FastQCFastQC Report
Mon 24 Feb 2025
HT5K2DRX5_n01_CIVIR_Ferret_Flu_Tissue_P1_D6.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHT5K2DRX5_n01_CIVIR_Ferret_Flu_Tissue_P1_D6.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC46

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
AACAATAGATAATCAACAGCAAAAATCAACAGACACATTAGAAAACTTTC14.166666666666666No Hit
AAACAATACAAGAAGCTCAAAAGAGAAATAACGAAACATGGTGCCAAGGA14.166666666666666No Hit
GGCCAGAGGTGATACCATCACTCGGTCTGATCCAGCATCGTTTGTTTTGC14.166666666666666No Hit
AAATGCCATAAGCACCACATTCCCTTATACCTGTCTCTTATACACATCTC14.166666666666666No Hit
GCCATATGGTCCACAGTGGTCTTAGTGAGTATCTCGCGAGTGCGGGACTG14.166666666666666No Hit
GTTCAGGCACTTAGGGACAACCTGGAACCTGGAACCTTCGATCTTGGGGG14.166666666666666No Hit
AAAGCAGGATGAGAGACAGATTTCTGTTCCTTACGCCTTTAGAATAGTGA14.166666666666666No Hit
GGACTGCGACATTAGATCTCTCAGTTCTTTTATTCTCTCCATATTGCTGT14.166666666666666No Hit
CTGCTGGTTCAGCTATTCATGGATTTGCATGCTTATATACTAGCTGTCTC14.166666666666666No Hit
GAACACACCAATACTCAGAAAAGGGAAAGTGGACGACAAACACGATGCCC14.166666666666666No Hit
GTATGCTAGAGTCCCGTTTTCGTTTCATTACCAACACTACGTCCCCTTGC14.166666666666666No Hit
CAATTACAGCAGACAAGAGAATAATGGACATGATTCCAGAGAGGAATGAA14.166666666666666No Hit
GAGAAGAACCCCGCACTCAGAATGAAGTGGATGATGGCAATGAAACGAAA14.166666666666666No Hit
ATCCAGCATCGTTTGTTTTGCTCCAGAGGGTTTGTCCTTGTTCATTCCTC14.166666666666666No Hit
TCATTGGATTGAAGCATTGTCGCACAAAGTCTTCCATTTTGGATCAGTAC14.166666666666666No Hit
ACTTAATTTCTGTCTGATTTTTTTTTTTGCCTTCTCATATCTCTGTCTCT14.166666666666666No Hit
AGACAAGAGAATAATGGACATGATTCCAGAGAGGAATGAACAAGGACAAA14.166666666666666No Hit
CAACATTCAAAAATCCTAAAAACAACATTACGTCTTTTCCTATCAATATA14.166666666666666No Hit
CCAAACAGTAATCAACATAAATTGTTTTAATGACAATCAAATTACAAAAT14.166666666666666No Hit
TTTTTAAACTATTCGACAACTAATTGATGGCCATCCGAATTCTTTTATTC14.166666666666666No Hit
GTTGTAAGGCCTGCATAAATGTTATTTGTTCGAAACTATTCTCTGTCGCT14.166666666666666No Hit
CTCTGAGATCATGAAGATCTGTTCCACCATTGAAGAACTCAGACGGCAAA14.166666666666666No Hit
AAGTCACATATTCCGTCAAGTCTGATTTCATGAATAGAATACACATTATG14.166666666666666No Hit
TAAAAAAGTAGACATATTGAAAATAAAACCATTGAGGCACTCACAAATAA14.166666666666666No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)