCCCGGGCGCCACGCCGCGAACCGCTCTCAGCGCGGT11.3333333333333335No Hit
CCATTGATAACGTGAAGGCTAAGATCCAGGACAAGGAAGGCATTCCTCCG11.3333333333333335No Hit
CAATTATATGTAATGTGACAGAAGTAGCTTTTTGTTTTTACCAGCGGCAT11.3333333333333335No Hit
GAAACGAGAGCTCCAAGTGGGACATTTTTGGAAAGCAGAACTCGAGATGA11.3333333333333335No Hit
TATAAATACCACCCACACCACGAGTTTCAACACAGCAGATTCTAACTCCC11.3333333333333335No Hit
AACCTGTACAAGCCAGTGGCGATCCTAACATTGTAGAAGTTGATAGCATT11.3333333333333335No Hit
GTGCTCTTCCGATCTCGCTGGGGAGTTTGGCTGGGGCGGCACATCTGTTA11.3333333333333335No Hit
GGCATGAAGTCGAAAACCCACTCGGGTATAGAATCAGGCATCACATAGAA11.3333333333333335No Hit
CATCCGTACCACGCACAACGTCTGTTTCCGTATCGACAAACGCCAAGGTC11.3333333333333335No Hit
TCACGGATGCGGAAAAGTTGTCGACGGTGACTCGAAGTGATTCAGTCCCG11.3333333333333335No Hit
CTAATTATCTTTGGGTTAAAAATCTTTTACATTAGGAATTGCATCCATAA11.3333333333333335No Hit
CTCGTAGACAGCGCCTCGTGGTGCGACAGGGTCCGGGCACGACGGGGCTC11.3333333333333335No Hit
CTCCTTAGCGGATTTCGACTTCCATCACCACCGTCATGCTGTCTTAATCG11.3333333333333335No Hit
GTCATATAAGCAACAACCGCAGAACCCTGCTCGGCATAGTTTATGGTCTG11.3333333333333335No Hit
GTCAAAGAGTGCTTGAAATTGTCGGGAGGGAAGCGGATGGGGGCCGGCGA11.3333333333333335No Hit
AGTTAACACCATCCACTTCACTCAAAGCCATTTGCAGTGTAACTCGTATC11.3333333333333335No Hit
AACCTCATCAATCAACAACAAAATAAAACAAACTGATCATAAAACACTGA11.3333333333333335No Hit
GCTGTGACAGTTGTCGCAGGTAATGGCGTATCTGCCTCCGTCTCTAACCA11.3333333333333335No Hit
CCGTAACCCGGCTTCCGGTTCATCCGGCATCGCCAGTTCTGCTTACCAAA11.3333333333333335No Hit
GATCTGCATACCACCACGGAGACGAAGCACAAGATGAAGTGTCGACTCCT11.3333333333333335No Hit
GCCTTGGGATGGGTCGGCCGGTCCGCCATTGGTGTGCATTGGTCGGCTTT11.3333333333333335No Hit
ATATGCGACAATCCTGTTCTAGTACAAGATGGCGGTAAGAGATTCTTCTA11.3333333333333335No Hit
GCGTTCCAGTTTGACCATGCCTGTCCGGACCCGAAAGATTCTGAACCAGT11.3333333333333335No Hit
ATATGAACTTTTAATCAAATCAAGATTAACTATTGCTTAGGAGTACAAGA11.3333333333333335No Hit
TATAAATAAGCGGACGAAAAGAAACTAACAAGGAATCCCTTAGAAACGGA11.3333333333333335No Hit
GGTATAAACTGTGTACGACAAAGTGGACACGTCATCTGATTATAACCCAT11.3333333333333335No Hit
CCGTTAGGCGCGTGCTGCAGACCACGATCACGGCAGCGACGTCTCCACAA11.3333333333333335No Hit
ACTTAGAGGCGTTCAGTCATAATCCAGCGCACGGTAGCTTCGCGCCACTG11.3333333333333335No Hit
AGATACGCTAACCGGGGCGCTTACACTTAGTTTGAAAGACGTTACGTTGG11.3333333333333335No Hit
CATAGCACGACACAAACTAACCCACATATACATATATTAGAACAAACTCT11.3333333333333335No Hit
GCTTAAACTCAGCGGGTAATCCCGCCTGACCTGGGGTCGCTATATGGACT11.3333333333333335No Hit
