FastQCFastQC Report
Sat 26 Sep 2020
HNCVFBGXG_n02_FD_S3_R1_F05.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHNCVFBGXG_n02_FD_S3_R1_F05.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences15
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC43

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGTTCATGCTCATGCCTAGTCAAAAGATAATAGGCCCTCTTTGCGTGCGA16.666666666666667No Hit
GATAACAACCCACTTTCAAAGAAAAAGGACAGTAAGAGACAACATGACCA16.666666666666667No Hit
AGATAAACTAACTCAATGTAGCCAGACTTATGATTGGACATTAAACAGAA16.666666666666667No Hit
GTCAAATATATTCAATATGGAGAGAATAAAAGAAATGAGAGATATAATGT16.666666666666667No Hit
TGTTCATTGATAACATAACAAACTTTAAGAAATATATTAGCATTCCTGAC16.666666666666667No Hit
CTCCTCGATTGCTTCATATAGCCCCCCAAGATCGAAGGTTCCAGGTTCCA16.666666666666667No Hit
ATTGTTCTTTGCTTGACCAGCTGCTTGGTCATGTTGTCTCTGACTCTCGG16.666666666666667No Hit
TTGTTTTTTCTTCCCTATTGTTCTTTGCGTGACCATCTTCTTGGTCATGT16.666666666666667No Hit
CCTCAACCCTGATCCTCTCACATTCACAGTCAATGAGGAAAATTGCATCC16.666666666666667No Hit
TGTCTAGTGTGATCCACTTCTCAACAGATTGAAGATTCACAGAATCGGAC16.666666666666667No Hit
GTGGAATAGTGGCAGGGTGAGTCCCCAGGTGGGGATGGGCTGGACCTGTC16.666666666666667No Hit
GGACATCTTTCAGTACAGCACTGGAGCTAGGAAGAGTCCCACTAGGTCTC16.666666666666667No Hit
ATCATCAACAACACCGTGGCCCTGGAGAACAGCATTCCTGGCAACTGCTG16.666666666666667No Hit
GTAGTGAAGGTCTCCCATTCTCATCACAGTTTCTCCAAGCGAATCTCTGT16.666666666666667No Hit
ACACTCTGCTCCTCCCGAGAGACTAGTACTATACCTCGTAGGACCACGTT16.666666666666667No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.5)