FastQCFastQC Report
Sat 26 Sep 2020
HNCVFBGXG_n02_FD_S3_R1_C07.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHNCVFBGXG_n02_FD_S3_R1_C07.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences1500
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC47

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[WARN]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[WARN]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GTCCAGGGAAAGTGGCCGGAGCGGGGGTAGGGCTGGTGGCCACCATGGTT60.4No Hit
ATTAAATACCATACGGAGCACAGGATGAGATTTGAACTTGGGCAGTCTGC50.33333333333333337No Hit
ATACCATACGGAGCACAGGATGAGATTTGAACTTGGGCAGTCTGCTCCAG50.33333333333333337No Hit
ATATTTGGTTCTAAAATGTGACTTGTCTTTAATTGGGAAATGAAATATTG50.33333333333333337No Hit
GATATATATAGAGAGAGATGGATCGATCAAAACACATCAAGTTATCCACC40.26666666666666666No Hit
GTCTTTAATTGGGAAATGAAATATTGTTGTTAACTGCCCAACAACAGGTC40.26666666666666666No Hit
TATATATAGAGAGAGATGGATCGATCAAAACACATCAAGTTATCCACCTG30.2No Hit
TTGTATGAGCGCAGATTAAGTCAAGTAGCCTAAAAATTGCATAACAATTT30.2No Hit
GGGTTGTATCAACTTCGTAAGATGTCACAGGGAAGCAAAGTTCAAGAGTG30.2No Hit
GTTAGAGCTTGTGGTAAAGGCAGCTATGGGAGACTGGGCCTTGGAGATTC30.2No Hit
AGACAGAAGGTAGAAGGAAAAAAGGAGAAAAAAAAGGACAGGAAAGGAAG30.2No Hit
GAATATAAGAGAATACAAATAGGCTAGGTCATAAACGATCTTGTAAGTTA30.2No Hit
ACACTAAGGGCAAGAGTCACACGCTCTACCATCTGAGTCAGCCGCGCACC30.2No Hit
GGATAAAGAAAAGGATACGCAAAAGAAGCGAACGGAAATTTCAGAGATAA30.2No Hit
GTATGGTCTTTTGGAGGAGGAGACAATGGCAAACTTGGCCATGGAGATAC30.2No Hit
ATGCTAGAAGGCCCCTTCAGCACACCGGTGCCCTTCCTGCAGAGCGTCCC30.2No Hit
ATTTATTAGAGGGAGAGAGGCTTGCAAAAGCAGGGGGAGGGGCAGAGAGG30.2No Hit
GCTCTACAAGCTTGAGTCAGACAAGCGCCTGGTGGAGAACACCAAGTCTG30.2No Hit
GTTTGCAAGTGCATATTCTATGACTAAAAAGTGATGAAATGCAACTAACC30.2No Hit
ATTATACACATGGGGTGAAGGAGACTTTGGAAGATTAGGTCATGGAGATA30.2No Hit
GCTTAGGATGTGACTTCGGGCACCCAGAGCAACATCCTGGTTTGGGAGCT30.2No Hit
GAGCACAGGATGAGATTTGAACTTGGGCAGTCTGCTCCAGTCCGTGCTAT30.2No Hit
CAATTGGTGGAAGGCACACAGGAGAAAATACTACAGCCCAAACTGGCTCC30.2No Hit
ACTTAAACCCAAAACCCTCAACTGCAAAAACCAAATCAAAACCAGCAGTG20.13333333333333333No Hit
GGCATAAACTTCATTATCATGAGAAAGAGCCAAACAATGACTGTCTCCAA20.13333333333333333No Hit
GGGCTGGTGGCCACCATGGTTGGCCACGGAAGAACAGTAACAGTTGTCCA20.13333333333333333No Hit
