FastQCFastQC Report
Sat 26 Sep 2020
HNCVFBGXG_n02_FD_S4_R2_G01.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHNCVFBGXG_n02_FD_S4_R2_G01.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC45

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GCACTAATGCTTTACCTGTGTACGCTCAGCCCCGGGAGCCCCTTTCTGGC14.166666666666666No Hit
ACAGTGTCTTTTGTCCCTGAAGCAGGGTCTCCCCGTAGCTCAAGGGGGCG14.166666666666666No Hit
GACCAAAGATGCAGAGAGAGGCAAGTTAAAAAGAAGGGCTATCGCAACAC14.166666666666666No Hit
AGCTTGCCCTCAATGCAGCCGTTCGGCTCGAATCCATCTACATAGGCTCT14.166666666666666No Hit
CTTCAATCCAATGATCGTCGAGCTTGCGGAAAAGGCAATGAAAGAATATG14.166666666666666No Hit
GCCAGGGACCATTAATTTATGTTTTGAGGAACTCTTTATGGATGCAATAA14.166666666666666No Hit
GATTCAGTACAACCTCATTCAAATTTAAGCCCAACTCTCGGGCTTTGCAG14.166666666666666No Hit
AGCCAAACCTTTCTGCAGAGCAGTCACATTGGAGCCGACCAGGCTCAGAT14.166666666666666No Hit
CATTGTGATATGGTGCACAAAACCAACACCAAAGCTTGGCTCTTGCTTTT14.166666666666666No Hit
AATCTGTGCCGCATTTCTTCAATTAACCACCTTATTTCCTCAAATTTCTG14.166666666666666No Hit
TTTTTAAACAATTCGACACTAATTGATGGCCATCCGAATTCTTTTGGTCG14.166666666666666No Hit
GAATATTCACATTCCTTAAGTATGCTTAAAATGTGAGATAATTTATTATG14.166666666666666No Hit
GTTAGCATCAGAGTTCAGTGCTTTGGTCCTTGAAGTACAGGAATCAAGGC14.166666666666666No Hit
GTATTATACTGTTACATATTAAATCCTCTATTTATGTTATTAACAAATTT14.166666666666666No Hit
AAATAACAGCCATCCTGCTGGGTGTGAAGTGGCGTCTCTCTATGGTTTTG14.166666666666666No Hit
CCTTTATCGAGTTACTCTAACATTCTAGTCAAAGTTGCAAAACACAAGAC14.166666666666666No Hit
GGATACATATGCAGTGGGATTTTCGGAGACAATCCACGCCCTAATGATAA14.166666666666666No Hit
GTCTTTGTTTTTTCTTCCCTATTGTTCTTTGCGTGACCATCTTCTTGGTC14.166666666666666No Hit
AGCTATACCAGGAGAAGGAGATGGCGCTGCAAAAGAAACTGAGTCAGGAA14.166666666666666No Hit
GAATAGCTTAGTGACACCTCCTTGGCCCCATGGAACGTTATTTCTCTTTT14.166666666666666No Hit
GCAGCCAAGGTGGAACCTGGAGGAAAAACAAGGGTGGTGGCAGGTGGCAG14.166666666666666No Hit
GGGAAAGATAGTCAAATCAGTCGAAATGAATGCCCCTAATTATCACTATG14.166666666666666No Hit
ATGTAGATGGATTCGAGCCGAACGGCTGCATTGAGGGCAAGCTTTCCCAA14.166666666666666No Hit
GTGAAGAACCCCGCACTCAGAATGAAGTGGATGATGGCAATGAGATACCC14.166666666666666No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.5)