FastQCFastQC Report
Sat 26 Sep 2020
HNCVFBGXG_n02_FD_S3_R1_C01.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHNCVFBGXG_n02_FD_S3_R1_C01.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC45

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GAGCCTTCCTGACTCATTAGCTGTTAGGCCATTCGATCTAAAGACTTCTA14.166666666666666No Hit
GGTGAGGGTCACTGTGTTGCAAATTATTCTAGGCGCTGTTGGGGAGCGCT14.166666666666666No Hit
TATTTACTCAAATGGAGACTAAGTGATTGCGCTCCCAAGAGTTTAGGTCG14.166666666666666No Hit
CTCATTTAATGGCGAAATCCAAGACCAATCGTGGCAACTCTTACGAAGGG14.166666666666666No Hit
GAAGGTGAGAGGGGTGCGCTGCCGCGCGCTGGCTGGGCATGAGTTGACCA14.166666666666666No Hit
GGGCTGATTTATTCATTATGGAGAGAATAAAAGAACGGAGCGATCTAAAG14.166666666666666No Hit
AAGCACACAGTTGGAAGGTTGTTTCATGTATTCGGATTTCCATTTCATCG14.166666666666666No Hit
AAGAAGGGCTAACTCACCAACTGGGAGGCTGATTAGAGGTTTCGTATACT14.166666666666666No Hit
GATAATATTCAAAAATATCCTGAGAATGCACCAGTAGATAATGTAAAACA14.166666666666666No Hit
CTGTCCACTTCAGAAATCAAGTTAAAATAAGGAGGAGAGTTGATACAACC14.166666666666666No Hit
CACTCAGATTGCCTGATTGGCCTCTTTGCAATCAGAGGTAAAAGTTCCTG14.166666666666666No Hit
GGGCTTTATCAATTCTCTTCTGAGCCCAAAATGAGAAATCCTCTCAGGAC14.166666666666666No Hit
ATCAGGCACTCCTCGATTGCTTCATATAGCCCCCCAAGAGCGAAGGTTCC14.166666666666666No Hit
ATATAGTGGTATTCCCTCCCCCTCGTTACTCGGGTCGTATCTACGTAATT14.166666666666666No Hit
GAATAAGAGAGCATAACTATGAACTCCACAGACAATAAATACATACACCA14.166666666666666No Hit
ACTATGTTTCTAGCAGCGATAATCAAACTTTGGTCAACATCATCATTTCT14.166666666666666No Hit
ATATTAGACATGGTGCATAATAAGAATATACTGTCATAGCACTACCTTCC14.166666666666666No Hit
GGTATGCACAAAAAGACTGTGGTATAGAGTCTATGGCTTTCATTGAAGAA14.166666666666666No Hit
TCAATATGGAGAGAATAAAAGAACTGAGAGATCTAATGTCGCAGTCCCGC14.166666666666666No Hit
CAAAATGACCATCGTCAACATCCAAAGCACAATGCTGTTCCTGTTGATAT14.166666666666666No Hit
CTTCTCCCCTTTGCTGCTGCCCCACCAGAACAGAGTAGGATGCAATTTTC14.166666666666666No Hit
CCAGCGCCGGACCCCCTTGCCCCCCCGCGTTCGTCAGTGCCAGGCCGCTG14.166666666666666No Hit
CAGAATGAAGTGGATGATGGCAATGAGATACCCAATTACAGCAGACAAGA14.166666666666666No Hit
CCACTAAATGATGCAATCAAATGCATGAAGACATTCTTTGGCTGGAAAGA14.166666666666666No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.5)