FastQCFastQC Report
Mon 24 Feb 2025
HT5K2DRX5_n02_CIVIR_Ferret_Flu_Tissue_P3_F7.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHT5K2DRX5_n02_CIVIR_Ferret_Flu_Tissue_P3_F7.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences15
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC38

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[WARN]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CCCTTATACTGGAGATCCTCCATACAGCCATGGAACAGGAACAGGATACA16.666666666666667No Hit
CATAGCACTTGAACCCAGGGATCATGACCTGAGTTGAAGCCAGTGCCTTA16.666666666666667No Hit
GTGACTCAATACAAAAAAAAACCACATAATTAAAAAAAATATCACTCACA16.666666666666667No Hit
CTGGGTGGCTCAGTGGCCTTCAGCTCAGGTCATGATCCCAGGGTCCTGGG16.666666666666667No Hit
CTAAATTATACCATCTTACATTCATCAAGACAAACATCAAAATCATAAAC16.666666666666667No Hit
AATAAAGCAAAAATAAACAAAAGTGCAAACATTCACTTTGAGTCCTAAGC16.666666666666667No Hit
ATCCAGTGTCCAACAAAATCCAACTGCACAACATGCAGGCTACTACTGAA16.666666666666667No Hit
AATAAAACGACATAAAAGTACCAATTAGAACTCAGACATCAATTACACAA16.666666666666667No Hit
GATATACACAGTTTTTCAATAAATTATGTCATTGGTGTTACTGTAATTTG16.666666666666667No Hit
TGGATGTATTTTATAAAGAAGCCCCTAAATTCCGTATGGGAGCTGTCTCT16.666666666666667No Hit
GTGTTATTAAATCTTATGATTAGGAAATTTTCAACTGAAAAATTTATGAA16.666666666666667No Hit
GAGATCAGGGAACTATTAAAAGTATTTCATCCATTTAAGATATCCAAAAG16.666666666666667No Hit
AAAGAAAACTGAAGACAGTTCAATTGCCATGTTTAAATGATCACTTCTCT16.666666666666667No Hit
CCTAAGTAGTGAGGGATCATCGGACCAATCTCGCACCACTCTTGGATACC16.666666666666667No Hit
ACCTAATATTTATATAACAATGCATGGCAAATTTCAAAGGACTGAAATCA16.666666666666667No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)