TTCTAGTACTGAACAAATCTTGACTTTCTTTGGAAAAGCTGAACAAAAGA20.13333333333333333No Hit
CCGGTGCCCTTCCTGCAGAGCGTCCCCCTCTACCCTTGTGGCGTGAGCAG20.13333333333333333No Hit
GCCTTTATGAAGCCTCACCAGTCAGAAGCAATGAGGGTTAATAACCCCCA20.13333333333333333No Hit
ATGAAATATTGTTGTTAACTGCCCAACAACAGGTCGTAAGGTCTCCACTG20.13333333333333333No Hit
CAGAAAGCTCCCAGGAGAAAAACAAGTCCAGTAAAATGTGAAAAAATATG20.13333333333333333No Hit
ATGCCGACCAGAACGCCGACCAAAACCAGGAAACCCATGATGTCCAACCT20.13333333333333333No Hit
GTGGAGACCTTACGACCTGTTGTTGGGCAGTTAACAACAATATTTCATTT20.13333333333333333No Hit
CTTCCTGAATGAGGTGGCCAAGAAGGAGAAGCAGCTGCGGAAGATGCTAG20.13333333333333333No Hit
GGTAAGGAAAGAGAACAAAGGTGAAAAAATCTTTCTTTGTAGTTTTTGGA20.13333333333333333No Hit
GTTGTGTATCTTCCCTTCTATTAAGTCTGTTTTCACATTCGCCGCCTTCT20.13333333333333333No Hit
CCTCTATTCTGTAATAATACTGACCACCTCCCATTCTTGGGACAAGACTG20.13333333333333333No Hit
GGACTGGGTTGCAAAATGAGTTGAGGAAGTAGAAACAGTGATCATAAGAC20.13333333333333333No Hit
ATTGATACCCATTTTCTGGTTTCCTATGTTTCCAGCAACCTGTTGTGTAT20.13333333333333333No Hit
TAGTAAGTGCATGGGACACCTAGATTCTGACTCCCAAATCCGAGAGCTGC20.13333333333333333No Hit
CCATGGTTGGCCACGGAAGAACAGTAACAGTTGTCCACAGAACAGACGAG20.13333333333333333No Hit
AGCAGGCTCTGAGATCAGTCCCGTGGCTAATAAGTCACACGACCCTGACC20.13333333333333333No Hit
CTTAAGGACTGAGCCACCCAGGCACCCTTTTATATCTGCACTCTTCTGTT20.13333333333333333No Hit
GGTTGGGGATCTGGTCAGCAGGTTCCCAGAGGTGGTCACACTAGGCTCAG20.13333333333333333No Hit
GCGTGACACATTGCAAGGTTTAAATAAATACTTATAAAGTTTGTTGAATA20.13333333333333333No Hit
ATATAGAGAGAGATGGATCGATCAAAACACATCAAGTTATCCACCTGAAA20.13333333333333333No Hit
GTCACACTGAACATGACAGAACCATTGCATAGATTGGAATCTTTGTTTGT20.13333333333333333No Hit
CTCTAGTTTCATTCTAACAGGAGTCAGAAATTGGTTTTTCCATATTTCTG20.13333333333333333No Hit
GTCACATAACTTTCTGGGTAAGGGTCCACGTTTATAAGTGAGAAATCTAA20.13333333333333333No Hit
GTGATGGGGGGAACACAGGACTTGAATGCACTGGTTGGGCGCCGCCCGGC20.13333333333333333No Hit
TCCCAGGACCGTGGGTTCCTGACCTCGGCCACAGGCAAGCACTTAAGGAC20.13333333333333333No Hit
CCTCTAATCAAAAATGACGAGACACGACAAAGCCAGCACACGTGGCCCAC20.13333333333333333No Hit
CTACCCTTGTGGCGTGAGCAGCTCTGGGGCGGAAAAGCGCAAGCACTCAA20.13333333333333333No Hit
TTACTGGACTTGTTTTTCTCCTGGGAGCTTTCTGAGGAAAAGTACTCTGT20.13333333333333333No Hit
AAGTGAAGGAGTCTGGACTTGATCCCAAGGATCCCAAGGAAAACCATCCA20.13333333333333333No Hit
