FastQCFastQC Report
Sat 24 Aug 2019
HNH27AFXY_n01_DARPA_DVG_P1_NEGATIVE_CONTROL.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHNH27AFXY_n01_DARPA_DVG_P1_NEGATIVE_CONTROL.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC43

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGAATGTTCTGGAAGTGAATGGACTCCAATGGAATGGATTCAAAAGGAAT28.333333333333332No Hit
AGGTGAGTGTCTTGAAGACAGCAGATACTTGGTTGGTGAATGTTTATCCA28.333333333333332No Hit
AAAATACTACAATATATCCAAAGTAACAACTTGATAACAGTAAATTTAAA14.166666666666666No Hit
GTTTATCCCATATTTCTTGTTCTGAAGTACTTAAGGGTTGCTTTGTCAAC14.166666666666666No Hit
GAATCAAGCTGCAAAGCACTTTATTGAAAAATTTAAAACCTACTTAAGCT14.166666666666666No Hit
GCATGGGCCTCATATACAACAGGATGGGAACAGTGACCACAGAAGCTGCT14.166666666666666No Hit
CGAAAAGCACCGGTCCTTGTCACACTTTCATGAGTTCTGCACTCATTCAA14.166666666666666No Hit
CGTCCGAATAGCCGCCTTCCTCTCCATTCGAACGTTAATGGCAGCAGGTG14.166666666666666No Hit
CGATTGCAATACAACTTGTCAGACACCCGAGGGTGCTATAAACACCAGCC14.166666666666666No Hit
GCGTAAGGTGATGCGCCGGAGCTAAGGCAGGGCTGACGATCTGTGACCGA14.166666666666666No Hit
CCACAAAGGTACTGCTTCTCATGGAATCTCCCTTCAGATGCCTACAAACC14.166666666666666No Hit
CCTCCGGTAAAAATGCCTTTTCTGACCGCGTTAAAAACAGTTAGTAAAAA14.166666666666666No Hit
TTTAAATAACACACAAACAATATTTTACGTGATGTAACATGTCTATCCAT14.166666666666666No Hit
CAACCAACCCATTAATAAAACATGAGAACAGATTGGTTTTGGCCAGCACT14.166666666666666No Hit
GCCTTTCCCTAGGGTTTCTAGCCAGTTTAATAAGCTAATTTAGGCTCATT14.166666666666666No Hit
CTTCTCAAGTTGTTCTTGAATTTGCTGATGTATTTGCTGAATTCTTTAAA14.166666666666666No Hit
CTTGTGTCGAGTGTCCGCCGTCAGCACCAATGGCACAGATTTGAGGTTGT14.166666666666666No Hit
GGCGTAAATCATCGGGTTACTGATTTTATTGCGTCGAAACCACAGTTCAA14.166666666666666No Hit
CTTCCTGGCCTTTGCCAACTCCAACCTGGCGGGCCCGGTGGGCCTGTTGT14.166666666666666No Hit
TTCTTGTACTGTTCGCAGAGCAGAGGGACTCTTGGATACCAAAGGAAGTG14.166666666666666No Hit
CATTGACAGAAATCCTTAACTTTCTGGCATGGTTTGAAGTATAAATAAAT14.166666666666666No Hit
TTCTTGTGGAGTTTACCCTCAAGGATTAAAAGACAGAGAAATTATATCAA14.166666666666666No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.5)