FastQCFastQC Report
Sat 26 Sep 2020
HNCVFBGXG_n02_FD_S3_R2_H01.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHNCVFBGXG_n02_FD_S3_R2_H01.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC45

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
ATATGGGGAAGATCCGAAAATCGAAACTAACAAGTTTGCTGCAATATGCA14.166666666666666No Hit
ATTATGTACAGTTAATCAGAAAAAAAGCACTTCTTTATGTTTGCAAATAA14.166666666666666No Hit
GGAGTGGACAGATTCTACAGGACCTGCAAGTTAGTGGGAATCAACATGAG14.166666666666666No Hit
CTGATGTGGTGAACTTTGTAAGTATGGAGTTCTCACTCACTGACCCGAGA14.166666666666666No Hit
TATGGGTGCCATGCTCAGGATGTTTCTGAACCACTCGGGTTGATTTCTGG14.166666666666666No Hit
TGACAATTGCATCTGTACCTACTTCGCGCTACCTTTCTGACATGACCCTC14.166666666666666No Hit
GGCCTCCACCATGCTAGAAATTCCAACCGGTCTCCTATATGAACTGCTAG14.166666666666666No Hit
GTAGCCATCTGTCTGTGAGACCGATGCTGTGAATCAGCAATCTGTTCACA14.166666666666666No Hit
GTTATTGCCACCTGTGACTCTGATGTCAGTATTCTTGCCCCCACTTCATT14.166666666666666No Hit
ACCGTGGGCTCTCCTCTCCCCTTGAGGTGAACGCAGCAAACCTTCGGTGT14.166666666666666No Hit
GCACCGATTTAGTTCACAAACTTAAACGCAAGACTACCGAAACGGAACAA14.166666666666666No Hit
GAGCAAGGCCGTATTTATGTACACTCCCTTCATTATGTATTCAGTAGCCC14.166666666666666No Hit
AAAGAACTGAGAGATCTAATGTCGCAGTCCCGCACTCGCGAGATACTCAC14.166666666666666No Hit
GGTCAATGCTTGCTAGCATTTCTGCTGGTATTTGTGTTCGAATCTTCATT14.166666666666666No Hit
CTGCAAAGATGTTGGAGACCTTAAACAGTATGACAGTGATGAGCCAGAGC14.166666666666666No Hit
CAAATACCAGCAGAAATGCTAGCAAGCATTGACCTGAAGTACTTCAATGA14.166666666666666No Hit
GCACGAGCTGAAGGAGACCACTTCCTAGTTGTGCCCGCCCTTCAAGGGTC14.166666666666666No Hit
ATACTCACTACCACTCTCTCCGTGCTGGAGTATTCATCTACTCCCATTTT14.166666666666666No Hit
TGGGAGACCTTCACTACCTCCAGAGCAGAAATGAAAAGTGGCGAGAGCAA14.166666666666666No Hit
GGGCGGGCTCCGGGGCTGGCCGTGCGGGGGTGTTGGTGGCGTGCGGGGGT14.166666666666666No Hit
ACACCATGTCAAGCTTTCAGGTAGACTGTTTCCTTTGGCATATCCGCAAG14.166666666666666No Hit
GTAGAAACAAGGTACTTTTTTGGACAGTATGGATAGCAAATAGTAGCATT14.166666666666666No Hit
GCTCTTATCTCTTGTTCTACTTCAAGCAGTAGTTGTAAGGCTTGCATAAA14.166666666666666No Hit
CAGTAAACAGAACACACCAATACTCAGAAAAGGGAAAGTGGACGACAAAC14.166666666666666No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.5)