FastQCFastQC Report
Tue 11 Sep 2018
H55FTAFXY_n01_p6G6.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameH55FTAFXY_n01_p6G6.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences15
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC41

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CTATAAGCAACATACGCTGATCCATGCTCTTCATCTGGAATGCTTTAGAC16.666666666666667No Hit
AGTTATACCTATATCACATATGCTACATAAACCTCTGTTCCAACTTAGCG16.666666666666667No Hit
ATAAATAACAATACCGGGCTCTTTCGAGTCTGGAAATTGGAATGAGTACA16.666666666666667No Hit
GTTCTACAACTAGAGAGTTGCGGAATAAATGGGATGCCCCAGCTGGATTC16.666666666666667No Hit
CCTTTGTGCCTTCTAGGTTATCTAGAAGATGGTCCCAGTACCCAGGCTTC16.666666666666667No Hit
CATCAATCCATTCAAACTTCACATTTGAATAATAAAAAAAACCAACAACA16.666666666666667No Hit
TGCTTACTCTTAGTGCTGGATTGGAAGGCTACCATGTTAGACTCGATGGG16.666666666666667No Hit
AAATATACGAAATAAGGGAAAGGTTTTTTCAAAACTAGGAAACAAGAAGC16.666666666666667No Hit
GACATATTGTCAAGAAAAATGATGAGATAAACAAGAAAAATCAAGACATC16.666666666666667No Hit
GTTTATCGATGAGACTAGGACCGAATCAGATCGTCTTAGAGCCACAAACT16.666666666666667No Hit
ACAGTAGTCTTGCCGTTGGAGAAACGGCCGGTAGGGCCGCAGAAATCGAT16.666666666666667No Hit
CATCCCGACAATGATATAGACAGTTTGATTCTCGTCATAATCGAAATTAA16.666666666666667No Hit
GTTTCTGAAGATCTTCAATAAAGACTTGCAGCCTCACATCGTCAGGCAAG16.666666666666667No Hit
GAGTTTAATCATAACAATAAGCGCAGGATAATACACTAACAAGTATTCCC16.666666666666667No Hit
CGTTAACGTAGCACCACCTTTCACCGGAGCTGTAAAACTCGACGGATGTT16.666666666666667No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.5)