FastQCFastQC Report
Fri 2 Oct 2020
HTGTLBGXG_n02_S2_R1_G01_FD.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHTGTLBGXG_n02_S2_R1_G01_FD.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences48
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC41

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GATTACCCTCGACCTTCGGTCCGAGCACATTTGGGTAACTGATGCTTTAT12.083333333333333No Hit
GATCGAAACAGCGGTAAGCTCCTTGCGAGTTTTAGCCCCGAAGCACTTTT12.083333333333333No Hit
CTCTTGACTGAGGCTACGCTTGTTCTCGTAAATGTGAATCCCAAAAAACT12.083333333333333No Hit
CAAATAAAGCCTTTAAACAAGGGTAGTAGTACCACAAACAAGGTAAGATA12.083333333333333No Hit
GAATTTCATCAATAGGGCGCCTCATCGATTGAATCCTAATGATCAACATA12.083333333333333No Hit
CACTAAGGATGACTCCAATCATAATTCCACCAATCTGTGAGCTCTGTCAC12.083333333333333No Hit
AAAGATAATAAATCAAGTGCAAAATCTATTATCATATTTGCAAAAAAATA12.083333333333333No Hit
GGATTTATGTCAACTCTCCGACGTATTTTGACTTGGTTTCTAAAATGGAC12.083333333333333No Hit
CATTAATTAAACAGTAAATTAAGTATTCATTAAATCTTTTAAAAATTAAC12.083333333333333No Hit
AGGAAAAATAGGTGACCTTTACGACATTATAATCAATATGAAACGAACAG12.083333333333333No Hit
ATAAAAGCAGTCAGAGCTCATCTGAATTTCGTCAATAGGCCCAATCCGCG12.083333333333333No Hit
ATATGGGCCAGCACTAAGCATCAATGAACTGAGCAACCTTGCGAAAGGAG12.083333333333333No Hit
GGACAATGCAGTTGGTGCCATTTTATTTAAGATTAATGTCCAAACCTAAT12.083333333333333No Hit
CACTATTGCAATGAAAAAAAATTTCCTTTATTAGCCAGAAGTCAGATGCT12.083333333333333No Hit
TTGAAAGAGTGTGTTGGAATGTTTTGTGTCTGCCACTCGGGAGGAGATAG12.083333333333333No Hit
CCTATAAATGTATCATCAGAAACTCGGAAACTGTTAAAATTAAGTGGTAC12.083333333333333No Hit
CTACCTACTTCGCCCTACCTATCTGACATTCAACGAGAGAAAAAGTCAGC12.083333333333333No Hit
GTTCATTGATGCTTAATGCTGGGCCATATCTCTTGTCTTCTTTGCCCAAA12.083333333333333No Hit
GAAAGCGCAAAAAAGGATTATGAAATCAATCAATTTGTGTCCAATAGTTT12.083333333333333No Hit
AATTGACGATGAGTAAGTTATTGTCAGTTTCTCTGTTCCCTGTGTTTAAC12.083333333333333No Hit
CCTCCATCCAGTCTATTAATTATTGGAGGGAAGCTAGAGTAATTACTTGG12.083333333333333No Hit
GTACAGTGAGTCAGCTGATTGTGACTGGGAGAGACGCCAAGTCGCATGCA12.083333333333333No Hit
GTCGAAAGATGGTAAGGTGATTGCTTGTTTTAGGCTCTAACGCTTAGGGA12.083333333333333No Hit
GAATCACTCTCCTGGTTGGTGTTCAGAGTATGGCTGTTGCTCTTCTCCCA12.083333333333333No Hit
GAACAGTATATGTAACACCACATGTGGAGAGCAGCCTAAATTTCTTCATG12.083333333333333No Hit
GTCGAGGCCCATTTTACTATATGTGAGAACCAATGTCAACTCAAAGATCA12.083333333333333No Hit
GTGCTTGGGACATTTGATACCGCACAGATAATAAAACTTCTTCCCTTCGC12.083333333333333No Hit
CAACTGCATTCTACTTTCCTTTGGTGGAGCGGCTGAGAAGGGAAGAAGTT12.083333333333333No Hit
CCCGGGTTCGTTTCATTACCCACACTACGGCCCCTTGCCCAATTAGCACA12.083333333333333No Hit
GAGCTATTCCAGAAGTAGTGAGGAGGCTTTTTTGGAGGCCTAGGCTTTTG12.083333333333333No Hit
TCTTCAAGCTGGTGAGATCACGGTCGATGTAAAACACTAGTTCAACCCCC12.083333333333333No Hit
AACTCAACTAGCCCCATGTTCCAGGTAATCACTCATCACTTTTACTTCTC12.083333333333333No Hit
TTTCCGTGTCGCCCGGATGCCCTGTTATGCGGCAAGGTGCCGTACTGGGT12.083333333333333No Hit
TCCTTAGGTAATACAGACTTAAATGGTTCAAAGTCCAGTTTATTGTATAG12.083333333333333No Hit
TATTTGCAGTCATCAAAGTCGACGTTTTATGGTGACCTAATTTCACAGCG12.083333333333333No Hit
GAGTATGGCTGTTGCGCTTATCCCAACCATTGTGAACTCTTCATATCCCT12.083333333333333No Hit
ATCGACAATGGGAGGTGATGGATTTTGATATTGAAAGCAATGACTCCAAG12.083333333333333No Hit
GCCAAATACAGTGGGATTCTAAGAACTCTGTTCCACCGAATGAGGGATGT12.083333333333333No Hit
CCTTCGCCACGGGCTCCTTATTTTTCTTTCTCATAATTTTGTCAAAGAAT12.083333333333333No Hit
GTTTTAAAGTTCTCCTATGTGGCGCGGTATTATCCCGTATTGACTCAGGG12.083333333333333No Hit
TTGCTCTTCTGTTTGGGTCTGACTAACGATTTCTACCATACGAATTCACC12.083333333333333No Hit
TAGATGTACTGCCAAGTAGGAAAGTCCCATAAGGTCATGTACTGGGCATA12.083333333333333No Hit
TGGAGAATCCGTGTGTGTGCCTGACGGCCTCGCGTGACTGGATGACTCTT12.083333333333333No Hit
TCAGTCAAGAGAGAGGAAGAGGTCCTTACGGGCAATCTTCAAAAATTGAA12.083333333333333No Hit
ATTTGGAACAGACTTCTTACAAACCCACTGTATTTGCCTCTAATGACCTT12.083333333333333No Hit
TCGTTATGTAAAACAAATTCCATGATTACATACTTTGACTCCTTGGAACT12.083333333333333No Hit
CAATAACCCTGATAAATGCTTCAATAATATTGAAAAAGGAAGAGTATGAG12.083333333333333No Hit
TTATAATGGGAAGAACTAAAGCTGTAGCATCACAAATTTCACAAATAAAG12.083333333333333No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.5)