FastQCFastQC Report
Mon 24 Feb 2025
HT5K2DRX5_n01_CIVIR_Ferret_Flu_Tissue_P1_A6.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHT5K2DRX5_n01_CIVIR_Ferret_Flu_Tissue_P1_A6.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences30
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC46

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CGTTTGTTTTGCTCCAGAGGGTTTGTCCTTGTTCATTCCTCTGTCTCTTA13.3333333333333335No Hit
CTACGTCCCCTTGCCCAATTAGCACATTAGCGTTCTCTCCTTTTGCAAGA13.3333333333333335No Hit
CAATTACAGCAGACAAGAGAATAATGGACATGATTCCTGTCTCTTATACA13.3333333333333335No Hit
GTCCTGAGAGGATTTCTCATTTTGGGCAAAGAAGACAAGAGATATGGCCC13.3333333333333335No Hit
ACATAAATAATAAATAATACAAATAAAAAAAGGAAAAAAAACAACTTAAA13.3333333333333335No Hit
CCATTACACAAATCATTTGGCTGGGAATGGAACATTTACCATATGTATGA13.3333333333333335No Hit
GGGTTAGGTAAAATGATGCACAAGAGATCAGATTCCCTGAAAAGACGTCC13.3333333333333335No Hit
CAAAAAAATAAAATTTTCAACAACAGAATCAATGTCAATTTTCACACACT13.3333333333333335No Hit
AGGCAGACAGAGGGAGAAGTAGACTCCCTGCTGAGTAAGGAGCCCGATGT13.3333333333333335No Hit
ATTAACACATTAGCGTTCTCTCCTTTTGCAAGATTGCTCAGTTCATTGAT13.3333333333333335No Hit
ACTAAGAACAAAGTATAAGAATTAAAAACAAAAGAACCCCCAATAGAAAG13.3333333333333335No Hit
GGATACATATGCAGTGGGATTTTCGGAGACAATCCACGCCCTAATGATAA13.3333333333333335No Hit
ATAATGGACATGATTCCAGAGAGGAATGAACAAGGACAAACCCTCTGGAG13.3333333333333335No Hit
AAAAAAAAAAATTATATAAAAAAATAAAAAACAACTAATCAATAACTTAA13.3333333333333335No Hit
CACTAGGACCACTGTGGACCATATGGCCATAATCAAAAAGTACACATCAG13.3333333333333335No Hit
CTCTGGAATCATGTCCATTATTCTCTTGTCTGCCTGTCTCTTATACACAT13.3333333333333335No Hit
GAATTAACTAACCCCTTTTAGCTTTAGTAGGCTCATCTGTGAAATGGAGA13.3333333333333335No Hit
TTCCTGATGTGTACTTTTTGATTATGGCCATATGGTCCACAGTGGTCCTG13.3333333333333335No Hit
AACTACGTCCCCTTGCCCAATTAGCACATTAGCGTTCTCTCCTTTTGCAA13.3333333333333335No Hit
ACACTTGAATAATGACCATTCCTAATGCACCTGCTTAACCCAATATGTAA13.3333333333333335No Hit
GTGTTATTATGTCTTAGGTGGAGGAAATGGTCTACGGCTGTCTCTTATAC13.3333333333333335No Hit
CCATGGTAGTCAGAAAACCACTGTGGTGGGTCCCTGGGTGGCTCAGTGGG13.3333333333333335No Hit
TTTTTAAACTATTCGACAACTAATTGATGGCCATCCGAATTCTTTTGGTC13.3333333333333335No Hit
TCCTGGAGGAACGGGCAATCAGATGCCGTCTGCCTCCAGGATGTGGCAGC13.3333333333333335No Hit
GGGGTGGAGTCTGCTGTCCTGATAGGATTTCTCATTTTGGGCAAAGAATA13.3333333333333335No Hit
GGAATGAACAAGGACAAACCCTCTGGAGCAAAACAAACGCTGTCTCTTAT13.3333333333333335No Hit
GTCCTGGGATAGAGCCCTGCATCAGGCTCCCTGCTCAGCGGGGAGCCTGC13.3333333333333335No Hit
CCGTAACATGGTGGAATAGGAATGGCCCAACAACAAGTACAGTTCATTAC13.3333333333333335No Hit
GCCATAATCAAAAAGTACACATCAGGAAGGCAAGAGAAGAACCCCGCACT13.3333333333333335No Hit
GGTAATGAACTGTACTTGTTGTTGGGCCATTCCTATTCCACCATGTTACC13.3333333333333335No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)