FastQCFastQC Report
Fri 2 Oct 2020
HTGTLBGXG_n01_S2_R1_G01_FD.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHTGTLBGXG_n01_S2_R1_G01_FD.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences48
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC44

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GTGTCTGGTGCTACTTTGATAGTTAGAGACACAATGTGAATCACGTCCAT12.083333333333333No Hit
CCGGAATTGATTAAGATGAATAACTAGGAAATACTCAATGTAGACCCAGG12.083333333333333No Hit
CTCTTGTCTTCTTTGCCCAGAATGAGGAATCCCCTCAGAACAGCGGACTC12.083333333333333No Hit
GTTATCACTCATGGTTATGGCAGCACTGCATAATTATCTTACTGTCATGC12.083333333333333No Hit
CCAGGAACATTAGAGTATTTTCATTGTAAATACACTTATTGTACTCCACA12.083333333333333No Hit
CACCAGAACAGAGTAGGATGCAATTTTCCTCATTGACTGTGAATGTGAGA12.083333333333333No Hit
GTGTGTACATTGAAGTGTTGCATTTGACTCAAGGAACATGCTGGGAACAG12.083333333333333No Hit
CTGTAGCACCGCCTACATACCTCGGTCTGCTAATCCTGTTACCAGTGGCT12.083333333333333No Hit
ATGCGAAAGTGCTTTTTCAAAATTGGGGAGTTGAAACTATAGACAATGTG12.083333333333333No Hit
AATTGATGGCCATCCGAATTCTTTTGGTCGCTGTCTGGCTGTCAGTAAGT12.083333333333333No Hit
CAACAGAGAAACTGACAATAACTTACTCATCGTCAATGATGTGGGAGATT12.083333333333333No Hit
GAGAATAGTGTATGCGGCGACCGCGTTGCTCTTGCCCGGCGTCAATACGG12.083333333333333No Hit
CATATAGACGTTTTCATAAATATTTTGACAGTAAGGTAATTCACAATTTC12.083333333333333No Hit
ATACACCATGGACACAGTAAACAGAACACACCAATACTCAGAAAAGGGAA12.083333333333333No Hit
GGATGTAATCATGGAAGTTGTTTTCCCTAACGAAGTGGGAGCCAGCATAC12.083333333333333No Hit
TCAATATGGAGAGAATAAAAGAACTGAGAGATCTAATGTCGCAGTCCCGC12.083333333333333No Hit
ACCCAACTGAGAAGTTCGACCAGTAAACCGATAGAGAGCCTCAACCGCTC12.083333333333333No Hit
ATATGGAAAGAATAAAAGAACTAAGAAATCTAATGTCGCAGTCTCGCACC12.083333333333333No Hit
TCACTATAGATGGGATTAGAGCAACAACGAAACTAAGAAAAGAAAATATG12.083333333333333No Hit
GGGCTTCAATACTTAATTTCAGAGCATCAATACGAAGGAACTTTGCACGC12.083333333333333No Hit
ATAACCAAAGAGAAGAAAGAAGAACTCAAGTATATCAAAATATCTCAATT12.083333333333333No Hit
CTGTAGCAACATTCTAAAATTTTCGCCAAATGTATTGGTATTTAAAAATC12.083333333333333No Hit
CTTCATGATGGACACATAATTTTTGCAATATTGAAAAACAACTGATATCT12.083333333333333No Hit
CATATATGGAGTTCCGCGTTACATAACTTACGGTAAATGGCCCGCCTGGC12.083333333333333No Hit
GCCCGGCGCTGCTCCCGCGTGTGTCCTGGGGTTGACCAGAGGGCCCCGGG12.083333333333333No Hit
TCTGAATTTCGTCAATAGGGCGAATCAGCGATTGATTGCTATGCATCAAG12.083333333333333No Hit
GGTCAATACCTATCAATGGATCATCAGAAACTGGGAAACTGTTAAAATTC12.083333333333333No Hit
CACAAGATCCCACAATGTTATACAACAAAATGGAATTTGAACCATTTCAG12.083333333333333No Hit
AGGAGGGGAAGTGAGGAATGATGATGTTGATCAACGCTTGAGTATTGCTG12.083333333333333No Hit
GGCCTCTAAGGGCCTTAGGTACTAAAGACTGACATGGTTCAAATTCCAGT12.083333333333333No Hit
GATAATAGTGCATGAGGGATATGAAGAGTTCCAAAGTGTTGGGAGAAGAG12.083333333333333No Hit
CCTCTGGCTGTGACATGGTGGAATAGGAATGGACCAATAAAAAATACACT12.083333333333333No Hit
GGCCCCCGTGCGGCAATGATACCGCGAGACCACCGCTCACCGGCGCCAGA12.083333333333333No Hit
TTTCATTTCTGCTCTGGAGGTAGTGAAGGTCTCCCATTCTCATAACAGTT12.083333333333333No Hit
AGACAGAAATGGTTCAAAATCCATTGTTTTGTATAGCATTGTAGGGTTCT12.083333333333333No Hit
GCACGCAAAATGGTCTCAAACAAATTAGAAAGACAAGGCAGAAAATACCA12.083333333333333No Hit
GCGCTGCTCCCGCGTGTGTCCGGGGGTGGACCAGAGGTCCCCGGGCGCTC12.083333333333333No Hit
GCAGATCCACTAGCATCTTTATTGGAGATGTGCCACAGCACCCAGATTGG12.083333333333333No Hit
AAGGAAGAGTATGAGTATTCAACATTTCCTTGTCGCGCTTATACCCTATT12.083333333333333No Hit
CCGTCAGCTGCTTTTCTCTGACTGGTGAGTCCTCACCCAAGTCATTATGA12.083333333333333No Hit
GTATTGTATAGCATTGTAGGGTTCTGGGAACACTGAATTATAACAGTTTC12.083333333333333No Hit
GTAGTACATTTCCTCGGTGGTCCCGGATTCTCAAAAAACGGTCAATGCTC12.083333333333333No Hit
ACAATATACTGGTGGGATGGGCTCCAATCATCCGACGATTTTGCTCTCAT12.083333333333333No Hit
CTTCCAGGGGGAAACGCCTGGTATCTTTATAGTCCTGTCGGGTTTCGCCC12.083333333333333No Hit
CCCAGTTGTAAGGAAAACATGTGCATGATGACATTCTTGCTCGTGTCGGA12.083333333333333No Hit
GTATTAAACACCCGCTTCAAGAGGGGTCGGGAATACCACTATATGATGCA12.083333333333333No Hit
GGCCAGCACTAAGCATCAATGAACTGAGCAACCTTGCGAAAGGAGAGAAG12.083333333333333No Hit
ACATGTAAGGAAATTTTTAGGGATGGTAAAGAAAAAAATACGCCAAAACA12.083333333333333No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.5)