FastQCFastQC Report
Sat 26 Sep 2020
HNCVFBGXG_n02_FD_S4_R2_F01.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHNCVFBGXG_n02_FD_S4_R2_F01.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences30
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC43

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGATGCTCTGAAATTAAGTATTGAAGACCCGAGTCACGAGGGGGAGGGAA13.3333333333333335No Hit
TGTCAGATGAATTCCCATGTTCAAAGTCGCGCAAAGTAGAGCAGAACTGA13.3333333333333335No Hit
GCTAGCACCTGCTTCCAAGCCATGAGGTAATTGGGATTTATGCCTTTCTC13.3333333333333335No Hit
GAACTGTACTTGTTGTTGGGCCATTCCTATTCCACCATGTTACGGCCAGA13.3333333333333335No Hit
GTCATACTGTTTAAGGTCTCCAACATCTTTGCAGTCATCAAAGTCTACTT13.3333333333333335No Hit
AAACATGGCCAATCGGAGAGTCACCCAGCGGAGTGGAGGAAGGCTCTATT13.3333333333333335No Hit
GTAGTTGTAAGGCTTGCATAAATGTTATTTGTTCGAAACTATTCGCTGTC13.3333333333333335No Hit
GTTCTCACATATAGGAACATGGGCCTCGACACTTGGCCTATCGCAGTCCT13.3333333333333335No Hit
GGCTACTGGGAGAAACCTGGTTTTACGGACCAATTCTCTTTCTAGCATGT13.3333333333333335No Hit
GTTGTCTCCACCTGGCATTTTCCTTAACCTTGGAAGCACTGTCAATGTTC13.3333333333333335No Hit
ATCTGATACTAATAGCCCTACCTTTGATTGGGTTTGATCCCACAGCTTCT13.3333333333333335No Hit
CCCTTATACTGGAGATCCTCCATACAGCCATGGAACAGGAACAGGATACA13.3333333333333335No Hit
GCATGATTGAGGCCGAGTCTTCTGTCAAAGAGAAAGACATGACCAAGGAA13.3333333333333335No Hit
TAGCATCTCTCTTGGAAATGTGCCACAGCACACAGATTGGAGGAGTAAGG13.3333333333333335No Hit
TCTGGGCTCTGGCTCATCACTGTCATACTGTTTAAGGTCTCCAACATCTT13.3333333333333335No Hit
CCCATATATAGAAGAGTAGACAGAAAGTGGATGAGAGAACTTATCCTTTA13.3333333333333335No Hit
CATTAAATACGATGACCAAAGATGCAGAGAGAGGCAAGTTAAAAAGAAGG13.3333333333333335No Hit
CCACTATATGATGCAATCAAATGCATGAAGACATTCTTTGGCTGGAAAGA13.3333333333333335No Hit
CCTCAAAGGAAAATTTCAAACAGCTGCCCAGAGGGCAATGATGGATCAAG13.3333333333333335No Hit
TACCACTATATGATGCAATCAAATGCATGAAGACATTCTTTGGCTGGAAA13.3333333333333335No Hit
GTATTCCCTCATGGTTTGGTGCATTCACTATGAGAGCAAAATCGTCGGAT13.3333333333333335No Hit
CCAGAAATCAACCCGAGTGGTTCAGAAACATCCTGAGCATGGCACCTATA13.3333333333333335No Hit
TTTCTGAACCACTCGGGTTGATTTCTGGTGATATATGTAATCATCGCCAG13.3333333333333335No Hit
AGACCGTACTTAGCATGTTGAACATGCCCATCATCATCCCAGGACTCAGT13.3333333333333335No Hit
CAGGTAGACTGTTTCCTTTGGCATATCCGCAAGCGATTTGCAGACAATGG13.3333333333333335No Hit
GTCTATATGCGTCTCCACAACTTGAGGGGTTTTCGGCTGAATCTAGAAAA13.3333333333333335No Hit
CCAGAAATCAAACCGAGTGGTTCAGAAACATCCTGAGCATGGCACCCATA13.3333333333333335No Hit
CACAAATCCAATGACTAGATTACTAAAAAAGTAAAATATCATATTGAAAA13.3333333333333335No Hit
GGACCCAGCTTGCTAGAGATCTGGGCTCTGGCTCATCACTGTCATACTGT13.3333333333333335No Hit
GCAAATAGTAGCATTGCCACAACTACTTCAGTGCATGTGTGAGGAAGGAG13.3333333333333335No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers