FastQCFastQC Report
Sat 24 Aug 2019
HNH27AFXY_n02_DARPA_DVG_P1_NEGATIVE_CONTROL.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHNH27AFXY_n02_DARPA_DVG_P1_NEGATIVE_CONTROL.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC42

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
ATTCCATTCCATTCCTTTCCTTTCCGTTTCATTAGATTCCATTGCATTCC28.333333333333332No Hit
CCTCAAATGTACAGCAAGATAAAACTTCCTTAAACATATATCTCACAGGA28.333333333333332No Hit
AACCACGATCGATGAAGTTATGCATGGTTGTGCTGATTCAGCATACAAAA14.166666666666666No Hit
GAGGTAGAGGTGCGTACGGTCAATCGTCTACCAGTGCAGAGAAGAGTGCG14.166666666666666No Hit
CTATTAATCAATCCAAGTCTTCTTATACATGAGAACAAGGAAATGAAATT14.166666666666666No Hit
TCTCTGAGTTGACCGTCAATACTGGTGGCCTCGAAACCGGCAAAGTTTAC14.166666666666666No Hit
CTATTTGGGTATCTTACTCCATTATCCATGTGAGATGGATAGACATGTTA14.166666666666666No Hit
GTGTCCTGGCCGGTCATGGCCAGGCGCGGCAGGTGTTGCATCAGGCGGTC14.166666666666666No Hit
GGTATAGCAGTGGTGTTTATGGTAGCTGTCCAAATTTATTTATACTTCAA14.166666666666666No Hit
AATTACAGCAGACAAGAGGATAACGGAAATGATTCCTGAGAGAAATGAGC14.166666666666666No Hit
GTCTAAACTGGACACCGCAAAGCCATACTTTTGGCTCCAATCAGGAGTCA14.166666666666666No Hit
CCAGTAAAGCCATCGGTTATTTTGATGGTACAAAGCACAAAGAACCACGT14.166666666666666No Hit
ACCAACATCCAAATAACATAATCAACCTCAATGAACTCTGCTAAAAATTC14.166666666666666No Hit
CAAGTATTCTCATTCCGGATCCCCTCACATTCACAGTAAAGGCGGAGCAC14.166666666666666No Hit
GGACACTATAGGAATGGCAGTTTACCCACAATTTCTGCCCTGTGGAGGTG14.166666666666666No Hit
ATGCTGTCTTCCCCGCGCAGGCCATCCAGCACGATGCGGATCTTGTCCTC14.166666666666666No Hit
AACTTTTTCTGCGTGAAAAGTTGATATAATTTCTCTGTCTTTTAATCCTT14.166666666666666No Hit
GAGTGTTGGTATGCCGTTGATGAAGAGGTGGTGGTGGAAGAAGAGGAGGA14.166666666666666No Hit
GAGTTTTGTCAGATATCCGCTGGCAATACTTCCTAAATCAGCGCAAAGAA14.166666666666666No Hit
GCGTAATCAGGTGTCGGTAGAGAAGCCGGACTGGTCAACGGTGCCGTTTA14.166666666666666No Hit
CCTCACTGTTTCAAGCTTGTTTTGGTTACTGGCCAAAATCACCTCTTGAT14.166666666666666No Hit
CATCTCTGCAAATTTAAATTAAATTTCTCCTCCTACTGTTTCTTGGTGCA14.166666666666666No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.5)