FastQCFastQC Report
Sat 26 Sep 2020
HNCVFBGXG_n01_FD_S3_R2_H01.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHNCVFBGXG_n01_FD_S3_R2_H01.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC43

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GACCAAAGATGCAGAGAGAGGCAAGTTAAAAAGAAGGGCTATCGCAACAC14.166666666666666No Hit
CGACTGAACCCCATGCACCAACTCTTGAGGCATTTCCAAAAAGATGCAAA14.166666666666666No Hit
TGTCACCTCTGACTAAGGGAATTTTAGGATTTGTGTTCACGCTCACCGTG14.166666666666666No Hit
CTCCTATTTCAAGAACACAGTATTTTTCCCATTTGTGTGGCTCCAGTCTC14.166666666666666No Hit
CAATGGAAGTTGTTCAACAAACAAGGGTAGATAAACTAACTCAAGGTCGC14.166666666666666No Hit
ATTTTACAATCCTGGAGCTCTTCTTTCTTCTCTTTTGTTATTGCCAGCTG14.166666666666666No Hit
ATATGATGCAATCAAATGCATGAAGACATTCTTTGGCTGGAAAGAGCCTA14.166666666666666No Hit
GAGTACATGAAGGGTATGAAGAATTCACAATGGTTGGGAGAAGAGCAACA14.166666666666666No Hit
CTATGAGAGCAAAAACGTGCCATGATTGGAGCCCATGCCACCACAATAAT14.166666666666666No Hit
CTCCAAAGCTGGGTAGCTCCATGCTAAAATTAGCCACAAATCCATAGCGA14.166666666666666No Hit
CCATACCGTCCATTTGGGCAGAGGGTTGAGCTTTACTACTTCTACTTCAG14.166666666666666No Hit
GTCCTCCGATGAGGACCCCAACTGCATTTTTGACATCCTCATAAGTATGT14.166666666666666No Hit
CTTCACTACCTCCAGAGCAGAAATGAAAAGTGGCGAGAGCAATTGGGACA14.166666666666666No Hit
TGTTTCTACTAATAACCCGAGTAGAAACAAGGGTGTTTTTTATCATTAAA14.166666666666666No Hit
CGTCTGGCATGGGCACTGAGGGCTGGGTGAACGCTAGCTACTGCTGTTTT14.166666666666666No Hit
GTGAAAAGCCTAGTTTTGATTCTTGCCCTGCTCTCTTCGTCAAGGGTGTA14.166666666666666No Hit
GTGGAATAGCAATGGCCCAACAACAACTACAGTTCATTACCCTAAGGAAT14.166666666666666No Hit
CTTTGAAAGTGGGTTGTTATCTCTATTTCCTCTTTGTTCATTGATTCCAT14.166666666666666No Hit
GGCCAGAGTGAACCCAATCCAGTCCTCAGGCCCGCTGAAGAAGGTCTAGC14.166666666666666No Hit
GTGTGCAGGACCTTACTGGCAAAATCTGTATTCAACAGTCTATATGCGTC14.166666666666666No Hit
GCATTGTTTACAGAATCAATCTCTTTATGACTGACAAAGGGATTCAGGGG14.166666666666666No Hit
AGTATGTCCTGGAAGAGAAGGTAATGGTGAAATTTCTCCAACTATTGCTC14.166666666666666No Hit
GAGTAAGAGACAACATGACCAAGAAGATGGTCACGCAAAGAACAATAGGG14.166666666666666No Hit
AGTTGTGGAGACGCATATAGACTGTTGAATACAGATTTTGCCAGTAAGGT14.166666666666666No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.5)