FastQCFastQC Report
Fri 2 Oct 2020
HTGTLBGXG_n01_S1_R2_B01_FD.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHTGTLBGXG_n01_S1_R2_B01_FD.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC44

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GAATGGGAGACCTTCACTACCTCCAGAGCAGAAATGAAAAGTGGCGAGAG14.166666666666666No Hit
TCTTTTCATTGCCCCCTACTGGGAGCCCAGACTGTTCAAGCTTTTCGCAA14.166666666666666No Hit
ACCTTTGATTGGGTTTGATCCCACAGCTTCTTTAACTCAAATGATCTTCT14.166666666666666No Hit
TTACACAGAAACCCCACAGACGAAGAAAAGGTACATTGGACTCACCAAAC14.166666666666666No Hit
GTAATGAACTGTACTTGTTGTTGGGCCATTCCTATTCCACCATGTTACGG14.166666666666666No Hit
AAGAAAAAGGAGAGTAAGAGACAACATGTCCAAGAAGATGGTCACGCAAA14.166666666666666No Hit
GCCATGGAACAGGAACAGGATACACCATGGACACAGTAAACAGAACACAC14.166666666666666No Hit
GGCCATGTTTCCGATTTGTTTTCAAAGAATTCCTTGGTCATGTCTTTCTC14.166666666666666No Hit
CCCTTGGGTGTTTGACAAGTTGTATTGCAATCGTGGACTGGTGTATCTGA14.166666666666666No Hit
GCCTCAACTTCTACTGTGCATGTTTGAGGATGTACAACCAGGTAGATCGA14.166666666666666No Hit
CAGGCAGCGGAGGCCATGGAGGTTGCTAATCAGACTAGGCAGATGGTACA14.166666666666666No Hit
ACTGAAAGACGAGCTAATCCTCAACCCTATTGCTGCCTTGCATATGTCTA14.166666666666666No Hit
GTTGAGGATACTGGTAAGAGGCAATTCTCCAGTATTCAATTACAACAAGG14.166666666666666No Hit
GAGACTGGAAATTGTCTTTGCAGGAAAGAACACAGCTCTTGAGGCTCTCA14.166666666666666No Hit
AGTAGAAACAAGCCATTTTTTCATGAAGGACAAGTTAAATTCATTATTTT14.166666666666666No Hit
AAACAAGGGTGTTTTTTATCATTAAATAAGCTGAAACGAGAAAGCTCTTA14.166666666666666No Hit
TCACTCAATGAGTGACATCCAAGCCATTGAGTATCAAGGCACCAAACCAT14.166666666666666No Hit
TGCATGGGCCTCATATACAACAGGATGGGAACAGTGACCACAGAAGCTGC14.166666666666666No Hit
GTTCTTCAATGGTGGAACAGATCTTCATGATCTCAGAGAACTCTTCTTTC14.166666666666666No Hit
AATTGATGGCCATCCGAATTCTTTTGGTCGCTGTCTGGCTGTCAGTAAGT14.166666666666666No Hit
GCACTTAACCCAAGGGACGTGCTGGGAGCAGATGTACACTCCAGGAGGAG14.166666666666666No Hit
GGATTTGCTGAGCTTTGGGTATGAATTTCCTTTTTTAACTAGCCATATTA14.166666666666666No Hit
ATGATCGCCTGCTCCAATCGCAAGCAAAGAGGGCCTATTATCTTTTGCCT14.166666666666666No Hit
CCCAATGATATTTGCTGCAATGACGAGAGGATCACTTGAATCGCTGCATC14.166666666666666No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.5)