FastQCFastQC Report
Fri 2 Oct 2020
HTGTLBGXG_n02_S1_R1_F05_FD.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHTGTLBGXG_n02_S1_R1_F05_FD.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences15
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC52

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
ACATTGACCTGGGATTTTGGTCACAGGAACCTGGACACACAAGACTTATT16.666666666666667No Hit
GGTCCATCCATAGGTGAATGGATAAAGAAGATGTCACATACACACACACA16.666666666666667No Hit
TCTCAGGACAGCAGACTCCACCCCAGATGTGCCTTCATCTGGATCTTCAG16.666666666666667No Hit
TATTTTCACCGAGTGACCACTTCAATTGGCTTGTTCTATTCATGTTCTTT16.666666666666667No Hit
GGGCCACACTGAGCAAGCCCTTCTGTGGCTTCTTTTTTATGCTTCAGCGC16.666666666666667No Hit
GGGCTTGAGATCCCGCTCGGGCTAGCCCTGAGTGAAAATATCTTGCGCCA16.666666666666667No Hit
TACTTGCTCTTTAAGAATATTCTGAAAGGCACGTTGCCTTCTCCGTTAAG16.666666666666667No Hit
TTCTAGCAGCGATAATCAAACTTTGGTCAACATCATCATTTCTCACTTCT16.666666666666667No Hit
GTCTGGCTGGAACCCTGATGTGCAGGGACAGTCCGCGGTGCTTCCTGGGG16.666666666666667No Hit
CTCTAAGACTGCTGGGGGTGGCATCTCAGGAACCACCTGCTGGGGAGGCT16.666666666666667No Hit
CTCTCATGGAATGGCTAAAGACAAGACCAAGCTTGTCCCAGCTGACTAAG16.666666666666667No Hit
GGATATGCCTGAACCTCTGGCTAGACTCTGCACACGGCAGCGAGCCGATC16.666666666666667No Hit
CTGTTTCCTTTGGCATATCCGCAAGCGATTTGCAGACAATGGATTGGGTG16.666666666666667No Hit
TGAGTCACCCTGCGTCCACCCGAGACACGTGGGGGCCGGTGAGAAGTTCA16.666666666666667No Hit
TCCCGTGGGGTCCGTTCACACCGGCCAGCGACCCACGGACGTTTCCTCCG16.666666666666667No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.5)