FastQCFastQC Report
Fri 2 Oct 2020
HTGTLBGXG_n02_S2_R2_B01_FD.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHTGTLBGXG_n02_S2_R2_B01_FD.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences30
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC43

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
TTCTTCATCCGTCCAGACTCGAAGTCGACCCGGTCATCAATCCGGGCCCT13.3333333333333335No Hit
CACTGGGGACAACACTAAGTGGAATGAAAATCAAAATCCTCGAATGTTCC13.3333333333333335No Hit
GAATAGAACGATTCCTCTTGGGAATCCAGGAATGTGTAGTTGCAACGGCA13.3333333333333335No Hit
TTCAGGGGATTACAAAGTCTTCCCCGAAAATCATGATCCAATAGCTCCCA13.3333333333333335No Hit
CTCCTGGAGTGTACATCTGCTCCCAGCACGTCCCTTGGGTTAAGTGCAAC13.3333333333333335No Hit
GGGATTGTCCGTGTTCATTCCAGTCTGGAATCAGGTCCATTATTCTCTTG13.3333333333333335No Hit
GGTATTCCCTCCCCCTCGTGACTCGGGTCTTCAATACTTAATTTCAGAGC13.3333333333333335No Hit
GAATTTGTGTGTCTCCCCTATGGCACCTATATGTGTATCTGTAGTCTTTG13.3333333333333335No Hit
AACACAATCAAAGGTAGGGCTATTAGTATCAGATGGAGGACCAATCTTAT13.3333333333333335No Hit
AGTAGAAACAAGGCATTTTTTCATGAAGGACAAGTTAAATTCATTATTTT13.3333333333333335No Hit
CATATAGCCCCCCAAGATCGAAGGTTCCAGGTTCCAGGTTGTCCCTAAGT13.3333333333333335No Hit
CACCTGTTAAGAAGATTAGACCTATCGTATACAATATAGAAAATTAAGCT13.3333333333333335No Hit
CTTCGAATCATGTTCAATGTCCTGTCGCGCTGCAAGCACCTGCGTCCACC13.3333333333333335No Hit
TACCAGGACTAAGTGATGCTGAGCGATCTAATAGAAGCGGCCTTATTTTA13.3333333333333335No Hit
TAGTAGCATTGCCTCACCTACTTCAGTGGCTGTGTGAGGAAGGAGTTGAT13.3333333333333335No Hit
GTATGCTAGAGGCCCGGTTTAGGGTAATTTGCAACACTACGGACCCTTGC13.3333333333333335No Hit
CAATGAGAACTATTGGGACTCATCCTAGCTCCAGTGCTGGTCTGAAAGAT13.3333333333333335No Hit
ACACAGATTGGAGGAGTAAGGATGGTGGACATCCTTAGACAGAATCCAAC13.3333333333333335No Hit
GAAATCAAGTTAAAATAAGGAGGAGAGTTGATACAAACCCTGGCCATGCA13.3333333333333335No Hit
GTAGCGGTATTGTCAATGCCCCAGAGAACGAGGAATTCTTTCGCTTTATC13.3333333333333335No Hit
CATCTGGGGTGGAGTCTGCTGTCCTGAGAGGATTTCTCATTTTGGGCAAA13.3333333333333335No Hit
CTGGCAAATGTTGTGAGAAAGATGATGACTAATTCACAAGACACAGAGAT13.3333333333333335No Hit
GGCATCTCCCTTATGAAGGTAATTGGACATCCCTATAGTGTTGTGGGATT13.3333333333333335No Hit
TTTTTAAACAATTCGACACTAATTGATGGCCATCCGAATTCTTTTGGTCG13.3333333333333335No Hit
GACTGAATAAGAGAGGCTATATAATAAGAGCACTGACAGTAAATACGATG13.3333333333333335No Hit
CTAGTTGAAGAGGGATTATAATCTCAATTTTCTTCTTTCAGGATTAATTG13.3333333333333335No Hit
CTCCAATAATAATGTCAGCTGATACATTTACTCCAGAAACTACAAAGCTG13.3333333333333335No Hit
CCCAAGATCGAAGGTTCCAGGTTCCAGGTTGTCCCTAAGTGCCTGAACAA13.3333333333333335No Hit
GCATCAATCCGGGCCCTAGACACCATGGCCTCCACCATGCTAGAAATTCC13.3333333333333335No Hit
CCATACAGCCATGGAACAGGAACAGGATACCAATACTCAGAAAAGGGAAA13.3333333333333335No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers