FastQCFastQC Report
Mon 24 Feb 2025
HT5K2DRX5_n01_CIVIR_Ferret_Flu_Tissue_P1_G4.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHT5K2DRX5_n01_CIVIR_Ferret_Flu_Tissue_P1_G4.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC43

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[WARN]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CAAATTGCCAGAACAATGAGAATCAAATAAAAAGATTCAGCCGAAAACAC14.166666666666666No Hit
GGATCTTCAGTCAATGCACCTGCATCCTTTCAATTGCCATCATCCAATTC14.166666666666666No Hit
CCCTTATACTGGAGATCCTCCATACAGCCATGGAACAGGAACAGGATACA14.166666666666666No Hit
AAAAAAAATCCATACTAATTCTAAAGATCGCTTTAACTATTTCATTAATA14.166666666666666No Hit
AATTGGGCAAGGGGACGTAGTGTTGGTAATGAAACGAAAACGGGACTCTA14.166666666666666No Hit
CATATTTTGAACTAAAAAATTCATATCTGGAAATAATACCAGTACTAGAT14.166666666666666No Hit
AAACTAGGTATAAAATAAAAAATAGCAAACTCAAAAGAAGAAACAATAAT14.166666666666666No Hit
CCATCAATTCTATGATGCAAAACAGATACCAAATAACACCAAACAATAAA14.166666666666666No Hit
TGGAAATAACTTCAACATTCCTCTAAGTAATAATCTCAATAATAAACAAA14.166666666666666No Hit
CAAATAGAAAGATTGATAAGTTCAAAGATCATAAAATCTCTCAAATAAAA14.166666666666666No Hit
GAATTCGGATGGCCATCAATTAGTGTCGAATTGTTTAAAAACGACCTTGT14.166666666666666No Hit
CCTCATAAGTATGTCCTGGAAGAGAAGGTAATGGTGAAATTTCTCCAACT14.166666666666666No Hit
CTGCAGCGTAGACGCTTTGTCCAAAATGCCCTAAATGGGAATGGGGACCC14.166666666666666No Hit
ATAATAGGCCCTCTTTGCGTGCGATTGGACCAGGCGATCATGGAAAATAA14.166666666666666No Hit
GCATTCCCAAAACTACTACAGTGAATGTGTCAGTAAGGAGTTGAACCAAG14.166666666666666No Hit
CAGGAAGGCAAGAGAAGAACCCCGCACTCAGAATGAAGTGGATGATGGCA14.166666666666666No Hit
CACAAGCAATACATCAATAAACAACCAAAATTCCTCAAAAAACACTCACA14.166666666666666No Hit
CTGTAGAGACCCATTAGAGCACATCCAGAAACTGATTGCCCCCAGGGAGA14.166666666666666No Hit
GTATGGAGGATCTCCAGTATAAGGGAATGTGGCTGTCTCTTATACACATC14.166666666666666No Hit
TGTATGGCCCAGCATTAAGCAACAATGAAATTAGAAATCTTGAAAAAGTA14.166666666666666No Hit
ATGGGAACAGTGACCACAGAAGCTGCTTTTGGTCTAGTGTGTGCCACTTG14.166666666666666No Hit
GATCTAATGTCGCAGTCCCGCACTCGCGAGATACTCACTAAGACCACTGT14.166666666666666No Hit
CTTTTCAAACAGTATTTAAAGCGACGATAAATACATTTGAAAAAAAGACG14.166666666666666No Hit
CATCCACTTCATTCTGAGTGCGGGGTTCTTCTCTTGCCTTCCTGATGTGT14.166666666666666No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)