FastQCFastQC Report
Mon 24 Feb 2025
HT5K2DRX5_n02_CIVIR_Ferret_Flu_Tissue_P1_D6.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHT5K2DRX5_n02_CIVIR_Ferret_Flu_Tissue_P1_D6.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC48

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GTTGAACCAAGATGCATTAAGCAAAACCCAGGGATCATTAATCAGGCACT14.166666666666666No Hit
TATGGAGAGAATAAAAGAACTGAGAGATCTAATGTCGCAGTCCCGCACTC14.166666666666666No Hit
GAATAAAAGAATTCGGATGGCCATCAATTAGTTGTCGAATAGTTTAAAAA14.166666666666666No Hit
CACCTTGTTCATTCCTCTCTGGAATCATGTCCATTATTCTCTTGTCTGCT14.166666666666666No Hit
GGACAAGTTAAATTCATTATTTTTGCCGTCTGAGTTCTTCAATGGTGGAA14.166666666666666No Hit
CCCAATTACAGCAGACAAGAGAATAATGGACATGATTCCAGAGAGGAATG14.166666666666666No Hit
CCACAAAACTAAAAATACCAAACTAACTCCTAAATCACTCACTCTAAAAA14.166666666666666No Hit
GGCATCGTGTTTGTCGTCCACTTTCCCTTTTCTGAGTATTGGTGTGTTCC14.166666666666666No Hit
ACTGTGGACCATATGGCCATAATCAAAAAGTACACATCAGGAAGGCAAGG14.166666666666666No Hit
CAATATGGAGAGAATAAAAGAACTGAGAGATCTAATGTCGCAGTCCCTGT14.166666666666666No Hit
GAACAATAGATTAGTGAAACAAACTAGGCACCATGGAACGATATTTCTCT14.166666666666666No Hit
GAGGGAAGGGGGTGGGGGGGGGGGGGGCGGGGGGGGGGGGGGCGGGGGGG14.166666666666666No Hit
AGCAGGTACTGATCCAAAATGGAAGACTTTGTGCGACAATTCTTCAATCC14.166666666666666No Hit
AGATATGAGAAGGCAAAAAAAAAAATCAGACAGAAATTAAGTCTGTCTCT14.166666666666666No Hit
GTATAAGGGAATGTGGTGCTTATGGCATTTCTGTCTCTTATACACATCTG14.166666666666666No Hit
AAAAAACAAAAAATCAAACCCAAAAAACAGAAAAACACTCATCACATCAG14.166666666666666No Hit
CTAGTATATAAGCATGCAAATCCATGAATAGCTGAACCAGCAGCTGTCTC14.166666666666666No Hit
GTCTGGCTGTCAGTAAGTATGCTAGAGTCCCGTGTTCGTTTCATTGCCAT14.166666666666666No Hit
TGATTCCAGAGAGGAATGAACAAGGACAAACCCTCTGGAGCAAAACAAAC14.166666666666666No Hit
CCAGAGGTGATACCATCACTCGGTCTGATCCAGCATCGTTTGTTTTGCTC14.166666666666666No Hit
TATCAACTATTCCCGTAAACAAGTCGAAAATCAATTTCCCAACAAAAAGT14.166666666666666No Hit
CACACTAAACACAATATAGAAATCTACTAATGAAAACATAAACATATCAA14.166666666666666No Hit
TATCACTATTCTAAAGGCGTAAGGAACAGAAATCTGTCTCTCATCCTGCT14.166666666666666No Hit
TAGTAGCATTGACACAACAACTTCAGTGCATGAGTGATGAAGGAGTTTAA14.166666666666666No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)