FastQCFastQC Report
Mon 24 Feb 2025
HT5K2DRX5_n01_CIVIR_Ferret_Flu_Tissue_P3_F7.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHT5K2DRX5_n01_CIVIR_Ferret_Flu_Tissue_P3_F7.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences15
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC45

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CCATTACACAAATCATTTGGCTGGGAATGGAACATTTACCATATGTATGA16.666666666666667No Hit
CAACACTAATAAGGAATCAACATTTAAAACTCCAATAAAGAAAATCAATA16.666666666666667No Hit
TTTAAGAACTGTTTTCTGTAATAGTCCAAGAAGGGAATGAGAAGAGAAGT16.666666666666667No Hit
GAGCTGAAATAAACATAATACAGCTACTCACACTCAGAAGGCCATGGGAG16.666666666666667No Hit
GGGCCCACAAAGGCAAACATGCCCACAGCATTTCCAGGAACCACGGACGT16.666666666666667No Hit
GTGTAATTCCGTAACAGTCTCTGTGCGTGATTTCAGTCCTTTGAAATTTG16.666666666666667No Hit
CAGGGAAGCAGACAGAGAGGAGGAAGCGGGGTCCCCGCTGAGCGAAGAGC16.666666666666667No Hit
CTCCCATACGGAATTTAGGGGCTTCTTTATAAAATACATCCACTGTCTCT16.666666666666667No Hit
GTCGTAGGTGGAGGAAATGGTCTACGGATTCATGTTTGAATTGTGCAATA16.666666666666667No Hit
ATATAATAATGAAGAATCATGGCACGCCTGGGTGGCTCAGTAGTTAAAGC16.666666666666667No Hit
GAACTCTTCTTTCTTGATCCGTCCAGACTCGAAGTCGACCCTGGCATCAA16.666666666666667No Hit
ATAAAAAAAAAGATAATAACACATTACAAAACAACACAACACATAAGAAA16.666666666666667No Hit
AGGCAGGGTCTCCTGGGACTGGGGCAGAGAGCAGGACAGTGGGAGACAGG16.666666666666667No Hit
AAACAGAGATATAAAACAAAACCAAAGGATATTTAAAAGAAATAAACTAC16.666666666666667No Hit
CTTATGAGGATGTCAAAAATGCAGTTTGGGTCCTCATCGGATGACTTGAA16.666666666666667No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)