Sample	FastQC_percent_duplicates	FastQC_percent_gc	FastQC_avg_sequence_length	FastQC_total_sequences	FastQC_percent_fails
HT5CKBCX2_l02_n01_DI222G4_P2CW_rep1	96.3488490553	45.0	151.0	4119949.0	50.0
HT5CKBCX2_l02_n01_DI222G4_P2CW_rep2	96.2090450118	45.0	151.0	3672982.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n01_DI244G4_P3CW_rep1	95.9455498031	45.0	151.0	3523643.0	25.0
HT5CKBCX2_l02_n01_DI244G4_P3CW_rep2	95.7614506517	45.0	151.0	3116767.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n01_KO_Control_M_rep1	79.4719525242	49.0	151.0	2045085.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n01_KO_DI222_F1_rep1	94.513166647	43.0	151.0	3277870.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n01_KO_DI222_F1_rep2	94.773252562	44.0	151.0	3305931.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n01_KO_DI222_F2_rep1	94.7611829042	43.0	151.0	4440034.0	41.6666666667
HT5CKBCX2_l02_n01_KO_DI222_F2_rep2	94.7720436213	43.0	151.0	4100316.0	41.6666666667
HT5CKBCX2_l02_n01_KO_DI222_M1_rep1	95.0577620611	44.0	151.0	3934033.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n01_KO_DI222_M1_rep2	94.9031927489	44.0	151.0	3524499.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n01_KO_DI222_M2_rep1	95.2281204982	44.0	151.0	4523545.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n01_KO_DI222_M2_rep2	95.4105569648	44.0	151.0	4814534.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n01_KO_DI244_F1_rep1	93.9635251189	44.0	151.0	2672020.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n01_KO_DI244_F1_rep2	94.3815564783	44.0	151.0	3035154.0	41.6666666667
HT5CKBCX2_l02_n01_KO_DI244_F2_rep1	95.1790840624	44.0	151.0	4023559.0	50.0
HT5CKBCX2_l02_n01_KO_DI244_F2_rep2	95.4631958386	44.0	151.0	4402525.0	41.6666666667
HT5CKBCX2_l02_n01_KO_DI244_M1_rep1	94.583062163	44.0	151.0	3325174.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n01_KO_DI244_M1_rep2	94.7192537583	44.0	151.0	3407658.0	41.6666666667
HT5CKBCX2_l02_n01_KO_DI244_M2_rep1	95.0295400754	44.0	151.0	3652429.0	41.6666666667
HT5CKBCX2_l02_n01_KO_DI244_M2_rep2	95.3253641871	44.0	151.0	3899921.0	41.6666666667
HT5CKBCX2_l02_n01_KO_PBS_F1_rep1	72.571784128	48.0	151.0	1399090.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n01_KO_PBS_M1_rep1	73.8010684369	48.0	151.0	1707307.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n01_KO_PR8_F1_rep1	93.4032202351	44.0	151.0	2982302.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n01_KO_PR8_F1_rep2	93.1497423077	44.0	151.0	2623195.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n01_KO_PR8_F2_rep1	93.4475312018	44.0	151.0	3945781.0	25.0
HT5CKBCX2_l02_n01_KO_PR8_F2_rep2	93.1452075582	44.0	151.0	3337981.0	25.0
HT5CKBCX2_l02_n01_KO_PR8_M1_rep1	93.30659819	44.0	151.0	3012314.0	25.0
HT5CKBCX2_l02_n01_KO_PR8_M1_rep2	93.8817027708	44.0	151.0	3752591.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n01_KO_PR8_M2_rep1	93.8699409388	44.0	151.0	3499815.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n01_KO_PR8_M2_rep2	94.4517726048	44.0	151.0	4210919.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n01_Lib_prep_NC	5.67375886525	45.0	151.0	141.0	41.6666666667
HT5CKBCX2_l02_n01_MRTPCR_NC	54.8704447832	56.0	151.0	7217.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n01_No_index_control	9.34579439252	44.0	151.0	107.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n01_PR8_P5TC_rep1	95.2974643616	45.0	151.0	3343791.0	25.0
HT5CKBCX2_l02_n01_PR8_P5TC_rep2	95.0872153429	45.0	151.0	2768626.0	25.0
HT5CKBCX2_l02_n01_Plasmid_control_HA	93.7234537382	47.0	151.0	2704973.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n01_WT_Control_F_rep1	81.3156218437	49.0	151.0	2229279.0	50.0
HT5CKBCX2_l02_n01_WT_DI222_F1_rep1	94.7423603755	44.0	151.0	3773506.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n01_WT_DI222_F1_rep2	95.213113088	44.0	151.0	4139225.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n01_WT_DI222_F2_rep1	94.279671177	43.0	151.0	3272543.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n01_WT_DI222_F2_rep2	94.7983376436	44.0	151.0	3602471.0	41.6666666667
HT5CKBCX2_l02_n01_WT_DI222_M1_rep1	94.540421479	44.0	151.0	3976500.0	41.6666666667
HT5CKBCX2_l02_n01_WT_DI222_M1_rep2	94.9980384016	44.0	151.0	4295131.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n01_WT_DI222_M2_rep1	94.2932530635	43.0	151.0	3399633.0	41.6666666667
HT5CKBCX2_l02_n01_WT_DI222_M2_rep2	94.8724855353	44.0	151.0	3828004.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n01_WT_DI244_F1_rep1	95.1018082559	44.0	151.0	4388231.0	50.0
HT5CKBCX2_l02_n01_WT_DI244_F1_rep2	95.0627722828	45.0	151.0	3783405.0	50.0
HT5CKBCX2_l02_n01_WT_DI244_F2_rep1	94.953401002	44.0	151.0	3833309.0	50.0
HT5CKBCX2_l02_n01_WT_DI244_F2_rep2	95.2511804609	44.0	151.0	4117873.0	41.6666666667
HT5CKBCX2_l02_n01_WT_DI244_M1_rep1	94.3661220225	44.0	151.0	3344151.0	41.6666666667
HT5CKBCX2_l02_n01_WT_DI244_M1_rep2	94.8593125472	44.0	151.0	3715914.0	41.6666666667
HT5CKBCX2_l02_n01_WT_DI244_M2_rep1	95.074145374	44.0	151.0	4442753.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n01_WT_DI244_M2_rep2	94.5562524364	44.0	151.0	3185243.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n01_WT_PBS_F1_rep1	75.0996304889	48.0	151.0	1896019.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n01_WT_PBS_M1_rep1	78.6147501612	48.0	151.0	2206854.0	41.6666666667
HT5CKBCX2_l02_n01_WT_PR8_F1_rep1	89.4315895375	44.0	151.0	2619586.0	25.0
HT5CKBCX2_l02_n01_WT_PR8_F1_rep2	90.2924758273	45.0	151.0	2758245.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n01_WT_PR8_F2_rep1	93.5614153997	43.0	151.0	3240770.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n01_WT_PR8_F2_rep2	93.1116529727	43.0	151.0	2618759.0	25.0
HT5CKBCX2_l02_n01_WT_PR8_M1_rep1	93.5192307934	43.0	151.0	3414124.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n01_WT_PR8_M1_rep2	93.7015127909	44.0	151.0	3701887.0	25.0
HT5CKBCX2_l02_n01_WT_PR8_M2_rep1	93.7263100756	44.0	151.0	3866626.0	25.0
HT5CKBCX2_l02_n01_WT_PR8_M2_rep2	93.5442076641	44.0	151.0	3418441.0	25.0
HT5CKBCX2_l02_n01_undetermined	94.3746420052	44.0	151.0	9550223.0	25.0
HT5CKBCX2_l02_n01_vTC15B8B10B11_rep1_reseq	94.4768681614	44.0	151.0	2207093.0	25.0
