FastQCFastQC Report
Fri 2 Oct 2020
HTGTLBGXG_n02_S1_R2_B01_FD.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHTGTLBGXG_n02_S1_R2_B01_FD.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC42

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CTGTGGTAATGCCAGCCCATGGTCCAGCCAAGAGCAAGGAATATGATGCC14.166666666666666No Hit
CAATTGCAAGAATACCTATCAACAAAATTACGGGATAACCCCAGCCACAT14.166666666666666No Hit
TCTCACAACATTTGCCAGTTTGGCCTACTTTTAATTGCCCCAAACTGGGA14.166666666666666No Hit
CTCATGTTGGGAAACAAAACGTGGAATGGATCTTGAAAGAGGAATCAAGC14.166666666666666No Hit
AAGAAGGGCTATCGCAACACCTGGGATGCAGATTAGAGGTTTCGTATACT14.166666666666666No Hit
GGCAAAAATAATGAATTTAACTTGTCATAAATGAAAAAATGACTTCTTTC14.166666666666666No Hit
CTTCTTGGTCATGTTGTCTCTTACTCTCCTTTTTCTTTGAAAGTGGGTTG14.166666666666666No Hit
GAATAAAAGAACTAAGAAATCTAATGTCGCAGTCTCGCACCCGCGAGATA14.166666666666666No Hit
GAGATCTAATGTCGCAGTCCCGCACTCGCGAGATACTCACTAAGACCACT14.166666666666666No Hit
ACTTAACCCAAGGGACGTGCTGGGAGCAGATGTACACTCCAGGAGGAGAA14.166666666666666No Hit
GTTCATTGATGCTTAATGCTGGGCCATATCTCTTGTCTTCTTTGCCCAAA14.166666666666666No Hit
CATTATGTATAGGTTATCATGCGAACAATTCAACAGACACTGTAGACACA14.166666666666666No Hit
CTTATCTCTTGTTCTACTTCAAGCAGTAGTTGTAAGGCTTGCATAAATGT14.166666666666666No Hit
CTTCAAAATATGGGTACTACGGTTATATTATGCTCCTACACAGCACTGGG14.166666666666666No Hit
GGTGTTCCTGGTGTTATTGGTCCGGCGTGGGCTCAGGCGCTCCGTGCGGA14.166666666666666No Hit
TATTTTCAGTGTTTGGAGGTTGCCCGTTAGCATTTCTTCTTCTTTCTTGA14.166666666666666No Hit
GGTCCTCATCGGAGGACTTGAATGGAATGGTAACACGGTTCGAGTCTCTG14.166666666666666No Hit
ATTTAAAGCGACGATAAATACATTTGAAAAAAAGACGATCAGTAATCCAC14.166666666666666No Hit
GCTTTTGGTCTAGTGTGTGCCACTTGTGAACAGATTGCTGATTCACAGCA14.166666666666666No Hit
TTACAATAGCCGTTGCCGTAGTCCTATCCATCACAATTCTGTTTTCATGC14.166666666666666No Hit
AGTGCTGACCAACAAAGTCTCTATCAGAATGCAGATGCATATGTTTTTGT14.166666666666666No Hit
CTAGACTCGAATTCGTAGTTAGGTCTCATGAAAGAAGCTAATTCGACCCT14.166666666666666No Hit
AAACAAACCTGTATGGGTTCATTATAAAAGGAAGGTCTCATTTGAGAAAT14.166666666666666No Hit
TGAGAGAATACAAGCAGGAGTGGACAGATTCTACAGGACCTGCAAGTTAG14.166666666666666No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.5)