FastQCFastQC Report
Fri 2 Oct 2020
HTGTLBGXG_n01_S1_R2_F01_FD.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHTGTLBGXG_n01_S1_R2_F01_FD.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences30
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC47

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GCCGCAGATAGCCTGTTGAATACAGATTTTGCCAGTAAGGTCCTGCACAC13.3333333333333335No Hit
CCCCGCTAGAGTCTCAAAAGGCACTTTGACCTAATGTCCCACAAATTCAA13.3333333333333335No Hit
AAGCAGGGACTTAGGTCTTTTCTAGAAAATATATGATCTCAAATCATTTG13.3333333333333335No Hit
GTGAAAACATACGATAATTGACTCTTTTTGCTTGATTTATTTCACTCAGC13.3333333333333335No Hit
ATCAAAGGATGAACAGTGGAAACGAGCTATGGATTACTTAAATGTTGTCA13.3333333333333335No Hit
AGGTCCAACTGCCCAGATCCTTGGCCCTTATCCCTCCTTTGGTTCCTTGA13.3333333333333335No Hit
GGCCTTGCCCTCTGCAGGTGCTCTCCCACGGACCACAGTTCCCTACAGAG13.3333333333333335No Hit
CACTAATTGATGGCCATCCGAATTCTTTTGGTCGCTGTCTGGCTGTCAGT13.3333333333333335No Hit
GGGCCATTGATCTCCCACATCATTGATGACGAATAAGTTATTGTCAACTT13.3333333333333335No Hit
GTGCTAGGTGCTGGCAGAAGAGCATCTGCCGGTACCTCAATCTCCACATT13.3333333333333335No Hit
CTATGGAGTTGTTACTGGAGTTCTTGGCTCACGCGGACCCTGTGCCCGCG13.3333333333333335No Hit
ATTCAACTGGTGCACTTGCCAGTTGCATGGGCCTCATATACAACAGGATG13.3333333333333335No Hit
CTATTAACGTGTTCTATTTGACCAAAAAAGAAGTTACAGTTAATAGAGTT13.3333333333333335No Hit
GTGGAAGATCGCTCTATGATACACAATTAATCCAGACACGAGCAGAGTCT13.3333333333333335No Hit
GACCAGCCTGTGCTCAAGGGGCTGACGTTCACTCTACGCCCTGGTCAGAT13.3333333333333335No Hit
GTCTAGGAGAGCCTGAAATCCAAACCAGGGCTCCCAGAAAACCACCAACA13.3333333333333335No Hit
CATTTGGAAGTTTGTTTCATGTATTCGGATTTCCATTTCATCGACGAACG13.3333333333333335No Hit
GATCAATAACATCACTGGACACACGACTGGCCTGCAGCTCATACACCTTC13.3333333333333335No Hit
GCACTAAGCATCAATGAACTGAGCAACCTTGCGAAAGGAGAGAAGGCTAA13.3333333333333335No Hit
TTTTTAAACAATTCGACACTAATTGATGGCCATCCGAATTCTTTTGGTCG13.3333333333333335No Hit
ATGCTTATCTCTTGTCTTCTTTGCCCAAAATGAGAAATCCTCTCAGGACA13.3333333333333335No Hit
CTGTAGTAGTGATAAGAAGCAGTTATTTTCCAACAAAGCAAATCCTGGTT13.3333333333333335No Hit
CTTTTCATACTGAGCGAAAGACAGAACCCGCCACGGGCTTCATTGATCGA13.3333333333333335No Hit
GACCAGAAAATTGCTCCAGGTCCAACTGCCCAGATCCTTGGCCCTTATCC13.3333333333333335No Hit
GTTTATATGAGAAAGGAGGGGAATGAAAGAGAAAATAGAATCAAAACACC13.3333333333333335No Hit
GACATATGCAAGGCAGCAATAGGGTTGAGGATTAGCTCATCTTTCAGTTT13.3333333333333335No Hit
ATCTGGGCCGTTGCAGGTCCAAGGTCATTGTTTATCATGTTGTTCTTTAT13.3333333333333335No Hit
TGACACATCTAAGTTCCATCATAGTTCCAGATGTAGTTGGTACAATTGGG13.3333333333333335No Hit
ATTAGAAATAATATTCACCTTTGTCACCAGAACCTAGCTCAGTCCTTGAC13.3333333333333335No Hit
CATATAGACTGTTGAATACAGATTTTGCCAGTAAGGTCCTGCACACTTTC13.3333333333333335No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.5)