FastQCFastQC Report
Tue 11 Sep 2018
H55FTAFXY_n01_p6B10.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameH55FTAFXY_n01_p6B10.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences15
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC44

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GCAAAGCGCGGACCAGCTCGAATCATCATGCCCTCGTCATAGAAGTCCCA16.666666666666667No Hit
TGGGTTAGTCGATCCTAAGACTCGGGGGAAACCCGTCTGATAGCGCTTAA16.666666666666667No Hit
ATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTGTTTAACTGGGGGG16.666666666666667No Hit
ATGATAGGAAGAGCCGACATCGAAGGATCAAAAAGCAACGTCGCTATGAA16.666666666666667No Hit
CGTACACACTAGGACGGTATCTGATCGTCTTCGAGCCCCCAACAATCGTT16.666666666666667No Hit
ACTCTGTTGGTGCGGAGTCTCGGAAATCTGGCTGCGCTTGCAAGAGTCGC16.666666666666667No Hit
CGTGTGCTCTTCCGATCTCTCAAGGGAGACGTGTGGTATTCCGCTCAGCA16.666666666666667No Hit
TCCCATGACAGATCGGAAGAGCACACGTCTCCCATGTCAGATCGGAAGAG16.666666666666667Illumina Multiplexing PCR Primer 2.01 (95% over 21bp)
CTGCACCACCATAGTTAATATCTGCGCCAAGTTTAATTTATTTTTCTGAA16.666666666666667No Hit
GGCAAGAACCGTTCTTACATCATTGATATAGCAGGAAGAGTTCTTGATGG16.666666666666667No Hit
GAAAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA16.666666666666667No Hit
CCTAAGTACCGTTTTGTTGTTCGATTTACCAACAAAGACATTGTGGCACA16.666666666666667No Hit
GCACAGAAAAATGAACGCCGCTACGAGTAGCATTTACATTGTTGAATGCA16.666666666666667No Hit
TTTCTGCCCAGTGCTCTGAATGTCAAAGTGAAGAAATTCAACCAAGCGCG16.666666666666667No Hit
CCTTACTGGTTCTCTGCCATGACAATGAAGAGTGTGGGAAGTGCAGCTCT16.666666666666667No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.5)