ACCTTAATATAATCATAGTTAATACATCAAATTAACAGCGCATGATTCAA11.3333333333333335No Hit
TTTGGGATATTCCTTTACGAGCTTCTCTTTGGGAGAACGCCCTTCAAGGG11.3333333333333335No Hit
AGAAAGAGCTCTCAGTCTGTCAATCCTTACTATGTCTGGACCTGGTAAGT11.3333333333333335No Hit
GTGTATAAGAAAGCTTTCCTTGCAACTTTCAGCGATTGGAATCATCACGG11.3333333333333335No Hit
GAATAACTACAAGATTTACAATTACTGTACGGACGCTAAAAGGTTCCCTC11.3333333333333335No Hit
GGGTGTTTCTCCCTGTTGAGAAGCTTTTGAAGGATTTTTTGTTATGGGTT11.3333333333333335No Hit
GTCCATTTGTTCTTAAGCAATTAGTATAGACACATCCTGGTGGTGCAATA11.3333333333333335No Hit
GATTTAGGCCAACCGCGTGCGGTAACACACGGGAGACCAGCTTCCGTCCC11.3333333333333335No Hit
CTCCCATGGCAGATCGGAAGAGCACACGTCTCCCTTGGCAGATCGGAAGA11.3333333333333335Illumina Multiplexing PCR Primer 2.01 (95% over 21bp)
AGACAGGGTCCGGGCACGACTGGCCTCTCACCCTCTCTGGCGACCCTTTC11.3333333333333335No Hit
GACCCATCCCAAGGTTCAACTACGAGCTTTTTAACTGCAACAACTTAAAT11.3333333333333335No Hit
AGCCTGGATCATCTGAAACAATCGAAATCCCATCTCCTGAGACTGAAGGT11.3333333333333335No Hit
GAGCAAAACATGTCTCACTGCAGCATCGATGTATTCCTTAGTTGGTTGAC11.3333333333333335No Hit
GAAAAGCAGCCTCGACAAAGCATTTGAAAAGACCCGCCACATCACTACTC11.3333333333333335No Hit
ATACGTGGGTTCGGTCCTCCAAGGCCTGTTAGAGCTCTCTTCAACCTGCT11.3333333333333335No Hit
CTAAAACAACACACTCCATCTAAACACTAACTTAACTCTAAATAGATTAA11.3333333333333335No Hit
GCACCTCACTTCAGGTAAGCAATCAGCTCCTCAAAACCAGAGACCAGCCT11.3333333333333335No Hit
GATTAACCTGGTAGGGGAAATCACAAAGCAAGCTTTAAATCTTGAGGATG11.3333333333333335No Hit
ATCAAACACCTAATCATTGTTCCCACTTTCCTCTCAAGACGGCTCCCTAC11.3333333333333335No Hit
GCCATGTACCGATGATAATCACATTTCATCTTCAAGTAAAAGACCTTAGA11.3333333333333335No Hit
GATCTTGATTTCTGCAAAAACACTAAGAATTGGTATTGCTACGGGAAGAT11.3333333333333335No Hit
AAGTATCTAAGAATGAAAAAGAAGTAGAGAAGTTGAAGAGTGAGCTTGAG11.3333333333333335No Hit
AGTCAGAATTAAACACAAGGGTTAAGAGGGCAACGAGAAGGGCATGTGCA11.3333333333333335No Hit
CAAATTCACAGAATAAATAAAAACAAGTATTTGGAACACGCTCAAACTCA11.3333333333333335No Hit
GACCTGGACCACGAGACGAAGTAGGAGTTAAACCAGCGGAAGGACCGGGA11.3333333333333335No Hit
GTCTAATCCCAGCTCACGTTCCCTATTGGTGGGTGAACAATCCAACACTT11.3333333333333335No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

[FAIL]Kmer Content

Kmer graph

SequenceCountPValueObs/Exp MaxMax Obs/Exp Position
GTGTTAA50.0145.08
GAGGAGG50.0145.0145
ATAGGTG50.0145.04
AGGTGTT50.0145.06
TGTTAAG50.0145.09
CATAGGT50.0145.03
CCATAGG50.0145.02
GCCATAG50.0145.01
GGTGTTA50.0145.07
TAGGTGT50.0145.05
Produced by FastQC (version 0.11.5)