FastQCFastQC Report
Fri 2 Oct 2020
HTGTLBGXG_n01_S1_R1_F05_FD.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHTGTLBGXG_n01_S1_R1_F05_FD.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences15
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC52

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
AGTAAGTTGAACGGGAGGAAGCATGTCTCCAGAACACATCTGGTTAACAC16.666666666666667No Hit
GGGCAGCACCTGCCTTCGGGTCAGGTTCAAGATCCCAGGGTCCTGAGATC16.666666666666667No Hit
CATCTGCGAGGGGAAATGCTGTCTTTCTGAGAGGCATCGACAGTTTCTGA16.666666666666667No Hit
AAGTAGATCGATTCGAGCCGAACGGCTGCATTGAGGGCAAGCTTTCCCAA16.666666666666667No Hit
CTTGGTGGCCGTGGCCGTGGCCAGCACCACCTGCACACCATCGTCCCTGT16.666666666666667No Hit
GTGGTAGATGCTATTATTTTTCCCATTTGACCCCTGAGGAAACAGGGCAG16.666666666666667No Hit
GCCATCGGTTCCATAGCCTTTGCCGTAGTGCGAGCCAGCACAAGTCTGTT16.666666666666667No Hit
GTCCCTAAGGCAACCAGAAGCCGGTACAGTGGATTCGTAAGGACACTGTT16.666666666666667No Hit
GTGGGTTTCCAGGCTGGTATTGTGCGTAGGCTTGGTATATCGGCAGGGTT16.666666666666667No Hit
TAGTAGTATCAAGGTCTCTAATCGGTTAAAGATTACACTGAAGTTCGCTT16.666666666666667No Hit
CCCAAATGAAGTGGGGGCAAGAATACTGCCATCAGAGTCACAGCTGGCAA16.666666666666667No Hit
CTCTGACACAGGGGCGCCACCAGCCCGGTTCCCTGTGGGACACCGCTCAG16.666666666666667No Hit
CCCAGCAGGTATAGCAAACGGCGTTCTACAAGTTCTCAAGTTTGCCCCAT16.666666666666667No Hit
TCCCTCAGCAGGTCTTGATGTAGGAAGATGTGTTTGGTGCGTGAGCTCAT16.666666666666667No Hit
CCATAACTGAAAGCCTGTATCGCCCACTCATCTTCACCCATTTTACCCAT16.666666666666667No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.5)