FastQCFastQC Report
Fri 2 Oct 2020
HTGTLBGXG_n02_S1_R2_B03_FD.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHTGTLBGXG_n02_S1_R2_B03_FD.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC40

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CTATAGCTCTATGTTGACAAAATGACAATCGTCAACATCCACAGCACTCT14.166666666666666No Hit
GTTCTAGAGGCTATGTATTTCCTTGAAGCATCAAACCCAGGAATATTTGA14.166666666666666No Hit
GTATATGTAACACAACAGGGGTAGAGACGACTAAATTTCTTCCTGATTTG14.166666666666666No Hit
GAGGAAAAGGCAATTAAATAATATGGTGAATCTCAGAAAATCGAACCTAT14.166666666666666No Hit
GTCCTGGAAAGTGGACAACATTATATGTAACACAACAGGCGTACAGAAGC14.166666666666666No Hit
CTCTTGAGGACTGCGATAGGCCAAGTGTCGAGGCCCATGTTCCTATATGT14.166666666666666No Hit
AAACAAGGGTGTTTTTCTCATGATTCTGAAATCCGAATGTTAAATACATA14.166666666666666No Hit
CACTTGATACTGCAAGCCAATACCCACAAGCAGTAATGCAGGCTTTCGTT14.166666666666666No Hit
CACCAGTATATTGTATTGGTGTATTTCTTTTGTCAAATATTCAGTATATA14.166666666666666No Hit
GGAGTAAATGAATCAGCTGAAATGAGTATTGGAGTAAAAGTGATAAAGAC14.166666666666666No Hit
GACACAACAACTTAAGTTCAAGTTTGAGTAACTATAAGAACAAAGATGCA14.166666666666666No Hit
GTAGATACTCCATACATCCATCGAACAGGAACATTATACACACTTGACAC14.166666666666666No Hit
AAACCAGCACTATTATATTGAATATCGAGACAATATAAGAACTGAGAGAT14.166666666666666No Hit
CCCGCATGCTAGAAATTCCAACCGGTCTCCTATATGAACTGCTAGGGAAA14.166666666666666No Hit
TCTCAGGACAGCAGACTCCACCCCACATGTTCCTTCAACTGGATCTGCAG14.166666666666666No Hit
AAACAATGCATTTTTTCATGAAGGACAAGTTAAATTAATTATTTTTGACG14.166666666666666No Hit
CCCTAGCAGTTCATATAGGAGACCGTTTGGAATTTCTAGCATGGGGGCTG14.166666666666666No Hit
ATTGCAGCCTAATATTTTCTTGTTTGGCAGCAGCAAAGTGTAAAATTTAT14.166666666666666No Hit
AAAAAATACACATCAGGAATGCAAGAGAAGAAAACAGAACTCAGAATGAA14.166666666666666No Hit
AAACAAGGTCGTTTTTAAACAATTCGACACTAATTGATTGCCATCCGAAT14.166666666666666No Hit
CCGATTAATTATGGCAATGGTAATCTAAAAGTATAATTGCCAGATCATCG14.166666666666666No Hit
GTTCATTGCTGGGTTATGGTGTGCGATGTGTCTTGGGGTCGTGGAGCACA14.166666666666666No Hit
GGCCAGTATGGATAGAAAATAGTATCATTGCAACAACTACTTCAGTGCAT14.166666666666666No Hit
CCTCGACTCCCATTTTGCTGCATCTTTTCCCTCTCCGAGACAACGCAGTG14.166666666666666No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.5)