FastQCFastQC Report
Tue 11 Sep 2018
H55FTAFXY_n01_p6D1.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameH55FTAFXY_n01_p6D1.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences75
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC45

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GACAAAAACACTATTTTCTCAGCTGTTCCTCCTATGTTCCCTACTCCACA11.3333333333333335No Hit
GGTCTAGGCATGATCCCACCACTTTGAATCGCCAGGGAAATGACGAGGGA11.3333333333333335No Hit
CAGTTTCTCTAATCTCTTGAAGCTCTTCAGGAGAAAGAGAAGATATTTCA11.3333333333333335No Hit
CCCATTGTACGTACCAGTTCTGCGCTGACTGTTCGACGCCCGGGGCCAGC11.3333333333333335No Hit
CCAAATACTGTTTCAACTGTGTGCGCAGACCCATGGGTGCGATGCCCGAA11.3333333333333335No Hit
CTATTCTATATGGGAACAGACCAACTCTGGAGTTCCAAAGCTGCAAGAAC11.3333333333333335No Hit
ACGATAACCAAAATACCCTCAACCCAGCACGGAATCGAATATTGTTAAAA11.3333333333333335No Hit
CAGCCAGCGTAGCCTCTGAGTTATGTGGATTCATCACTGTGCTCACAGGG11.3333333333333335No Hit
CTTCTACAATGATCGTCGGTCACCGGAGCGAACTCGCTCTCGCCGGAATC11.3333333333333335No Hit
CTATGCAGCTAAGCACTCTTTAGGAAGACCTTGAGGGAACCTCTTCGCAT11.3333333333333335No Hit
GCCTTGCGACCATACTCCCCCCGGAACCCAAAAACTTTGATTTCTCATAA11.3333333333333335No Hit
TCTCTCTCTCGCGGATTCAGCTGTTCAAGTATGTATGATCACCATGAACA11.3333333333333335No Hit
CTTATGACCATTGACGAAGGTATATTTGAAGTGAAGGCGACTGCAGGAGA11.3333333333333335No Hit
TCTCTGGTGTGCTCATCAAACACAACATTTTCCAAAACTGTTCAAAACTT11.3333333333333335No Hit
AAGGTAGGACGTGTCGGCTGCGTTGTTGAGCCGTCACACGTAATCGACAG11.3333333333333335No Hit
GCATAAGGAAGTACGGAACATATGATCAGACCTCAAGATTCCCGGTAGGA11.3333333333333335No Hit
GTCTAAATCCCTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGACTGGTGCCAGCA11.3333333333333335No Hit
CAATGAAACCAAAAAAAAAAAAAAGCAAAACAGAGCACCCAAGAAACAGA11.3333333333333335No Hit
CTAAAGTTATGTCTTAATTTACTAATATTGTTTGTAGGCGTAAAATTTGG11.3333333333333335No Hit
AATATATACTACTGGAGGCGATATCGAGTAAACTATTCCTTCATATTTGG11.3333333333333335No Hit
TCATTACTCCGATCCCGAAGGCCAACACAATAGGATCGAAATCCTATGAT11.3333333333333335No Hit
CTCATACTACTTCAATATCATTTCATTCACCTCAAAAAATCAGATCCAAA11.3333333333333335No Hit
CCCGAGCCCAGCCCTCAGAGCCAATCCTTATCCCGAAGTTACGGAGCCAT11.3333333333333335No Hit
AGAAAAGTATCTGGCTTAAAGCGGCGCAGCTTGAGAAGCGCCATGGGAGT11.3333333333333335No Hit
ACCCGCGACAAACCAATCAAACTCAATACAAGAATATCTACAATCTCAAG11.3333333333333335No Hit
GGGCACGTAGTGACAATAAATAACAATACCGGGCTCTTTCGAGTCTGGTA11.3333333333333335No Hit
TTTCGGAGCTTATCCTGCGTAGAAGACGAGTGCTTTCTTAATCACTAACG11.3333333333333335No Hit
GGAGGTGTGCGAAGGTAGGCTCAAGCTAAGATTCTGCTCGTGAGCGTAAT11.3333333333333335No Hit
AGATTGAATCCGACACCGTTCACCGCTGAATCATCCACATTGAACTGATT11.3333333333333335No Hit
CTTAAGAAGTTCTTGCAGAAACATTAAAAACACAAACACAAGACTACTTA11.3333333333333335No Hit
GTTGGTCGATTAAGACAGCAGGACGGTGGTCATGGAAGTCGAAATCCGCT11.3333333333333335No Hit
CGTATACTGCGTCTTTTCACTACATGATATCGCTTACACAGAGATCTTTT11.3333333333333335No Hit
GACTTAGCCAACCACACGTGCCTTTGGGAGACTAAGCTCCTACTGAGGGT11.3333333333333335No Hit
AAGTATCCCGCCTGGGGAGTACGTTCGCAAGAAGTGAAACTCAAAGGAAT11.3333333333333335No Hit
GTGGTAGCCGTTACTCAGGCTCCCTCACCCGAATCCAACCCTAATACTCC11.3333333333333335No Hit
AAGGCGGACCGGCCGACCCATCCCAAGGTTCAACTACGAGCTTTTTAACT11.3333333333333335No Hit
AATTTAGAGAATGAATAAAGCGGCATTAGGGTCGCTGACAAAAACTTATT11.3333333333333335No Hit
ACCTAGAACCCACAAAGGGTGTTGGTCGATTAAGACAGCAGGACGGTGGT11.3333333333333335No Hit
