FastQCFastQC Report
Fri 2 Oct 2020
HTGTLBGXG_n01_S2_R1_B05_FD.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHTGTLBGXG_n01_S2_R1_B05_FD.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences15
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC47

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CACCAGTATATTGTCTTGGTGTATTTCTTTTGTCCAAGATTCAGTATCGA16.666666666666667No Hit
GTTGGATTCTGTCTAAGGATGTCCACCATCCTTAGTCGGCGATTCTGTGT16.666666666666667No Hit
GTATGGATAGCAAATAGTAGCATTGCCACAACTACTTCAGTGCATGTGTG16.666666666666667No Hit
CAATCCCCATGTGCCCAAAACCAAGGTTGCTCACAAAAAACGACGAACAT16.666666666666667No Hit
GATTTGTGGCTAATTTTAGCATGCAGCTACAAAGCTTTGGAGTGTCTGGA16.666666666666667No Hit
GACACTTCTGCTGTAAAATAGTTCCTCCTCATGCTTGCGATATGTTCAAT16.666666666666667No Hit
TTCCATGAGAGCCTCAAGATCTGTGTTCTTTCCTGCAAAGACACTTTCCA16.666666666666667No Hit
GGTCTGGGCCGTTTCAGGTGCCAGGTCGGTGTTTAGCGTGTTCTGGTTTA16.666666666666667No Hit
GAGCCAGAGGCTGCTGCCTGTGGTGAAGGCTCATCAGGGAGGAGATAGGG16.666666666666667No Hit
CCTTTCGTCAGTCCGAAAGAGGCGAAGAGACAATTGAAGAAAAATTTGAG16.666666666666667No Hit
CTGTAGACACAGTACTAGAAAAGAATGTAACAGTAACAGAATCTGTTAAC16.666666666666667No Hit
AATTGTGGCCATGGTATTCTCACAGGAGGATTGCATGATCAAGGCAGTTA16.666666666666667No Hit
CTAGCATACTTACTGACAGCCAGACAGCGACCAAAAGAATTCGGATGGCC16.666666666666667No Hit
CGAACTATTGAAATCCAGATAAAAAGAGTTATCCTACCTGCTCAACAGCA16.666666666666667No Hit
CTTCCGGGAGGAGAAGACCGTGTCCCACCGGCAGCCCCTTCTGGCCTGCA16.666666666666667No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.5)