FastQCFastQC Report
Fri 2 Oct 2020
HTGTLBGXG_n01_S1_R2_C01_FD.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHTGTLBGXG_n01_S1_R2_C01_FD.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC44

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
AGCAGAGTCCGATCACACAGGGCCTTAGAAACCACATTTACGAATTTTGA14.166666666666666No Hit
GGTGAGCTACATTGCCACAGAAGAAAGTCTGCTGATCATCCACGAAACCC14.166666666666666No Hit
CAGTACGGCAGCTCGAATTGGAAAACCTTACATCTCAAGAAACTCGAGAG14.166666666666666No Hit
CCTGCTGCTGCCACTGCTCCTGCTCCTGCTGCTGCTCCTGCTGCTGCTCC14.166666666666666No Hit
TGTATATACAGCTCGCTGAAGAGGTCCATGACCTCAAAAAAGATCAAATG14.166666666666666No Hit
GAAGGATGATTTTGATCAAATATTAATTATTTATGCTATTAACATATTTA14.166666666666666No Hit
ATGTAGTTGAAGAGATTGCAGTAGTTGTAGTAGGACTCAAACCTCTGCTC14.166666666666666No Hit
CCAAATTCTTCGCAGATAGAATCTTTTAATCCATCGATAGAAGGCCTTCT14.166666666666666No Hit
CTCATATATAAACCATTTTGGAGAACTGTGTGGCAGTTTTTTAGTAAAGT14.166666666666666No Hit
GGAGAAGGAGCAACAGAAGCAGGAGAAGGAGCGCCAGAAGCAGGAGAAGA14.166666666666666No Hit
GTCCTTAATACCCATCATCCAGTTATCCCTTTGCCTCACCCACCTCCCCT14.166666666666666No Hit
CCTTAGCATTTATCACAGCTGTAATTGATTATTCTTAAGATTATTTAATG14.166666666666666No Hit
TCCTTGATCAGACCAGGTCTCCTCCTACCTCAGGGCCTTTGTACCTGCTA14.166666666666666No Hit
CCATCTTTCAGATTCTTGGACAGAGTGAAGGAAAGTTCAAGACTAAATTA14.166666666666666No Hit
CTCCTGAGGAGTGGAGATTAGAGAGCCGCGCGGAGAAGTGGGAAAGGAGG14.166666666666666No Hit
TGCTTATTGAGCACAGATTTGCATATGCTTATTGAGCACCAGCTGTGTTC14.166666666666666No Hit
CAATGAGCCTGACTATGTGAATTGCATACCTCTTAACAGGGCCTCCTAGA14.166666666666666No Hit
CTTTTCAGACCGAGATTAAGGAGACGATAAATGAATTTGAAAAAACGGCG14.166666666666666No Hit
CTTTAAAAGTATTAAAATTATTTAATGGCTGTTTTTCTACTTCATTGATA14.166666666666666No Hit
CATATATACTTACACAGTTTGAGCATTCACAGGCCACTAGAAGCCCATCT14.166666666666666No Hit
GCGCAGGCGCTGCACCTCGGGGAGCGCATGCAGGAGGCCAAGAAGCTGCT14.166666666666666No Hit
TCCGTACTGAGCACCGGCTATGAGCGGGCCACTGGGCCAGGCACTTGGCG14.166666666666666No Hit
ACCCAAAGGAAATGCATTTTTACTGGAAGCTGCTGTGGTGCCAACTCCAG14.166666666666666No Hit
GGATGGAGCAGTGGCTGTACTATAATAAATCGGTATAAAACAACATACCA14.166666666666666No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.5)