TATCAGATTGAATCTTTAGTTCATGCCAGCCAACCAGCCAGGGATGACAC11.3333333333333335No Hit
CAGGAGAAACACACAGATAGAATGATCACAATGCTCAAACACAAGACACC11.3333333333333335No Hit
GCTTTGAGCCCTCTAATTTCTTCAAAGTAACAGCGCCGGAGGCACGACCC11.3333333333333335No Hit
CTTCTAGGTCATTCTATACTTATTTGTGTTAATATTGGCTATACAGTGTC11.3333333333333335No Hit
ACAATACCGGGCTCTTTCGAGTCTGGTAATTGGAATGAGTACAATCTAAA11.3333333333333335No Hit
CTCTAACCACCAAAAAGATCGTCACGAACACCACCAGCCACATCGCTATC11.3333333333333335No Hit
CACATATACAAGACCAAAATCAGCTCCAATCATCTAAACAAGACGCAGCA11.3333333333333335No Hit
ACCTATACCCGGCCGTCGGGGCAAGAGCCAGGCCTCGATGAGTAGGAGGG11.3333333333333335No Hit
GTACGGTAGCAAGAAAGAAGGTCTTCCATGTCTTTCGAAGCTCTGAGGTT11.3333333333333335No Hit
GTTGATAGGGCAGAAATTTGAATGATGCGTCGCCAGCAAAGAGGCCATGC11.3333333333333335No Hit
ATACCGGGCTCTTTCGACTCTGGTAATTGGAATGAGTACAATCTAAATCC11.3333333333333335No Hit
TACAAGCACATTGTTGGAGGCATTGTAGACCACATCAAGGACACTGCTCT11.3333333333333335No Hit
TACCAGGTGGGACTGAAAGGTGAAGCTATGAATCTTGCATTTCCAACCAA11.3333333333333335No Hit
ATCTTTTAACAGATGTGCCGCCCCAGCCAAACTACCCACATGACAATGTC11.3333333333333335No Hit
GGTAAAGGTACAAGAATTCGTTTCTCTAGACGCCGGTTCATAGCTGAATC11.3333333333333335No Hit
TAACAATACCGGGCTCATTCCAGTCTGGAAAATCCAAAGAGTACAATCTA11.3333333333333335No Hit
CAAAAGAACAGACCCTTTCTCTACATAATCTAACACCAGAAGAACTTCTT11.3333333333333335No Hit
CTAATAGTTGTACCAAACTGCGTTATGATTCTAAAAAAATTTAGTCATCA11.3333333333333335No Hit
GCAACAACTTAAATATACGCTATTGGAGCTGGAATTACCGCGGCTGCTGG11.3333333333333335No Hit
ACACAAAAAAGTCAAATAACAAGAGAACAAGAAAAACTATACAGTAAAGA11.3333333333333335No Hit
AATATGAACTGAGATAACTTTTACCAGCCAATATCAAGGATCGTTTTTCA11.3333333333333335No Hit
ATCAAACAGAGTTCGAAAATGGTTGCTTTGAAATCTATAAGAAGAGGGTT11.3333333333333335No Hit
TGTCCGTACCAGTTCTGAGCTGACTGTTCGACGCCCGGGGAAAGCTCCCG11.3333333333333335No Hit
GGTTAGCTTCTCGTACGGGTCGTCACGTTAAAGCATTCAACAAAGGTCCT11.3333333333333335No Hit
GTGCTAATGCATGGCCATCCAACAGACCCCAGTAAATCCCCACGGTGCCA11.3333333333333335No Hit
GCATGAGAAAAAATAATAAAAGAATAGCATTGAGATTATACATCAGCAAC11.3333333333333335No Hit
ACCCTACGCACCCACATCCAAGGAGTTGCAACCGACCAACCCACTCTAAA11.3333333333333335No Hit
CAAACCATGAGGTGCTAAATGAGTAAATTCAGACGAAGAGCACTAGACAA11.3333333333333335No Hit
CGTGCCCAACTGCGCGCTAACCTAGAACACACAAACGGTCTTGGTCGATA11.3333333333333335No Hit
CGAAGCAAATCGAATATCATAATTATCAAGGTCAAACACATCTTGTCAGG11.3333333333333335No Hit
AGGCTCCATCGCCTTAGCTTCCGGTGCCGGTTTCACATCCTTAGACGGCG11.3333333333333335No Hit
CATCCGATCATAACCCGGCTCCAAAACCCTATATTTAACTTCAAGCAGAT11.3333333333333335No Hit
ACCAAAAAGCATCCAAAAGATAATAACGTAGGGCAGATGCAGAGACAAAA11.3333333333333335No Hit
CGCGGATGTGCACGCCTTCCTACAACAGTAACTGCAGCACTTTCAGGAAC11.3333333333333335No Hit
CTTTTCAGACACCTCTAGCTTCAAATTCCGAAGGTCTAAAGGATCGATAG11.3333333333333335No Hit
GGTTACTTACGCCGTGAGGTTGCCTAACGGGAAGGCGAAAGGATCTCTCT11.3333333333333335No Hit
TCTTAATCCACTCGCTAACCTTAGGGCGAGAGTCAAAGAGCACCTTCGAG11.3333333333333335No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

[FAIL]Kmer Content

Kmer graph

SequenceCountPValueObs/Exp MaxMax Obs/Exp Position
CCAACTT50.0145.0145
GCCTTGC50.0145.01
GCGACCA50.0145.06
ACCATAC50.0145.09
TGCGACC50.0145.05
CCTTGCG50.0145.02
CTTGCGA50.0145.03
TTGCGAC50.0145.04
GACCATA50.0145.08
CGACCAT50.0145.07
Produced by FastQC (version 0.11.5)