HT5CKBCX2_l02_n01_vTC15B8B10B11_rep2_reseq	94.7304837101	44.0	151.0	2541975.0	25.0
HT5CKBCX2_l02_n02_DI222G4_P2CW_rep1	95.1331127847	45.0	151.0	4119949.0	50.0
HT5CKBCX2_l02_n02_DI222G4_P2CW_rep2	94.4048257043	45.0	151.0	3672982.0	50.0
HT5CKBCX2_l02_n02_DI244G4_P3CW_rep1	94.5489888707	45.0	151.0	3523643.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n02_DI244G4_P3CW_rep2	94.1120747859	45.0	151.0	3116767.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n02_KO_Control_M_rep1	77.0673334432	49.0	151.0	2045085.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n02_KO_DI222_F1_rep1	91.6980102236	43.0	151.0	3277870.0	41.6666666667
HT5CKBCX2_l02_n02_KO_DI222_F1_rep2	92.838510048	44.0	151.0	3305931.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n02_KO_DI222_F2_rep1	92.5672733339	44.0	151.0	4440034.0	41.6666666667
HT5CKBCX2_l02_n02_KO_DI222_F2_rep2	93.2163384003	44.0	151.0	4100316.0	41.6666666667
HT5CKBCX2_l02_n02_KO_DI222_M1_rep1	93.5688963787	44.0	151.0	3934033.0	41.6666666667
HT5CKBCX2_l02_n02_KO_DI222_M1_rep2	93.446982894	43.0	151.0	3524499.0	41.6666666667
HT5CKBCX2_l02_n02_KO_DI222_M2_rep1	93.7347497031	44.0	151.0	4523545.0	41.6666666667
HT5CKBCX2_l02_n02_KO_DI222_M2_rep2	93.9489390352	44.0	151.0	4814534.0	41.6666666667
HT5CKBCX2_l02_n02_KO_DI244_F1_rep1	89.721474607	44.0	151.0	2672020.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n02_KO_DI244_F1_rep2	91.5278840877	44.0	151.0	3035154.0	50.0
HT5CKBCX2_l02_n02_KO_DI244_F2_rep1	92.9453772497	44.0	151.0	4023559.0	50.0
HT5CKBCX2_l02_n02_KO_DI244_F2_rep2	93.9698619656	44.0	151.0	4402525.0	50.0
HT5CKBCX2_l02_n02_KO_DI244_M1_rep1	91.5693897536	44.0	151.0	3325174.0	41.6666666667
HT5CKBCX2_l02_n02_KO_DI244_M1_rep2	92.6849657277	44.0	151.0	3407658.0	50.0
HT5CKBCX2_l02_n02_KO_DI244_M2_rep1	92.6910111754	44.0	151.0	3652429.0	50.0
HT5CKBCX2_l02_n02_KO_DI244_M2_rep2	93.8600892458	44.0	151.0	3899921.0	50.0
HT5CKBCX2_l02_n02_KO_PBS_F1_rep1	68.2024131935	48.0	151.0	1399090.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n02_KO_PBS_M1_rep1	70.7419474284	48.0	151.0	1707307.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n02_KO_PR8_F1_rep1	90.0606394116	44.0	151.0	2982302.0	41.6666666667
HT5CKBCX2_l02_n02_KO_PR8_F1_rep2	90.824374827	44.0	151.0	2623195.0	41.6666666667
HT5CKBCX2_l02_n02_KO_PR8_F2_rep1	90.9071302967	44.0	151.0	3945781.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n02_KO_PR8_F2_rep2	91.070929334	44.0	151.0	3337981.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n02_KO_PR8_M1_rep1	91.133974756	44.0	151.0	3012314.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n02_KO_PR8_M1_rep2	92.0294632811	44.0	151.0	3752591.0	41.6666666667
HT5CKBCX2_l02_n02_KO_PR8_M2_rep1	91.8604358363	44.0	151.0	3499815.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n02_KO_PR8_M2_rep2	93.2058422861	44.0	151.0	4210919.0	41.6666666667
HT5CKBCX2_l02_n02_Lib_prep_NC	0.709219858156	45.0	151.0	141.0	41.6666666667
HT5CKBCX2_l02_n02_MRTPCR_NC	49.8129416655	56.0	151.0	7217.0	16.6666666667
HT5CKBCX2_l02_n02_No_index_control	1.8691588785	44.0	151.0	107.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n02_PR8_P5TC_rep1	92.8919178002	45.0	151.0	3343791.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n02_PR8_P5TC_rep2	92.3077985189	45.0	151.0	2768626.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n02_Plasmid_control_HA	90.8713395563	47.0	151.0	2704973.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n02_WT_Control_F_rep1	78.8337590144	49.0	151.0	2229279.0	50.0
HT5CKBCX2_l02_n02_WT_DI222_F1_rep1	93.125846002	44.0	151.0	3773506.0	41.6666666667
HT5CKBCX2_l02_n02_WT_DI222_F1_rep2	94.2172807911	44.0	151.0	4139225.0	41.6666666667
HT5CKBCX2_l02_n02_WT_DI222_F2_rep1	91.3735201833	44.0	151.0	3272543.0	41.6666666667
HT5CKBCX2_l02_n02_WT_DI222_F2_rep2	93.046096946	44.0	151.0	3602471.0	41.6666666667
HT5CKBCX2_l02_n02_WT_DI222_M1_rep1	92.3515657927	43.0	151.0	3976500.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n02_WT_DI222_M1_rep2	93.3522677738	44.0	151.0	4295131.0	41.6666666667
HT5CKBCX2_l02_n02_WT_DI222_M2_rep1	91.6787185693	43.0	151.0	3399633.0	41.6666666667
HT5CKBCX2_l02_n02_WT_DI222_M2_rep2	93.4183584556	44.0	151.0	3828004.0	41.6666666667
HT5CKBCX2_l02_n02_WT_DI244_F1_rep1	92.8653890921	44.0	151.0	4388231.0	50.0
HT5CKBCX2_l02_n02_WT_DI244_F1_rep2	93.7179626518	45.0	151.0	3783405.0	50.0
HT5CKBCX2_l02_n02_WT_DI244_F2_rep1	92.2650056268	44.0	151.0	3833309.0	50.0
HT5CKBCX2_l02_n02_WT_DI244_F2_rep2	93.2289398621	44.0	151.0	4117873.0	50.0
HT5CKBCX2_l02_n02_WT_DI244_M1_rep1	90.827092146	44.0	151.0	3344151.0	50.0
HT5CKBCX2_l02_n02_WT_DI244_M1_rep2	93.0189703439	44.0	151.0	3715914.0	41.6666666667
HT5CKBCX2_l02_n02_WT_DI244_M2_rep1	92.5824249999	44.0	151.0	4442753.0	41.6666666667
HT5CKBCX2_l02_n02_WT_DI244_M2_rep2	92.378421483	44.0	151.0	3185243.0	41.6666666667
HT5CKBCX2_l02_n02_WT_PBS_F1_rep1	72.7012763295	48.0	151.0	1896019.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n02_WT_PBS_M1_rep1	75.5136437638	48.0	151.0	2206854.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n02_WT_PR8_F1_rep1	87.1101770525	44.0	151.0	2619586.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n02_WT_PR8_F1_rep2	88.7782138139	45.0	151.0	2758245.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n02_WT_PR8_F2_rep1	90.5362313449	44.0	151.0	3240770.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n02_WT_PR8_F2_rep2	89.8743735018	44.0	151.0	2618759.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n02_WT_PR8_M1_rep1	90.5724581307	43.0	151.0	3414124.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n02_WT_PR8_M1_rep2	91.657598053	43.0	151.0	3701887.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n02_WT_PR8_M2_rep1	91.4178052659	44.0	151.0	3866626.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n02_WT_PR8_M2_rep2	91.3759008299	44.0	151.0	3418441.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n02_undetermined	91.1794351749	44.0	151.0	9550223.0	25.0
HT5CKBCX2_l02_n02_vTC15B8B10B11_rep1_reseq	90.4274620805	44.0	151.0	2207093.0	33.3333333333
HT5CKBCX2_l02_n02_vTC15B8B10B11_rep2_reseq	90.9082435211	44.0	151.0	2541975.0	33.3333333333