FastQCFastQC Report
Tue 25 Feb 2025
HT5K2DRX5_n01_CIVIR_Ferret_Flu_Tissue_P1_D3_new.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHT5K2DRX5_n01_CIVIR_Ferret_Flu_Tissue_P1_D3_new.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences15
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC45

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
TGTTAGTTTTGTGGATGTACTTAGAATCATGTTTCAGGGTCTAAGATCTG16.666666666666667No Hit
AGAGAATAATGGACATGATTCCAGAGAGGAATGAACAAGGACAAACCCTC16.666666666666667No Hit
ATGAGTGACATCGAAGCCATGGCGTCTCAAGGCACCAAACGATCATATGA16.666666666666667No Hit
ATTAAAGGTCATATTTGCTTTTAAAACAGATCTCCCCCAGAGCACCTGGG16.666666666666667No Hit
GTGAGAAGAAGTCAGAGTGAGAATCAGACTCACAGATGATCAGGGAGCCT16.666666666666667No Hit
CAACATACAGGATATCTCATTTACCGAAAATAACAAAAAGGATAACTCCA16.666666666666667No Hit
TCAAAAAAGATATACAACTTAAACCAAAATGAAAACACATAAAAGAAAAC16.666666666666667No Hit
GTCGCTGTCTGGCTGTCAGTAAGTATGCCAGAGTCCCGTTTTCGTTTCAT16.666666666666667No Hit
GTTAAGCATCTGCCTTAGGCTCAGGTCATGCGTGATCCCAGGGTCCTGGG16.666666666666667No Hit
GACTACCTCCAGAGCAGAAATGAAAAGTGGCGAGAGCAATTGGGACAGAA16.666666666666667No Hit
ACTAAACACCACCAAGGTGGATATCAATCTTTCGTCATCAACTCTTCATT16.666666666666667No Hit
CTCTTGTCTGCTGTAATTGGGTATCTCATTGCCATCATCCACTTCATTCT16.666666666666667No Hit
CTAGCATACTTACTGACAGCCAGACAGCGACCAAAAGAATTCGGATGGCC16.666666666666667No Hit
GTTCAAAGGCGCGCAAAGTAGAGCAGTACTGTGTTCCCATTCGGTACCCC16.666666666666667No Hit
ACCCTCTGGAGCAAAACAAACGATGCTGGATCAGACCGAGTGATGGTATC16.666666666666667No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)