FastQCFastQC Report
Tue 25 Feb 2025
HT5K2DRX5_n02_CIVIR_Ferret_Flu_Tissue_P1_D3_new.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHT5K2DRX5_n02_CIVIR_Ferret_Flu_Tissue_P1_D3_new.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences15
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC43

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CAGGAACCCATATTTATGTTTTTTAAAGATGTATACATTTATTTTAGAGA16.666666666666667No Hit
ATCGAAAACAGGATATAATAAACAATAAAAAAGACCAGTAATACATAAAT16.666666666666667No Hit
ATTGATGGCCATCCGAATTCTTTTGGTCGCTGTCTGGCTGTCAGTAAGTA16.666666666666667No Hit
CTAATAAGCAGAAACAGACATGAAAACAGAACCCAGAAAATATATCAATA16.666666666666667No Hit
AATCAACACAAATCAGATCACAAGATGAAACGAAAAAAAAAACATTTATT16.666666666666667No Hit
CCTCTGCATTGAATCCTAACAAAAAATACCATTCATTAATCATGTAAAAC16.666666666666667No Hit
CCTTAGGGTAATGAACTGTACTTGTTGTTGGGCCATTCCTATTCCACCAT16.666666666666667No Hit
ATCTTAGACCCTGAAACATGATTCTAAGTACATCCACAAAACTAACACTG16.666666666666667No Hit
GGACCATATGGCCATAATCAAAAAGTACACATCAGGAAGGCAAGAGAAGA16.666666666666667No Hit
GAATCACCCTCACTGCACAGCGGTGAGACAGATTCTCCCTCTGCCTAAAA16.666666666666667No Hit
GGGCTCACTCCCAGGACCCTGGGATCACGCATGACCTGAGCCTAAGGCAG16.666666666666667No Hit
GCTGTCCTGAGAGGATTTCTCATTTTGGGCAAAGAAGACAAGAGATATGG16.666666666666667No Hit
CCCCTGCTCTCTACACTTCAAAGATTTCTGCTATTAGAATAAGGTTCTGT16.666666666666667No Hit
TTCCTATTCCACCAATATACGGCCAGAGGTGAAACCATCACTCGGTCTGA16.666666666666667No Hit
GTGCCGCATTTCTTCAATTAACCACCTTATTTCCTCAAATTTCTGTCCCA16.666666666666667No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)