FastQCFastQC Report
Fri 2 Oct 2020
HTGTLBGXG_n02_S2_R2_G01_FD.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHTGTLBGXG_n02_S2_R2_G01_FD.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC43

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGTCAAATATATTCAATATGGAGAGAATAAAAGAACTGAGAGATCTAATG14.166666666666666No Hit
GAATTCCTGTCCATCAAGGTGATGTATCTTCCCAGGACCCAAAGGGCAAC14.166666666666666No Hit
GTCAAAGTTCCTGCTGATGGATGCTCTGAAATTAAGTATTGAAGACCCGA14.166666666666666No Hit
ATAAGACCCAAAGTGAGGGGTCAAGAAGGGAGAATGAACTATTACTGGAC14.166666666666666No Hit
ATCACACTTTATGATGCGATCAAATTCATGAAGCCATTGTTTGGCTGGAA14.166666666666666No Hit
GTTCACCCCTACATACTTGAGTAAAACCTTAGTTACCTTGACTATCTACA14.166666666666666No Hit
CTTATTAGATAGCCTCTCTTATTCAGTCTTTGTTTTTTCTTCCCTATTGT14.166666666666666No Hit
TCTTTTTAACTTGCCTCTCTCTGCATCTTTGGTCATCGTATTTAATGTCA14.166666666666666No Hit
CTAGAGTCCCGGTTTCGGTTCATTACCCACACGACGTCCCCGTGGCCAAT14.166666666666666No Hit
TGGTACATCTGTTCATCGTCACGAATTCACCGTTTGCTTGTTATGAGAAT14.166666666666666No Hit
GGCACGGTCAGCACTCATTCTGAGGGGATCAGTTGCACATAAATCCTGCC14.166666666666666No Hit
CTCTCTCTTCTCTCCTCTCCTTTCCTCCCTTCTCTTTCCCTCTCTTCTCT14.166666666666666No Hit
TTGTTGATTCAATGACGGACTTAAGGTCAATGCTTGCTAGCAGTTCTGCA14.166666666666666No Hit
CTGGAGAGGAGATGGCCACCAAAGCGGACTACACCCTTGACGAAGAGAGC14.166666666666666No Hit
CCTCAAAGCCGAGATCGCGCAGAGACTGGAAAGTGTCTTTGCAGGAAAGA14.166666666666666No Hit
CTCCAGGAGGAGAAGTGAGAAATGATGATGTTGACCAAAGTTTGATTATC14.166666666666666No Hit
CATTTGGAAGTTTGTTTCATGTATTCGGAGTTCCATTTCATCGACGAACG14.166666666666666No Hit
GACATATGCAAGGCAGCAATAGGGTTGAGGATTAGCTCATCTTTCAGTTT14.166666666666666No Hit
AAGAAGTCCTATATAAATAAGACAGGGACATTTGAATTCACAAGCTTTTT14.166666666666666No Hit
ACACTAAGGTATATAAAACTTATTTCGAAAAGGTAGAAAGGTTGAAACAT14.166666666666666No Hit
GCCTCGGGAGGGGCAAGCTAGATTGTCGTCGGGGCCCACAATTAGAACTC14.166666666666666No Hit
ATGTAATCATCGCCAGTAACATTCGAGGATTTTGATTTTCATTCCACTTA14.166666666666666No Hit
CTTATAATGGAGATCCTCCATAAAGCCATGTAACAGGAACAGGATACACC14.166666666666666No Hit
CAATAGAACCACCGAGTACAGATAAATGAAGTTAAAGAAAGAATCATGTC14.166666666666666No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.5)