FastQCFastQC Report
Fri 2 Oct 2020
HTGTLBGXG_n02_S2_R1_B05_FD.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHTGTLBGXG_n02_S2_R1_B05_FD.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences15
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC46

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GATTGAGAGCATGATTGCGGGCGAGGCGTCTGTCAAAGAGATAGCCTTGA16.666666666666667No Hit
CGACAGACCAATGATCATGGTCAATCCCAGACCAGGAACAGAAACCAACC16.666666666666667No Hit
CACCCATAATGTTCTCAAACAAAATGGCAAGACTAGGGAAAGGGTACATG16.666666666666667No Hit
GAACACGCTGACCACATTCCTGTGAATTCCAACATTGAACGCGTCGATCC16.666666666666667No Hit
ATATAAAACTTATTTGGAAAAGGTCGAAAGGTTGATACATGGTACGTTCG16.666666666666667No Hit
ATTTAAAGATGAGTCTTCTAACCGAGGTCGAAACGTACGTTCTTTCTATC16.666666666666667No Hit
GTATAAGTTTGTTCCTACATCTGAAACTAATAGCCATACATTTGATTGGT16.666666666666667No Hit
CCCCAGGGGACCCGGACAGGTCCAGCCCATCCCCACCTGGGGACTCACCC16.666666666666667No Hit
GTAGAAACAAGCTCGTTTTTAAACAATTCGACACTAATTGATGGCCATCC16.666666666666667No Hit
GCCCATGAGAGAAATAATCTTAAACCCTCACTTCCTTCCTGGGCTTCGCA16.666666666666667No Hit
GAATACCACTATATGATGCAATCAAATGCATGAAGACATTCTTTGGCTGG16.666666666666667No Hit
CTGCTAGCCCCTGCTTCAAAGCCATGAGGTAATTGGGATTTATGCCTTAC16.666666666666667No Hit
GGAGACAATAGTACGTTCCCTCTTTGATCTCTAACCCTTAAAAATCGGTC16.666666666666667No Hit
ATAATACAAGATCCAGCATTTCTTTCCATTGCGAATGCATATCTCGGAAA16.666666666666667No Hit
GGTCAAGGGTAACGGTTCGAGAGTAAAGGACTGAAGATTCGCACACAAAT16.666666666666667No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.5)