FastQCFastQC Report
Sat 4 Aug 2018
H3VL5AFXY_n01_p4A7.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameH3VL5AFXY_n01_p4A7.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences48
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC43

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGACTGGAAGCGTCTTGCTCATAGCAAAGTTCTACTTTCTTCCTCATCTT12.083333333333333No Hit
AAAAAATAAGTTAAATCACAATCGCAATCACTAACAATACTTACAGAAAC12.083333333333333No Hit
GGAGGAACATATTTCCCTGATGCTGGAGGAACATATTTCCCTGATGCTGG12.083333333333333No Hit
GGCTAAATACTCCTGACTGACCGATAGTGAACCAGTACCGTGAGGGAAAG12.083333333333333No Hit
GGCGTGCTCAAGTCCTGGGCCGTCACGAAAGCCCCCTCGCGCGCCCCTCA12.083333333333333No Hit
ATACTACCCTTGTGTTATGGCTACTCTAACCCAGATAGGTTATCCCTATC12.083333333333333No Hit
CAGAAATGATTAACAGAGACAGTCGGCCGCATTCGTATTTCATAGTAAGA12.083333333333333No Hit
GTGCCCAACTGCGCGCTAACCTAGAACCCACAAAGGGTGTTGGTCGATTA12.083333333333333No Hit
GTCCCAAGGGTTTGGCTGTTCGCCAATTAAAGTGGTACGTGAGCTGGGTT12.083333333333333No Hit
CCATGGAGGTTCTTGAGCCTTGTGAGTTCTTTCCGTCTATTTCTAGCTTC12.083333333333333No Hit
CATAGAAACCGTGTGAAAAAGGTTGTTCAAGAAGAACTAATTGGGTTCTT12.083333333333333No Hit
CTCTGACACCATAGACAACGTTAAGGCAAAGATCCAGGATAAGGAAGGTA12.083333333333333No Hit
CTTATAGACACAGTAAAGAATCTATACAATCTCCAAACAATCTAAAAGTT12.083333333333333No Hit
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA12.083333333333333No Hit
CCATGATCTTTCTTCACTTCCACGACAACAAACGGCGGAGCCACCGCGAA12.083333333333333No Hit
GATTTCGATCCTATTGTGTTGGCCTTCGGGATCGGAGTAATGATTAACAG12.083333333333333No Hit
AAATTAGACTCATCAAATCAATACATAGCTGAGGATACATTAGAGATCAA12.083333333333333No Hit
GACAAGTACCGTGAGGGAAAGGTGAAAAGTACCCCGGGAGGGGAGTGAAA12.083333333333333No Hit
ATGGAACTGTTATGAATGAAGAAGAACAAAAAAATGCATTGATTGTAAAA12.083333333333333No Hit
CAATCAAGCCGTTCACCCATTAAAAGCATCTTTGCAAGAGGAGGATCCAA12.083333333333333No Hit
GCCGTCAACCGCCACGTCCCGGTTCCGGAATTTTAACCGGATCCCCTTTC12.083333333333333No Hit
GATCTACATTATGGGCTAAATAGCTTTCGGTGGGCTGACCTGATAACTTA12.083333333333333No Hit
TCCTTATTGCGCTTGAGTTTCATAGCTCGCTTTTCGACTTCTAAAAAGAC12.083333333333333No Hit
GAACAACAATTTCTTCACGAGATCTCATGATGATGACGAAGCCACCTCTC12.083333333333333No Hit
CACTTCTCCTTAACAAAAATGGCCCACTTGGAGATCTCGATACCCTGTGA12.083333333333333No Hit
CCTATATGGTTAACCTTGCCACTGAATGTAAGTCGCTGACCCATTATACA12.083333333333333No Hit
AACCATAACCCAAAACCATCGAGACTCCCACCAAAACGTAACTCATCACT12.083333333333333No Hit
CTTCCGATCTGCCTTGGGTACAAACCGCATCTTCACGGCTAATTCAATTT12.083333333333333No Hit
CTCCTACAGAATCACTATCGGAAACAGAGATCAACACTGAGAACACAGAG12.083333333333333No Hit
CTTAGGCCCTGACTCACCCTCCGTGGACGAACCTTGCGGAGGAACCCGAG12.083333333333333No Hit
CTCATAAGGTGCCAGCGGAGTCCTATAAGCAACATCCGCTGATCCCTGGT12.083333333333333No Hit
CTAAAGCATCGATAGCACAAGATTTCACGGTTCTTAAACGTACTAAAAAT12.083333333333333No Hit
TCGGCGAAGAGCGCCTTGCTCAGTTCGATCACGTCATGCTCGGTCGCGTC12.083333333333333No Hit
TTCGTGTACCCATCGGACGGCAGCCCTTTCGGGGGTTCCTTAGGGACCGA12.083333333333333No Hit
ACCTATATCATCATATTTGAAGTGAGTTTCTTGTAGTTAGCATATAGTCT12.083333333333333No Hit
ATCAAACTTAGAATTAAAATTCATTGTCTTAGCATACATTTCACCATATT12.083333333333333No Hit
GCCATGGGCATTGCGATAGAATGCCGGAGATTGGATAAGTTGGAAGAAGC12.083333333333333No Hit
CCTGTCGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGAGCGGGGTAAAGCCA12.083333333333333No Hit
CACCTGAACCGTAAGCGAAACAAGATCCAGCGACTCCAGATTGCTTCATC12.083333333333333No Hit
TTTCCAGGGTGGCCAGGCTCTTAAACATAAAAGATAAATCTTCCCGAGGC12.083333333333333No Hit
GTTTCAAGATCCTATTTAAGGAAGGTGGTTGTGGGACATTTGTTCCTCTC12.083333333333333No Hit
GAAAAAAACTGTTACCACGACAATAATCACAACAAAAGGAAAATGTTTCC12.083333333333333No Hit
CTGAAATAGCTTAAAATAGACATGGAAAAGAATAAATTCCCATTCTCAAT12.083333333333333No Hit
TTCATAAACATAGGTCTCAGCAGCAAAACTCGTCCGGGTAAAGGATTCTC12.083333333333333No Hit
CCGTCGCCGCCGCGCAAGGCGAGCCGGTTCAGCTTTCGGGGGTCGACGCC12.083333333333333No Hit
CCCATCCGCTGCGAAAAGCTCCTCCCCCAACTCTGGCACGATTGGCAATA12.083333333333333No Hit
GTAAAGCTACATAGCAAGAGCTTGTTAGGGGCATATTAATTTTACATGAG12.083333333333333No Hit
TTTATGCCCAGTGCCGAATGTAAAACTGAAGAAATTCAACAAAGCGCCGG12.083333333333333No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.5)