FastQCFastQC Report
Fri 2 Oct 2020
HNCVFBGXG_n01_FD_S3_R2_C10.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameHNCVFBGXG_n01_FD_S3_R2_C10.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences15
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC44

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CCCTTATACTGGAGATCCTCCATACAGCCATGGAACAGGAACAGGATACA16.666666666666667No Hit
GGGTAGCTCCATGCTAAAATTAGCCACAAATCCATAGCGATAAAAAAAGC16.666666666666667No Hit
GTGTAGTTGCAACGGCATCATATTCCATGCTTTTGGCTGGACCATGGGCT16.666666666666667No Hit
GTCATAAAGAGATTGATTCTGTAAACAATGCTGTGGTAATGCCAGCCCAT16.666666666666667No Hit
CCTTTGGCTTGTGTTGAGAATAGAACGATTCCTCTTGGGAATCCAGGAAT16.666666666666667No Hit
ACTTTGTGCGACAATGCTTCAATCCAATGATCGTCGAGCTTGCGGAAAAG16.666666666666667No Hit
CTCATAGTGAATGCACCAAACCATGAGGGAATACAAGCAGGAGTGGACAG16.666666666666667No Hit
ACCCAGGGATCATTAATCATGCACTCCTCGATTGCTTCATATAGCCCCCC16.666666666666667No Hit
AGACTGTTGAATACAGATTTTGCCAGTAAGGTCCTGCACACTTTCCCAAT16.666666666666667No Hit
ATATAAATAAGACAGGGACATTTGAATTCACAAGCTTTTTTTATCGCTAT16.666666666666667No Hit
AAACAGAACACACCAATACTCAGAAAAGGGAAAGTGGACGACAAACACAG16.666666666666667No Hit
GGATAATGAACCAAGTGGGTATGCACAAACAGACTGTGTTCTAGAGGCTA16.666666666666667No Hit
TTCTTGATCCGTCCAGACTCGAAGTCGACCCTGGCATCAATCCGGGCCCT16.666666666666667No Hit
GTCTTGTGAATTAGTCATCATCTTTCTCACAACATTTGCCAGTTTGGCCT16.666666666666667No Hit
GGTACATCTGTTCATCCTCAAGAATTCCCCTTTGGCTTGTGTTGAGAATA16.666666666666667No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.5)