FastQCFastQC Report
Fri 2 Oct 2020
HTGTLBGXG_n02_S1_R2_C05_FD.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHTGTLBGXG_n02_S1_R2_C05_FD.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences30
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC46

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
ATTCATTATTTTTGCCGTCTGAGTTCTTCAATGGTGGAACAGATCTTCAT13.3333333333333335No Hit
CTCCCAAGACCGTACTTAGCATGTTGAACATGCCCATCATCATCCCAGGA13.3333333333333335No Hit
ATACTCACTACCACTCTCTCCGTGCTTGAGTATTCATCTCCTCCCATTTT13.3333333333333335No Hit
TCAATCTACATAGGCTGTATTGTCTAAAACGCTGGGGAACATAGGTCGCA13.3333333333333335No Hit
AATTGGCACATTAGCCTTCTCTCCTTTTGCAAGATTGCTCAGGTCATTGA13.3333333333333335No Hit
GGTCAAGGAACCAAAGGAGGGATAAGGGCCAAGGATCTGGGCAGTTGGAC13.3333333333333335No Hit
TACCAGAAGCGAATGGGAGTGCAGATGCAGCGATTCAAGTGATCCTCTCG13.3333333333333335No Hit
CTACTGGTAGGCCTGAAAATTTTCAAGAAGGTCATCTTTCAGACCAGCAC13.3333333333333335No Hit
GAACATGGGCCTCGACACTTGGCCTATCGCAGTCCTCAAGAGCATGTCTC13.3333333333333335No Hit
AACGGGCAACCTCCAAACACTGAAAATAAGAGTACATGAAGGGTATGAAG13.3333333333333335No Hit
GTGTATCTCTAGTCTTTGATGAACAATTGAAGAGCCATCTGGGCCGTTGC13.3333333333333335No Hit
GTACGGTCTTGGGAGTCTCGATACTGAATCTTGGACAAAAGAAATACACC13.3333333333333335No Hit
CCCTTAAAAATCGGTCAATACTCACTACCACTCTCTCCGTGCTGGAGTAT13.3333333333333335No Hit
GCGCACAACCATTGTGAATTCTTCATACCCGTCATGTAGTCTTAGTTTCC13.3333333333333335No Hit
GCATGGAGCAGGTGCTGGATACGCCATGGCCACTGTAAGCAGACCAGCGC13.3333333333333335No Hit
GTCCAATGCAGTTGCTGCCGGTTGATTTCTGTTTAATGTCCAATCATAAG13.3333333333333335No Hit
CATGCTTCCCGAGAGGAATGCACACTGCCAAACACTCGGGCGCACAACAC13.3333333333333335No Hit
CCATTGGTTCTCACATATAGGAACATGGGCCTCGACACTTGGCCTATCGC13.3333333333333335No Hit
CTGTTAGGCCATTCGATCTAAAGACTTCTATGGTGTTGGCCAATGCAGTT13.3333333333333335No Hit
CTCGAATAGATTGCAGCACTTCTGGTACATCTGTTCATCCTCAAGAATTC13.3333333333333335No Hit
ATCCAGAGGTTTGTTTGGAGCCATTGCCGGTTTCATTGAAGGGGGGTGGA13.3333333333333335No Hit
ATCTGCAGCTGTTGTCTCTCTGGTGGTGCTGTGGTCCACTGGGCCCAAGA13.3333333333333335No Hit
AAATGTCCAGAGAGGATTTCTCATTTTGGGCAAAGAAGACAAGAGATATG13.3333333333333335No Hit
GATTGATCCAGTTGATAGTAAGCGGGAGAGACGAGCAGTCAATTGCTGAG13.3333333333333335No Hit
TTTCTGTTTAATGTCCAATCATAAGTCTGGCGACCTTGAGTTAGTTTATC13.3333333333333335No Hit
CTCCCAAGACCGTACTTAGCATGTTGAACATGCACATCATCATCCCAGGA13.3333333333333335No Hit
CATCTGGAGGTAGTGAAGGTCTCCCATTCTAATCAAAGTTTCTACAAGCG13.3333333333333335No Hit
GTGAATCTGCGAGGATCAGGGTTGAGGATACTGGTAAGAGGCAATTCTCC13.3333333333333335No Hit
TTCTTGATCCGTCCAGACTCGAAGTCCAACCTGGCATCAATCCGGGCCCT13.3333333333333335No Hit
GCCCTCAATGCAGCCGTTCGGCTCGAATCCCTCTACATAGGCTCTAAAGT13.3333333333333335No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.5)