FastQCFastQC Report
Fri 2 Oct 2020
HTGTLBGXG_n02_S1_R2_F01_FD.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHTGTLBGXG_n02_S1_R2_F01_FD.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences30
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC46

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
TAACAATATTGTTCTTCCAATCCATGAGCATGGATTGTCTTCCCGTTTGT13.3333333333333335No Hit
GTCAATTGCTGAGGCAATAATTGTGGCCATGGTATTCTCACAGGAGGATT13.3333333333333335No Hit
CAGAAAGGATGAATACCCAACTTTTGTATCAACATGGACGGGACTGGAGG13.3333333333333335No Hit
GAATGAAGTGGATGATGGCAATGAAGGCACATCTGGGGTGGAGTCTGCTG13.3333333333333335No Hit
AATTGATGGCCATCCGAATTCTTTTGGTCGCTGTCTGGCTGTCAGTAAGT13.3333333333333335No Hit
ACTTTATCCAGTATTTCCACAAAACCGTCTCAGATTTGATTGACCAGAAG13.3333333333333335No Hit
AATATATTCAATATGGAGAGAATAAAAGAACTGAGAGATCTAATGTCGCA13.3333333333333335No Hit
CATATATATATGAAGAGTTTATGCCCACAGATGGTACTGATGTAAAGGTT13.3333333333333335No Hit
CTTCCTGGGGCTGTGACTTTGACAATTCCTGTCTTCTCGGCTTAAGCTCC13.3333333333333335No Hit
TCTCATCACTGCAGCTCTTCAGCCCGTAAGCAATGTTGTCCCTCACAGAA13.3333333333333335No Hit
CTACAGGACCTGCAAGTTAGTGGGAATCAACATGAGCAAAAAGAAGTCCT13.3333333333333335No Hit
CTTCATACCCTTCATGTACTCTTATTTTCAGTGTTTGGAGGTTGCCCGTT13.3333333333333335No Hit
CCACTGATTCCAGTCTTAAATCCCACAATACTCTCACTTGTTTCCATTAT13.3333333333333335No Hit
GCCTACAGTAGGGTTCTGCTTCTGTTCCACAAGAGTTCTTGGTGTTCGCA13.3333333333333335No Hit
AAGTAGTGCTCTATAGAATATTCTTGGATGGGGGAACTATAAGAGCAAGT13.3333333333333335No Hit
CCCACAGCCACTGCCTCGGGCCTGGATGTGGCCTGGGTCATGTTTTCCTG13.3333333333333335No Hit
CCCAATTACAGCAGACAAGAGAATAATGGACATGATTCCAGAGAGGAATG13.3333333333333335No Hit
ACCCTGCTCCCTTCTGCTGATCCAAGCCTGCCCACCTTGCTAGAGTAACC13.3333333333333335No Hit
GGGTGATACTGGGAAGGGAGACACGTCAGATCCCCAGAGAGGTTTAGGGG13.3333333333333335No Hit
CAATAACAAGCACATGAGGGCAGAGAAAAAACTCTGATAAGCTGTGTTAT13.3333333333333335No Hit
GACCTGCATGGTGGGGGTGATACTGGGAAGGGAGACACGTCAGATCCCCA13.3333333333333335No Hit
GGTAATGTGAGGGGCACCTGGGTGACTCCGTTGTTGTTAAGAGTCTGCCT13.3333333333333335No Hit
GCAGGGCAGGAGAGCAAAGCCTTCGCGGAGGGCCTGGGAAGGGGGCTCCC13.3333333333333335No Hit
CTCTTGGGGCGGTGGAGGGCGCCCTGGCTTATCCTGAGGCTCCTAACCTG13.3333333333333335No Hit
GTCATCTTTCAGACCAGCACTGGAGCTAGGATGAGTCCCAATAGTTCTCA13.3333333333333335No Hit
AGCAGGTACTGATCCACAAGGGAAGCCTTGGTGCGACAATGCTTCCCTCC13.3333333333333335No Hit
ATACGAGCTCAACGCAGCATTGGACAATAAGAACCAACGCCGACACGCTA13.3333333333333335No Hit
TTATGTAAAGGTAAAAGAAGAAAAACATGAGCTAAAGAATTACAAGCAGA13.3333333333333335No Hit
ATCAATAATTGTAGAATCTGGTGACCCGAATGCACTATTGAAGCACCGAT13.3333333333333335No Hit
GCAAATAGTAGCATTGCCACAACTACTTCAGTGCATGTGTGAGGAAGGAG13.3333333333333335No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers