FastQCFastQC Report
Sat 30 Jun 2018
H3K23BGX7_n01_Del_ETP.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameH3K23BGX7_n01_Del_ETP.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences135347544
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC38

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[OK]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
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[OK]Adapter Content

Adapter graph

[FAIL]Kmer Content

Kmer graph

SequenceCountPValueObs/Exp MaxMax Obs/Exp Position
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CGATCAA31038600.0144.631381
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ATCGATA30239300.0144.292541
ATCGGCA37819400.0144.190869
GATCAAG31240400.0143.916082
CCTTACC27733550.0143.619066
CGTTACC8759950.0143.603996
GATCGTT8750750.0143.551733
TGATCGG6627150.0143.263827
TACCAGC38551900.0143.24869
ATCAAGA31450050.0143.149193
TCAAGAT31487600.0142.89224
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CTTACCA27872400.0142.873357
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