FastQCFastQC Report
Fri 2 Oct 2020
HTGTLBGXG_n02_S1_R2_C01_FD.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHTGTLBGXG_n02_S1_R2_C01_FD.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC46

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGACAGCGAGAGAGCGAACACAGGCAGGAGGAGTAGGAGAGTGAGAAGCA14.166666666666666No Hit
GTGCTGGAGCAGGTGCAGGTGCTGGAACAGGTGCAAGAGCAGGAACAGGA14.166666666666666No Hit
GAATGGTTCTGCACAGAACTCCAGCGAAGTGTATGGAGCAAATGCATGGA14.166666666666666No Hit
GACTAAAGGGAGGTGGTCATGGGGAGTTACAGAATTTCAGTTTTGCAAGA14.166666666666666No Hit
GCCTAGATGGCTCAGTTATCAAGCGTCTGCCTTCGGCTCGGGTCGTGATT14.166666666666666No Hit
TGCCTGCGTTGCTCTGAGCCTTTTATGTAACAACAGTCAGTGTGCAAATC14.166666666666666No Hit
GATTTTAAATTGGTTCCTGTCCCCGCCCATCCCTATCACTGCCATCCGAA14.166666666666666No Hit
GGCAGGGAGTTCAAGGCCTAGTGGGAGGTGGGGGAGCGCCTTGATCCCAG14.166666666666666No Hit
GCTTTACCTGTGTACGCTCAGCCCCGGGAGCCCCTTTCTGGCTCGGAGGG14.166666666666666No Hit
CAGAATACACAATCTTTTCAAGTACACACAGAACATTCTCCAGAATAGAT14.166666666666666No Hit
ACCAGAAGGTGTATGAGCTGCAGGCCAGTCGTGTGTCCAGTGATGTTATT14.166666666666666No Hit
CTAAGAAACCTTTCCAACCCCTTTAAACTAAGTTCTGACACATTCTAAAC14.166666666666666No Hit
CACCTATCCTACACTTTCCAGAAGATCTTTAATGGTAAGGCATACAACCA14.166666666666666No Hit
AGCCAAACTCATTGAACCACCATATACTCAGAATGATGCATAAACAGTTA14.166666666666666No Hit
ATTTGGCACCTTCGATCACAGCTAGGTAAGAGAAACGGAGCTGGTCTGCT14.166666666666666No Hit
ATTCATATCACATCTAAAGTCCTTTATAATACAATCTTATTGTTATAATA14.166666666666666No Hit
GTTTCAGAGATCATCAAGAACACAAAACCAGTGCTAGGTAAAGGAGTCAT14.166666666666666No Hit
ATCCCATGCAGGAGCCACAATGCCAGATCCCACAGCTTGCCTTTTCATCA14.166666666666666No Hit
ATAAAATACTATTTGAACTCTTACTAAAGTTCCAGGTATTCTGCTAGGCC14.166666666666666No Hit
AATATACATGAGCAAGGCGGCAGAAACAACCGTATCGCCATTAGCACTAA14.166666666666666No Hit
GGGGGGGCATGTCCTGCTCCAGCACGTGTCCCTTTAAATAAGTGAGTGCA14.166666666666666No Hit
GCATCTTCCGCAGCTGCTTCTCCTTCTTGGCCACCTCATTCAGGAAGAGC14.166666666666666No Hit
CTGCTATACAAGACGTTACGGGTGCGCATATTGATGTGGATAAACAAAAA14.166666666666666No Hit
GCACAATTGTGTGTCACAATCGTGTGGACCCCAACGGTTCCCCCTATCTG14.166666666666666No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.5)