FastQCFastQC Report
Fri 2 Oct 2020
HTGTLBGXG_n01_S1_R2_B03_FD.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHTGTLBGXG_n01_S1_R2_B03_FD.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC43

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGTATGAAGAATTCACAATGTTTGGTAGAATAGCACCAGATATTCTCATA14.166666666666666No Hit
CCACTCCCCTGGGTGACTCTCCGATTGGCCATGTTTCAGATTTGTTTTCA14.166666666666666No Hit
TGTGAAGATTCCGTATATTGTATAAGTTTGGTCCTCCATCTGATACTAAT14.166666666666666No Hit
GGCAAGAGAAGACCCCCGCACTCAGAATGAAGTGGATGATGGCAATGAGC14.166666666666666No Hit
TTTTTGGACAGTATGGATAGCAAATAGTAGCATTGCCACAACTACTTCAG14.166666666666666No Hit
CCATGGCCTCCACCATGCTAGAAATTCCAACCGGTCTCCTATATGAACTG14.166666666666666No Hit
GCTATATACATTTGCACCCGCAAATGCAGCCACATTATGTATAGGTTATC14.166666666666666No Hit
GCTTCATATAGCCCCCCAAGATCGAAGGTTCCAGGTTCCAGGTTGTCCCT14.166666666666666No Hit
CACATTTACTGGCAAAATCTGTATTCAACAGTCTATATGCGTCTCCACAA14.166666666666666No Hit
GGCTCATAGATGGACTGTGGAGCGAGTCTCTGAAGGGCGGGTGCTATTGT14.166666666666666No Hit
GAATAAAAGAACTGAGAGATCTAATGTCGCAGTCCCGCACTCGCGAGATA14.166666666666666No Hit
GGACAAGTTAAATTCATTATTTTTGGCGTCTGATTTCTTAAATGGTGGAA14.166666666666666No Hit
GTAGAAACAAGGTCGTTTTTAAAAAATTCTACACTAATTGATGGCCATAC14.166666666666666No Hit
CCTTTACCCGCAATGAACTGAGAATTGGACAATAACTTATTCGTCATAAC14.166666666666666No Hit
CACAAAATGATGCAGCTTAAATCACTAATGGACAACTACTTCGATAGAAC14.166666666666666No Hit
GGAACAGATCTTCATGATCTCAGAGAACTCGTCTTTCTTGATCCGTCCAG14.166666666666666No Hit
CCCTTATACTAGAGATCCTACATACAGCCATTGAACAGGAACCTGATCCA14.166666666666666No Hit
ACCTACTTCAGTGCATGTGTGAGGAAGGAGTTGACCCAATATGCATTACG14.166666666666666No Hit
GCCATGGAACAGGAACAGGATACACAATGGACACAGTAAACAGCACACAC14.166666666666666No Hit
ATCCAATGATCGTCGAGCTTGCGGGAAAGGCAATGAAAGAATATGGGGAA14.166666666666666No Hit
GTGTGTCGCAAAGCAAACTATGGCGTAGAGGCACCATAAGGGCGTACTCA14.166666666666666No Hit
AATCAGACTAGGCAGATGCTACATGCAATGAGAACTATTGGGACTCATCC14.166666666666666No Hit
GTAGAAACAAGGTCGTTTTTAAACAATTCGACACTAATTGATGGCCATCC14.166666666666666No Hit
TGTTGTGAGAAATATGATGACTAATTAACAAGAAACAGATATTTATTTCA14.166666666666666No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.5)