FastQCFastQC Report
Mon 24 Feb 2025
HT5K2DRX5_n02_CIVIR_Ferret_Flu_Tissue_P1_G4.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHT5K2DRX5_n02_CIVIR_Ferret_Flu_Tissue_P1_G4.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC40

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[WARN]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
AAAATCAAAAATACCACTCACGAACAAAAGACAACATAAAAAAAAACACA14.166666666666666No Hit
TTAATTCAAACCAAGATAAGCTGAATCTTTAACCAAGCAGAGACCTGTCT14.166666666666666No Hit
CCACATTCCCTTATACTTGAGATCCTCAATACCTGTCTCTTATACACATC14.166666666666666No Hit
ATCGAGGAGAGCCTCATTAATGATCACTGGGTTTTGCTTAATGCATCTTG14.166666666666666No Hit
TATCTAATCTACAAAACACACACACTCTATAGAAACACTAACAAAAAAAA14.166666666666666No Hit
TAATCAACATGAATAAATATAGGAAATAACAAGAAAAAACCAAAATAACA14.166666666666666No Hit
CAAAGACAAAAAACTACACAAAAACAATCAAATGATCTACGAGATACCAG14.166666666666666No Hit
ACTGAGGAGGGAGCAATAGTTGGAGAAATTTCACCATTACCTTCTCTTCC14.166666666666666No Hit
TTAAAAAACTGTTAATACAGAGTATCTAGAAATGTTCTCAATATAAAAAA14.166666666666666No Hit
ATCTCATTGCCATCATCCACTTCATTCTGAGTGCGGGGTTCTTCTCTTGC14.166666666666666No Hit
CTATTCAACTGTCGCCAGTTCATTGGTACTGGTAGTCTCCCTGGGGGCAA14.166666666666666No Hit
AATCGGCACACATTTAACAAATAATAGAAAATGGAAAATTCTTCAACTCT14.166666666666666No Hit
TAAAGCTACAGAACCGTTTTCTATTAATTAAAAACACTACCTCCCATTGC14.166666666666666No Hit
GTCTCTAATCGGTTAAAGATTACACTGAAGTTCGCTTTCAGTACTATGTT14.166666666666666No Hit
GTCAGTAAGTATGCTAGAGTCCCGTTTTCGTTTCATTACCAACACTACGT14.166666666666666No Hit
ACAAAAATTGATGGCCCTAACAAATCTTTTGGTCGCACTCTGTCTGTCAT14.166666666666666No Hit
TACTCATTGATTATGTCCATATGTTCCACAGTGGTATTAGAGAGTATCTC14.166666666666666No Hit
ACTCTAGACCTCCGTTGAGTACGCCAAATGCAATATTCACGACCTCAAGA14.166666666666666No Hit
ATATAAAAACTGAAACGAAAACTTAAAACATAATCTCATATTTGAATAGT14.166666666666666No Hit
CTCGCGAGATACTCACTAAGACCACTGTGGACCATATGGCCATAATCAAA14.166666666666666No Hit
TTCATGATAAGTCCATACACGAAGTATACACTTGCATAAAAAAGGGCCAA14.166666666666666No Hit
CCATATTGCCATAATCAAAAAGAACAAATCAGGAAGGCAAGATAAGAAAC14.166666666666666No Hit
GTAGAAACAAGGTCGTTTTTAAACAATTCGACACTAATTGATGGCCATCC14.166666666666666No Hit
GTTCACAAGTGGCACACACTAGACCAAAAGCAGCTTCTGTGGTCACTGTT14.166666666666666No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)