FastQCFastQC Report
Mon 24 Feb 2025
HT5K2DRX5_n02_CIVIR_Ferret_Flu_Tissue_P3_F3.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHT5K2DRX5_n02_CIVIR_Ferret_Flu_Tissue_P3_F3.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC46

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GCCTGATGTGGGGCTCGATCCCGGGACCCTGGGATCATGACCTGGGCCAA28.333333333333332No Hit
CATGCATCCAGGTAAGACAATGACAGGAGCTGAAGTAAGTTCAAAGGCTA14.166666666666666No Hit
CCCTATATCTTGTTATCATAAAATCAAAAACTTAAGAAACACCTATGACT14.166666666666666No Hit
GATAGTTTCTGTCTTCAAGTGCCTTGAGCTTTTCTTTTATGGTCTCTGTT14.166666666666666No Hit
GTTAAATTCATTATTTTTGCCGTCTGAGTTCTTCAATGGTGGAACAGATC14.166666666666666No Hit
TGACAAAACATTCCCCATTAACATATATATTATTACAAAGTATATGCCGT14.166666666666666No Hit
AAAAAGTTGAATTCATGAAAATCATAATCAAAATGTAAACAAAATATAAG14.166666666666666No Hit
ACCTTCCACTGTGTAACCAAGTTCTGTTCTGTTAACAATCTGTCTCTTAT14.166666666666666No Hit
AGCTTATGGAAGCCAAGTCTTCCTTGAACTTGCCAGAAGTTCCTGACAAG14.166666666666666No Hit
TGTCTATATGGCACCAACTTTCTTCCACCATTTTCTTTCTGTCTCTTATA14.166666666666666No Hit
CTGTCAGTAAGTATGCTAGAGTCCCGTTTTCGTTTCATTACCAACACCTG14.166666666666666No Hit
GGTTCTCTGAGTTCCACAATTTCCCCAGCACGAGGACTGGTTTGATAATC14.166666666666666No Hit
ACACAAGACATCACACAAACCCCATACAGGAGCAACCTCCGGCAACCTTA14.166666666666666No Hit
ACTAAATACTCATCTGCCTGAGTATGGTTAGGATTTGAATACTTCACCTG14.166666666666666No Hit
GGGTGTTGCCTCTTCCTTTTAAGGACTTTTGATCTCGGCGGAGCCGATCA14.166666666666666No Hit
CTTTTTTATTATAGATGCACAGAAACTAAAGAAAAAGGTTGAAGAAATAA14.166666666666666No Hit
GGGAGAGAGAGAGAAATGACCCACATTGCTGGGATCAGCAATGAAAGAGG14.166666666666666No Hit
AACCAGACAAGATATTAAGGCAACAAATACACCGAATGATCAACAAAGAC14.166666666666666No Hit
TAACAGTACAGAAACATTCAAATTACCTTGAGTTCCTACTACCAAGAAGC14.166666666666666No Hit
AACCAAAAATGTGCCAACCTGAAGCCATCTCAAACAACCACATCCTGCTC14.166666666666666No Hit
AACAAGGGGTGGGATGTGATGGGTAAAAGGTGGTCCTGTCTCTTATACAC14.166666666666666No Hit
GTTCTCAAAGGGACTGTTAGCACGGTGGAATAGTAGGGCCTGTCTCTTAT14.166666666666666No Hit
ATTATGTGTCCTAGAAACCTATGAACCATGTTTAAGCATTTCACCCTCCA14.166666666666666No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)