FastQCFastQC Report
Mon 24 Feb 2025
HT5K2DRX5_n01_CIVIR_Ferret_Flu_Tissue_P3_F3.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHT5K2DRX5_n01_CIVIR_Ferret_Flu_Tissue_P3_F3.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC49

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GTCATTAAGCATCTGCCTTTGGCCCAGGTCATGATCCCAGGGTCCCGGGA28.333333333333332No Hit
GGCATATCCGCAAGCGATTTGCAGACAATGGATTGGGTGATGCCCCATTC14.166666666666666No Hit
ATTGTTAACAGAACAGAACTTGGTTACACAGTGGAAGGTCTGTCTCTTAT14.166666666666666No Hit
GTGAAGGATGCAAATCCTAACCATACACAGGCAGATTAGTATTTACACAG14.166666666666666No Hit
GTTCAGATATGCTCATACCTTTAACCCCTAGGCTAAAGGGAAACCTTGAC14.166666666666666No Hit
AAAGAAAATGGTGGAAGAAAGTTGGTGCCATATATACACTGTCTCTTATA14.166666666666666No Hit
TCACATATCACAAGAAATCATTCTATAACCCACCAACTTTCTAAAAAAAA14.166666666666666No Hit
ACATAGTTAAGACATAATAATAATCAGATAACAGAAAAACATAAAGTTAA14.166666666666666No Hit
GGGTAAAGGGGTTCATACTCAAATTCATAAACCTCCAGAGTTTCATGTTC14.166666666666666No Hit
GATGGGGGGCCCGTGGGAGGGAGGCCTGAAGGGCAGAAACTCGGGGACAA14.166666666666666No Hit
GTACTAATATCACCTCTTTCATTGCTGATCCCAGAAATGTTGGTCATTTC14.166666666666666No Hit
GACCACCTTTTACCCATCACATCCCACCCCTTGTTCTGTCTCTTATACAC14.166666666666666No Hit
CTAAAAGAGAATGTAATCTTCAAAAAAATAAAAATAATGCTCCCACCTCA14.166666666666666No Hit
CTTCTTGGTAGTAGGAACTCAAGGTAATTTGAATGTTTCTGTACTGTTAC14.166666666666666No Hit
CCAGCGATCCAAAAGACTAAGCAATCCCAAAGAAGGATACCCTTTTAAGT14.166666666666666No Hit
ACAGGAGATTGTACCCATGAAAAAGGAGCAGTCAGACATAATGAAAGACT14.166666666666666No Hit
GCCCTACTATTCCACCGTGCTAACAGTCCCTTTGAGAACCTGTCTCTTAT14.166666666666666No Hit
GTGTTGGTAATGAAACGAAAACGGGACTCTAGCATACTTACTGACAGCTG14.166666666666666No Hit
AATGTCGCTTCCCTACTTCGTCTTTACAGTAGCCTTTGAAATTACTTCAG14.166666666666666No Hit
GGACTGGCCACAGAGTGTGTTTATGATTATATGAAGGACTGACAAACTGT14.166666666666666No Hit
CCTTAACAGAGACCATAAAAGAAAAGCTCAAGGCACTTGAAGACAGAAAC14.166666666666666No Hit
CTCTGAGATCATGAAGATCTGTTCCACCATTGAAGAACTCAGACGGCAAA14.166666666666666No Hit
GCTCAATCCCAGGACCCTGGGGTCATGACCTGAGCCGATGGCAGATTCTT14.166666666666666No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)