FastQCFastQC Report
Fri 2 Oct 2020
HTGTLBGXG_n01_S1_R2_C05_FD.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHTGTLBGXG_n01_S1_R2_C05_FD.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences30
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC44

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
ACCATGGACACAGTAAACAGAACACACCAATACTCAGAAAAGGGAAAGTG13.3333333333333335No Hit
CCATTTGAATGGATGTCAATCCGACTCTACTTTTCCTAAAAATTCCAGCG13.3333333333333335No Hit
GTTCTAGTTCTGTGAGAAGTGTTATTGGTATTTTGATAGGTATTACATCA13.3333333333333335No Hit
CGCCGTGAGTGTCCATCTGCTAAACGACCGGCCCTTGGTTGCAGTGCACC13.3333333333333335No Hit
GTCAGTAAGTATGCTAGACTCCCGTTTAACTTTAGATACCAACAATACCT13.3333333333333335No Hit
CTATACAAGAAGCTCAAAAGAGAAATAACGTTACATGGGGCCAAGGAGGT13.3333333333333335No Hit
ATCTTGGACAAAAGAAATACACCAAGACAATATACTGGTGGGATGGGCTC13.3333333333333335No Hit
GGCACAAGCGGTAGACATATGCAAGGCCGCAAGAGGTTTGAGGATGAGCT13.3333333333333335No Hit
CCTCCATACAGCCATGGAACAGGAACAGGATACACCATGGACACAGTAAA13.3333333333333335No Hit
GTACATCTGTTCATCCTCAAGAATTGTTTCAAGGCATGAATTCTCAAATA13.3333333333333335No Hit
GGAGAGACGAGCAGTCAATTGCTGAGGCAATAATTGTGGCCATGGTATTC13.3333333333333335No Hit
CCTATAATGTTCTCAAACAAAATGGCAAGACTAGGGAAAGGGTACATGTT13.3333333333333335No Hit
ATGTAACACAACAGGGGTAGAGAAGCCTAAATTTCTTCCTGATTTGTATG13.3333333333333335No Hit
GCCCCTAACTGCCTTGATCATGCAATCCTCCTGTGAGAATACCATGGCCA13.3333333333333335No Hit
CACTACCACTCTCTCCGTGCTGGAGTATTCATCTACTCCCATTTTGCTGA13.3333333333333335No Hit
CCTGTATGGGTTCATTATAAAAGGAAGGTCTCATTTGAGAAATGATACTG13.3333333333333335No Hit
GCATTATATGTCCAAATGTCCAGAAATCCATCATCAACTTTTTTATTTAA13.3333333333333335No Hit
GGATTGGGTGATGCCCCATTCCTTGATCGGCTCAGCCGAGATCAAAAGTC13.3333333333333335No Hit
GTCGGCAGCCTGGGCAGGGGCTTGGCTCTTCCTTCCTTCCTCTAGCCTTG13.3333333333333335No Hit
CCCTTATACTGGAGATCCTCCATACAGCCATGGAACAGGAACAGGATACA13.3333333333333335No Hit
CACAAATTCAGACGAGAAGATCATTTGAGTTAAAGAAGCTGTGGGATCAA13.3333333333333335No Hit
ATTAGTAGAAACAAGGTAGTTTTTTACTCTAGCTCTATGTTGACAAAATG13.3333333333333335No Hit
GAATGAAGTGGATGATGGCAATGAGATACCCAATTACAGCAGACAAGAGA13.3333333333333335No Hit
CTATTTTACAGCAGAAGTGTCCCACTGCAGGGCTACTGAATACATAATGA13.3333333333333335No Hit
GGGTGAATCAATAATTGTAGAATATGGTGACGCGAATGCACTATTGAAGC13.3333333333333335No Hit
CTCCAAAGCTGGGTAGCTCCATGCTAAAATTAGCCACAAATCCATAGCGA13.3333333333333335No Hit
GTAGCAACAAGGTCGTGTTTAAACAATTCGACCATAAATGATGGCAATCC13.3333333333333335No Hit
GTACATGAAGGGTATGAAGAATTCTCTATGGTTGGGAGAAGAGCAACAGC13.3333333333333335No Hit
TTCCTGGATTCCCAAGAGGAATCGTTCTATTCTCAACACAAGCCAAAGGG13.3333333333333335No Hit
CCTATAATGTTATCAAACAAAATGGAAAGACTAGGGAAAGGGTACATGTT13.3333333333333335No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers