FastQCFastQC Report
Sat 26 Sep 2020
HNCVFBGXG_n02_FD_S3_R1_A09.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHNCVFBGXG_n02_FD_S3_R1_A09.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences120
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC47

[WARN]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG21.6666666666666667No Hit
CAATATTGAGAGAATAAAAGAACTGAGAGATCTAATGTCGCAGTCCCGCA10.8333333333333334No Hit
GAAGAGGCAACACACTGCGCCTCGAAATCGAAACAGCCACTCTTGTTGGG10.8333333333333334No Hit
GGCGTAAATGCTAGAAAGAGAATTGGTCCGTAAAACAAGGTTTATCCCAG10.8333333333333334No Hit
CTTGTCCAGAGCTGTGATGCTGAGGGAAATGATCCAGAAAATTTTAGGTA10.8333333333333334No Hit
TACCACAGCATTGTTTACAGAATCAATCTCTTTATGACTGACAAAGGGAT10.8333333333333334No Hit
TTATAAAAGGAAGGTCTCATTTGAGAAATGATACTGATGTGACTTTCAGC10.8333333333333334No Hit
CTGTTCTGGTGGGGCAGCAGCAAAGGGGAGAAGTTTTATTATTTGGACAG10.8333333333333334No Hit
AAATAAGACAGGGACATTTGAATTCACAAGCTTTTTTTATCGCTATGGAT10.8333333333333334No Hit
CTGGCGACCCGAATGCACAATTAAACCACCGATTTGAGATAAATGATGGA10.8333333333333334No Hit
GAGCAGCAGTGTCAGCAGACCCATTAGGATCTCTCTTGGAAATGTGCCAC10.8333333333333334No Hit
CGCTGGAAAGCGCCTAACATAGTCAAACCCCATGAGAAAGGCATAAATCC10.8333333333333334No Hit
AAGTATTGAAGACCCGAGTCACGAGGGGGAGGGAATACCACTATATGATG10.8333333333333334No Hit
GTACAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN10.8333333333333334No Hit
GCTGACATGAGTATTGGAGTAACAGTGATAAAGAACAACATGATAAACAA10.8333333333333334No Hit
GACCTGCATGGTGGGGGTGATATTGGGAAGGGAGACACGTCAGATCCCCA10.8333333333333334No Hit
AACTTATACAATATACGGAATCTTCACATTCCTGAAGTCTGCTTAAAATG10.8333333333333334No Hit
GATCATTTGAGTTAAAGAAGCTGTGGGATCAAACCCAATCAAAGGTAGGG10.8333333333333334No Hit
TCCAAGGACAGATCACGGTCTGGCCTTCCCACACTCAAGTCGGTTAGAAT10.8333333333333334No Hit
TCCTCGAAGAGCACGCTGGAACTAGGGTCAATGTCCATAGACTCCGAGAC10.8333333333333334No Hit
AACAAAGAGGAAATAGAGATAACAACCCACTTTCAAAGAAAAAGGAGAGT10.8333333333333334No Hit
GGATTCAGGGGATTACAAAGTCTTCCCCGATAATCATCATCCATTAGCTC10.8333333333333334No Hit
ATGAAATCCTCCAGCTCCAGTGTCATCAATGACAGGAGCTCACATTTATG10.8333333333333334No Hit
AGCATGCTCATAACACAAGAGACAGGCATAAATCAAAAATACCACAAGTC10.8333333333333334No Hit
TCCTGGTCTCTTGAGGAGGTGGAACCACTGGCTGGGAGGGTGGGGGTGAC10.8333333333333334No Hit
AATGGGTCTGCTGACACTGCTGCTCTTCTTACTATGTTTCTAGCAGCGAT10.8333333333333334No Hit
GGTTGCCCGTTAGCACTTCTGCTTCTTTCGTGACTGATGATCCGCTGGTC10.8333333333333334No Hit
ATCAAAGGTAGGGCTATTAGTATCAGATGGAGGACCAAACTTATACAATA10.8333333333333334No Hit
GTCAAGGCCATGCATCGGTCTCTGAAGTCAATTAGCTCAAATCGGTGCTT10.8333333333333334No Hit
GTTCAAGCTTTTCGCAAATGCTCCTAGCTAAAGTTTCAACAAAGTATACG10.8333333333333334No Hit
CCTCGAATGTTCCTGGCGATGATTACATATATCACCAGAAATCAACCCGA10.8333333333333334No Hit
GGACTGGAGCCCAGAATGTGCTCTCTAATGCAAGGTTCAACACTTCCCAG10.8333333333333334No Hit
TATTTCAGAAATATAAAGACTGTGACATGATCAGACTTGAGCTTTAGAAA10.8333333333333334No Hit
CCTCCGATGAGGACCCCAACTGCATTTTTGACATCCTCATAAGTATGTCC10.8333333333333334No Hit
GATGTGATGTATCGTCCTCGGGCACTGGGGAAGTCTTGCCAGAGGAAAGC10.8333333333333334No Hit
ACTGGCAAATGTTGTGAGAAAGATGATGACTAATTCACAAGACACAGAGA10.8333333333333334No Hit
TCGTCAGTCAATGCCCCTGCATCCTTTCCAAGAACTGTATGTCGTTTGGT10.8333333333333334No Hit
CTTTATCTTAAGTACAGTCTAGAACAGAGACTAGCAAGCCACCGTCCGGA10.8333333333333334No Hit
GGTGAGCTTAGACCGATTCCTCTTGGGGCTCCAGGAATCTGTCGTAGCAA10.8333333333333334No Hit
CACCACGCCCCCTCAGATTGCGGGATGGGCCTCTTTGCCATCAGCGGTCA10.8333333333333334No Hit
CATTCTGAGGGGATCAGTTGCGCATAAGTCCTGCGTGGGGGGGTGGGGGT10.8333333333333334No Hit
AGTTTATCTACCCTTGTTTGTTGAACACCTTCCATTGTTTCAAGGCATGA10.8333333333333334No Hit
CTGCATGGCCAGGGTTTGTATCAACTCTCCTCCTTATTTTAACTTGATTT10.8333333333333334No Hit
GCTGATAGCCGCAGCAGCACAGGACGACCAAAGACTTCAGTGCTTTCTGG10.8333333333333334No Hit
TAGCCCTACCTTTGATTGGGTTTGATCCCACAGCTTCTTTAACTCAAATG10.8333333333333334No Hit
CCCACCCATTGTGAATTCTTCCTACCCTTCATGTACTCTTTTTTTCAGTG10.8333333333333334No Hit
GGTACTGGTTATGGTGAAGATTTCAGAAGCAAGCCTCTCTGGATGAGTAG10.8333333333333334No Hit
GTCTGGAGTAAATGAATCAGCTGACATGAGTATTGGAGTAACAGTGATAA10.8333333333333334No Hit
GTTATTTATCACTGTTACTAAAATACTAATGTCATCTGATTCATTTACTC10.8333333333333334No Hit
TTCACAAGCTTTTTTTATCGCTATGGATTTGTGGCTAATTTTAGCATGGA10.8333333333333334No Hit
ATGTTGTTCTTTATCACTGTTACTCCAATACTCATGTCAGCTGATTCATT10.8333333333333334No Hit
GGTTTAACTGATAGAGCTCAAAGCGGGACCGAACTTTTGTATCCCGAAGC10.8333333333333334No Hit
GGTTGATTTCTGGTGATATATGTAATCATCGCCAGGAACATTCGAGGATT10.8333333333333334No Hit
ATACAGAAAAGAGATAACATGATTTAAAAAAAAAAAAAAATAAAGCCATG10.8333333333333334No Hit
AATCAAAACTAGGCTTTTCACTATAAGACAAGAAATGGCCAGTAGGAGTC10.8333333333333334No Hit
CGGGGGGGGGGGGGGGCGCGGGGGGGTGCGGGGAGTCGAGTGCGGGGCGC10.8333333333333334No Hit
GTTATTAATTGCTGTACACCCAGCTCCCAGAACTGTGCCTGTACAGAGCA10.8333333333333334No Hit
GGGGGGGGGGGGGGGGGGGGTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG10.8333333333333334No Hit
GTATTCAATTACAACAAGGCAACCAAACGACTTACAGTTCTTGGAAAGGA10.8333333333333334No Hit
ATTTTGTGCTTTTTACATATTTTGGACATTTTCCAATTGTGATCGGATGT10.8333333333333334No Hit
TCCTACCTCAGCATGAGCACGTCACAGCTGATTGCAATCAGAGGGCGTGG10.8333333333333334No Hit
ACCCACCACCTTGTATAGTTCCAGGCCCACCAGGCCTGCCACCGCTGCGG10.8333333333333334No Hit
GCAGTGGGACACTTCTGCTGTAAAATAGTTCCTCCTCATGCTTGCGATAT10.8333333333333334No Hit
CTCTTATTTTCAGTGTTTGGAGGTTGCCCGTTAGCCCTTCTTCTTCTTTC10.8333333333333334No Hit
CTCCAGGAGGAGAAGTGAGAAATGAACATGTTGACCAAAGTTTGATTATC10.8333333333333334No Hit
CATTGAAGAAGGACGTAGCTACCAGGGCTAAACTTCGACTAAACAAGCTT10.8333333333333334No Hit
GACTTATGATTGGACATTAAACAGAAATCAACCGGCAGCAACTGCATTGG10.8333333333333334No Hit
TGATTACATATATCACCAGAAATCAACCCGAGTGGTTCAGAAACATCCTG10.8333333333333334No Hit
ATACAGTAATAGTAGGGGACTTTAATACACCACTTACATCAATGGATAGG10.8333333333333334No Hit
GGGTTTCGACTTTCTCTTACTTGATCCATCATTGCACTCTGGGCAGCTGT10.8333333333333334No Hit
AGGGAATACCACTTTATGGTGCAATCAAATGCATGAGGCCATTCTTTGGC10.8333333333333334No Hit
TTCTACCCTCATGGACGGCGGCCCGCCAGGCGTCGAAGGCCCGCTGGTCG10.8333333333333334No Hit
GTGCATGTGTGAGGAAGGAGTTGAACCAAGATGAATTAAGCAAAACCCAG10.8333333333333334No Hit
GTCTCCCCTATGGCACCTATATGTGTATCTGTAGTCTTTGATGAACAATT10.8333333333333334No Hit
GGCTGGCTCCGGGCAGGCAGCTCTTTCTAAAGACACAAGTGCCAGCCTGC10.8333333333333334No Hit
GAGTAAGGATGGTGGACATCCTTAGACAGAATCCAACTGAGGAACAAGCC10.8333333333333334No Hit
CCCTTGGCCTCGTTTTCGAAACAGCCACTCTTGTTGGGTGTCAAATCGTG10.8333333333333334No Hit
CTATATGATCTAATCAAATGCATGAAGACAATCTTTGGCTGGAAAGAGCC10.8333333333333334No Hit
CTATCAAGTTTGCTGCAATATGCTCACATTTGGATGTTTGTTTCTTGTAT10.8333333333333334No Hit
CCTGTAGGGGTTCATTATATAAGGAAGGTCTCTTGTGAGAAATGAGACTG10.8333333333333334No Hit
CGGAAAAGGCAATGAAAGAATATGGGGAAGATCCGAAAATCGAAACTAAC10.8333333333333334No Hit
CGCAGAGACTGGAAAGTGTCTTTGCAGGAAAGAACACAGATCTTGAGGCT10.8333333333333334No Hit
ATCTCTATTTCCTCTTTGTTCATTGATTCCATTACATCCTTTAAGAAATC10.8333333333333334No Hit
GCACCTGTGCACCTTTTTCCCCGCCAACCCCCATGAATCGAGCACCCTCA10.8333333333333334No Hit
GCTCTTATTAGATAGCCTCTCTTATTCAGTCTTTGTTTTTTCTTCCCTAT10.8333333333333334No Hit
GAACAATGAGAAGCAATTTTCTAGATTCAGCCGAAAACCCCTCAAGTTGT10.8333333333333334No Hit
GTCAGTAAGTATGCTAGAGTCCCGTTTTCGGTTCATTACCAACACTACGT10.8333333333333334No Hit
GTTTGAGCATTCACAGGCCACTAGAAGCCAATATGTGGCATTATTAAGAT10.8333333333333334No Hit
AGAAAAGCAGGGATGCCAATGGATTGAAAAAGAGTTATTTGAGCGTAATG10.8333333333333334No Hit
GTCCTAGGCTGGGGAGTCTGTTAGGCTGCCAGAGAGAAGCTTCCAAGAAT10.8333333333333334No Hit
GAGGTGGAACAATAGCAATGGAGTTAATCAGAATGATCAAACGTGGCATC10.8333333333333334No Hit
GGGGGAATTGTTGTATTTTAAAATAGGTTAAAAATAGTATGAGGCGCCGG10.8333333333333334No Hit
CTTTATGACTGACAAAGGGATTCAGGGGATTACAAAGTCTTCCCCGATAA10.8333333333333334No Hit
TTATAGGTGCCATGCTCAGGATGTTTCTGAACCACTCGGGTTGATTTCTG10.8333333333333334No Hit
GTCGGGCAGTATTCCGATCATTCCCATCCCATTGTCGATGGATTCAATTC10.8333333333333334No Hit
TCTCACAAGATTTGCCAGTTTGGCCTTGTTTTAATTGCCCCCTACTGGGA10.8333333333333334No Hit
GGACCTGCAAGTTAGTGGGAATCAACATGAGCAAAAAGAAGTCCTATATA10.8333333333333334No Hit
GCGGGAGCTGGATGCCCTGTCTCCCCTGTCTCAGGGGAGAGGCTGGACGC10.8333333333333334No Hit
GAGTGAGAACTCCATACTTACAAAGTTCACCACATCAGTATCATTTCTCA10.8333333333333334No Hit
GCTCAATGCATCCTGTGCAGCCATGGATGACTTTCAGCTGATCCCAATGA10.8333333333333334No Hit
CTCTTATCCCTCTCAGCGACATCTCCGTGCTTGGGGTCATGTCGGGCAGT10.8333333333333334No Hit
GCCGAACTGTTGGTTCTATTGGAAAATGAAAGAACTTTGGACTACCACGA10.8333333333333334No Hit
CTTCGGCCCTGTCCACTTCAGAACTCAAGTTAAAATAAGGAGGAGAGGTG10.8333333333333334No Hit
GGTTGCCTTAGGGACAAGAGACTGAAATGGTTCAAATTCCATTTTGTTGT10.8333333333333334No Hit
AGCTCCCATTTTAAGCAGACTTCAGGAATGTGAAGATTCCGTATATTGTA10.8333333333333334No Hit
CTGTTGAATACAGATTTTGCCAGTAAGGTCCTGCACACTTTCCCAATAGA10.8333333333333334No Hit
GCACAGTGGTGAGCAGAATATCTAACACAACAGGGGTAGAGACGCCTAAA10.8333333333333334No Hit
CTAATTGAGAGACTACATACCTACATTTAACAGTAACAGTATCCACAATG10.8333333333333334No Hit
GTTCCATAGCCTTTGCCGTAGTGCTAGCCAGCACCATTATGTTTTCATGA10.8333333333333334No Hit
TCACTCATGTATGGATGCCCAAGAAAAAATGTTGATACGTACGCCCTAGT10.8333333333333334No Hit
ATGTTTGACGTAGAAAATGCAATGACGCTTCAGGAAGGAGGGGACAGGGT10.8333333333333334No Hit
CTTGCTAGCATTTCTGCTGGTATTTGTGTTCGAATCTTCATTCTTTTACT10.8333333333333334No Hit
GCATAAATGTTATTTGTTCGAAACTATTCTCTGTCGCTTTCAATCTGTGC10.8333333333333334No Hit
ACTTATTCGTCATCAATGATGTGGGAGATCAATGGCCCTGAGTCAGTGCT10.8333333333333334No Hit
CCTCCAAACACTGAAAATAAGAGTACATGAAGGGTATGAAGAATTCACAA10.8333333333333334No Hit
CTATTAGACTAGAAATGGCCCGTAGGAGGCTATGGGATTCCTTTCGTCCG10.8333333333333334No Hit
GGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGTGGGGGGGGG10.8333333333333334No Hit
GTATATGTAACACAACAGGGGTAGAGAAGCCTAAATTTCTTCCTGATTTG10.8333333333333334No Hit
CACATATATTACCTAGAGAACGCCAACAAAATAAAATCTTAGAAGACACA10.8333333333333334No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers