FastQCFastQC Report
Mon 24 Feb 2025
HT5K2DRX5_n02_CIVIR_Ferret_Flu_Tissue_P1_A6.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHT5K2DRX5_n02_CIVIR_Ferret_Flu_Tissue_P1_A6.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences30
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC46

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GCATTAAGCATCAATGAACTGAGCAATCTTGCAAAAGGAGAGAACGCTAA26.666666666666667No Hit
CCTATCGACATATTCTAAATAAGTTTTCTATACCTTAGGGTAATCAACTG13.3333333333333335No Hit
CTATTTGGCTCTACAACTGATTAGTTCAAACAACAATAACCGTCATAAAC13.3333333333333335No Hit
AGGAATGAACAAGGACAAACCCTCTGGAGCAAAACAAACGCTGTCTCTTA13.3333333333333335No Hit
GTTCTTCTCTTGCCTTCCTGATGTGTACTTTTTGATTATGGCCATATGGT13.3333333333333335No Hit
GAATAATATGGCCCAGCATTAAGCATCAATGAACTGAGCAATCTTGCAAA13.3333333333333335No Hit
AATAAATAACGAATAATAAAAAAAACACAAAGTAAAAAAAATTAACTTAT13.3333333333333335No Hit
AAAATCTACAAAAACCAAAAAAAAAAAAAAAAAACACAAAAAAAACAATA13.3333333333333335No Hit
GGTCGGAGGTCGTAGGGGGGGGGTGTGGGGTGCGGCGGCGGGGGGGAGCG13.3333333333333335No Hit
GCAGACAAGAGAATAATGGACATGATTCCAGAGCTGTCTCTTATACACAT13.3333333333333335No Hit
GACCACTGTGGACCATATGGCCATAATCAAAAAGTACACATCAGGAACTG13.3333333333333335No Hit
GTCTGGCTGTCAGTAAGTATGCTAGAGTCCCGTTTTCGTTTCATTACCAA13.3333333333333335No Hit
GGTTAAAGCCTCTGCCTTCGGCTCAGGTCATGATCCCGGGGTCCTGGGAT13.3333333333333335No Hit
CAGGGGGAGAGGGAGAAGTAGGCTTCCCTCTGAGCAGGAAGCCAGATGTG13.3333333333333335No Hit
CGTTTGTTTTGCTCCAGAGGGTTTGTCCTTGTTCATTCCCTGTCTCTTAT13.3333333333333335No Hit
GTGATACCATCACTCGGTCTGATCCAGCATCGTTTGTTTTGCTCCAGAGG13.3333333333333335No Hit
GTAACATGGTGGAATAGGAATGGCCCAACAACAAGTACAGTTCATTACCC13.3333333333333335No Hit
TGTTCATTCCTCTCTGGAATCATGTCCATTATTCTCTTGTCTGCTGTAAT13.3333333333333335No Hit
CCGTAGACCATTTCCTCCACCTAAGACATAATAACACCTGTCTCTTATAC13.3333333333333335No Hit
GCACACCGCCCATGCCCTGGGATGGGGAGTAATGGGAAAATGTCCCTGTT13.3333333333333335No Hit
CTTACTGACAGCCAGACAGCGACCAAAAGAATTCGGATGGCCATCAATTA13.3333333333333335No Hit
CAAGCTGACAGGACACAGTGACCAAAGCTCTTCCAAGTGATTTCTTTAAA13.3333333333333335No Hit
GAATCATGTCCATTATTCTCTTGTCTGCTGTAATTGCTGTCTCTTATACA13.3333333333333335No Hit
CAAAGAATGAGCAGATCAGAGATGATTATTCATGGAACCTAAGATTTATA13.3333333333333335No Hit
ACATTAAATATTACACATGAACAAGTAGCATACACAACTCAGGAAAGAAT13.3333333333333335No Hit
ATTATTGAGTACACTATAGATGCCAAGCATGGAATTACTTTACATACATC13.3333333333333335No Hit
ATTTAACAAAATACTAATTCTATTACAATAAAACTCCAATTAATAAAATA13.3333333333333335No Hit
CCATTTCACAGATGAGCATACTAAAGCTAAAACGGGAAATTTAATTCACT13.3333333333333335No Hit
GTAGCAGGCTCCCCGCTGAGCAGGGAGCCTGATGCAGGGCTCTATCACAG13.3333333333333335No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)