GCCCTAGCCCACATATGCTTCCAGCTTCCAAACCACTCAGACACGACAAC20.13333333333333333No Hit
ATTCTGGTCCTTACTTCCTCCAAGAGTTCTCAGTTCCTCCCTCCCTTGTC20.13333333333333333No Hit
ACCCAGACCTGCACGGGCAGCAGCCTTTCTCCCCGCTAAGATCGGCCACC20.13333333333333333No Hit
TCCTAATATATGTGTTTTCCTCTGGTTACTTTTAAGATTTTATCACTGGT20.13333333333333333No Hit
GTCCATGCTAGACTATGTGATGTTCCAGCAGAGATCTGCTGAATAGCTAT20.13333333333333333No Hit
GATCAAGGCCTTCCTGTCAGTCATCTAGCTGCTGCAGTCAGAAACATGGG20.13333333333333333No Hit
TCCTAGTTCTGCTCATGGGATTAAATGAGAATTAGATCTGCTCTGGGCAA20.13333333333333333No Hit
CCTCTAACCTCACCCTAAGAAGCTTAAAAACAAAGCTGAAAAAGATCATG20.13333333333333333No Hit
ACAGGACCCAGACCTGCACGGGCAGCAGCCTTTCTCCCCGCTAAGATCGG20.13333333333333333No Hit
CTATAAAGCCTGTCCAAAGTCACACAGCCAGTAAGTGGCAATGGAAACAT20.13333333333333333No Hit
ATCTAAGCCACTCACTTTCTTTGGTTTAGTAATAGGACCTGTGGAATTTC20.13333333333333333No Hit
GAGGAAGAACTCCCATACAGCTCAGTTCCTTCTTTAATTAAGGGTGGCCC20.13333333333333333No Hit
GTCGTAAGGTCTCCACTGAGGCTCTCCCACGACACAGATCGAGGTGAACG20.13333333333333333No Hit
GTACCGGTCTAGCAGTTCCCGACTCCAGGCATCCAGGTTGACATACTTGA20.13333333333333333No Hit
ATTAAAGACAAGTCACATTTTAGAACCAAATATTGTTCATATCTTGCTGT20.13333333333333333No Hit
CCTCTCCTCAAGGCATTCGGATCAAGGCCTTCCTGTCAGTCATCTAGCTG20.13333333333333333No Hit
GTACTTATCTCTTCTCTTGGTTGTGGGCCACGTGTGCTGGCTTTGTCGTG20.13333333333333333No Hit
GGATGAGATTTGAACTTGGGCAGTCTGCTCCAGTCCGTGCTATAGTCGGA20.13333333333333333No Hit
CTTTTAAGATTTTATCACTGGTTTTCAGTTCTTTGACCCTGATGCGCTGT20.13333333333333333No Hit
GGCTAGGTCATAAACGATCTTGTAAGTTAAGTGAAGGAGTCTGGACTTGA20.13333333333333333No Hit
TCTTTAGACAAAGCAATAGTATGTGAACTGCCACAAGAAACCTCTCCAAC20.13333333333333333No Hit
GCCCATGGGTAAAAAAAGAAATAAAATGAGAAATTAGAAGGTTTTTTTGG20.13333333333333333No Hit
CTGTTGTGTATCTTCCCTTCTATTAAGTCTGTTTTCACATTCGCCGCCTT20.13333333333333333No Hit
ATTTTGACTAAGGCAGCTGAAGTTCACTTGGCAATCAGAAATATGGAAAA20.13333333333333333No Hit
GTTCAAGAGTGAGGCTGACAATGAGGGAAGTCTGCTGTTTGTGAAGTTAA20.13333333333333333No Hit
ATACGGAGCACAGGATGAGATTTGAACTTGGGCAGTCTGCTCCAGTCCGT20.13333333333333333No Hit
GTGTATAAACCTAAAGTTGTTGAAGCTTTACAAGGAATGTTCATTCGCAA20.13333333333333333No Hit
GCATATATCATACATGCCGACCAGAACGCCGACCAAAACCAGGAAACCCA20.13333333333333333No Hit
GCCAGCACACGTGGCCCACAACCAAGAGAAGAGATAAGTACAAACAGACC20.13333333333333333No Hit
GCCATTGGGATACTGTGATGGGGGGAACACAGGACTTGAATGCACTGGTT20.13333333333333333No Hit
CCCAGAGCAACATCCTGGTTTGGGAGCTACAGAAGTCACGAAACAGCAAG20.13333333333333333No Hit
CTCAACGGCCTTCCCTGAGGCCAGTTTCCTAGAGACGTCGTCAGGCCCCG20.13333333333333333No Hit
ACACAGATCGAGGTGAACGAGTCACTGAAAGCAGGTTTCACCACCTCCTT20.13333333333333333No Hit
GGTCTAGGCAGAGGCGCTTGCCAGTAAGGTACGCAACAGCATCAACAAAA20.13333333333333333No Hit
GAACAATATTTGGTTCTAAAATGTGACTTGTCTTTAATTGGGAAATGAAA20.13333333333333333No Hit
GTTGTATCAACTTCGTAAGATGTCACAGGGAAGCAAAGTTCAAGAGTGAG20.13333333333333333No Hit
CTTCAAGATCTACACAATAAGGTCGGTGCCATGCAACAACTTGTCTATCC20.13333333333333333No Hit
TGTGAAAACAGACTTAATAGAAGGGAAGATACACAACAGGTTGCTGGAAA20.13333333333333333No Hit
GTCTGGACTTGATCCCAAGGATCCCAAGGAAAACCATCCACATCTACCTT20.13333333333333333No Hit
GGTTTCTTACTTGGTACCCCTTAAGAACTATTACCCATGCCTACATTTTA20.13333333333333333No Hit
GAAGGAGACTTTGGAAGATTAGGTCATGGAGATAGTAACAGCCGTAACAT20.13333333333333333No Hit
CTCACTTTCTTTGGTTTAGTAATAGGACCTGTGGAATTTCCTTGGCCACA20.13333333333333333No Hit
CTCAAGCATTGTGACCTGAAGGCAGTTTAACCAGCCGAGCCACCCAGGCA20.13333333333333333No Hit
ACCATACGGAGCACAGGATGAGATTTGAACTTGGGCAGTCTGCTCCAGTC20.13333333333333333No Hit
GGGTGGGGAACGGCAGGCAGAGGGAGCAGCAGGCTCCCTGCTGGGAGCTC20.13333333333333333No Hit
TTCCAATGCTGGCATGATCCCGGTCGCCGGAGGCAGACACTTGACGAATG20.13333333333333333No Hit
GGACCCAGACCTGCACGGGCAGCAGCCTTTCTCCCCGCTAAGATCGGCCA20.13333333333333333No Hit
GCAGGGAAGACAGGAAGGTAGAAGGGCAGGTCTCTGGATGCGTAATTCCC20.13333333333333333No Hit
GAGCAACATCCTGGTTTGGGAGCTACAGAAGTCACGAAACAGCAAGATAT20.13333333333333333No Hit
GATATATGCAGATTGACATGATCTTTTTCAGCTTTGTTTTTAAGCTTCTT20.13333333333333333No Hit
ATATTGTTGTTAACTGCCCAACAACAGGTCGTAAGGTCTCCACTGAGGCT20.13333333333333333No Hit
CTAAAGGATCTGATGGTCACACCTTAGCTTTTACAACAGAAGGAGAAGTC20.13333333333333333No Hit
CCTCAGCTGCCTGGCTACAGTAAGAATGAAGACTGTAAAAGCAAATAAAA20.13333333333333333No Hit
GTCAATGTCATTCCTTTCAAATATGGATTAAAGTTACTAACAAATAAGAA20.13333333333333333No Hit
TTCTACAACTGGACGGAAAATGCGGAGCTCATGAACCGCACCAACATCAC20.13333333333333333No Hit
GTTGTACATTTAAGGTGTATGAGTCACATGTTCCAGCGGAGACTGCTCAC20.13333333333333333No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.5)